Hidrogenáz enzimek szabályozó szerepe a hidrogenotróf metanogének metán termelésében  részletek

súgó  nyomtatás 
vissza »

 

Projekt adatai

 
azonosító
123902
típus FK
Vezető kutató Bagi Zoltán
magyar cím Hidrogenáz enzimek szabályozó szerepe a hidrogenotróf metanogének metán termelésében
Angol cím The role of the hydrogenase enzymes in the methane production of hydrogenotrophic methanogens
magyar kulcsszavak hidrogén, hidrogenáz, hidrogenotróf, metanogén, metán
angol kulcsszavak hydrogen, hydrogenase, hydrogenotroph, methanogen, methane
megadott besorolás
Mikrobiológia: virológia, bakteriológia, parazitológia, mikológia (Orvosi és Biológiai Tudományok Kollégiuma)70 %
Molekuláris Biológia (Orvosi és Biológiai Tudományok Kollégiuma)30 %
Ortelius tudományág: Molekuláris biológia
zsűri Immun-, Tumor- és Mikrobiológia
Kutatóhely Biotechnológiai Tanszék (Szegedi Tudományegyetem)
résztvevők Kakuk Balázs
Szuhaj Márk
projekt kezdete 2017-09-01
projekt vége 2021-02-28
aktuális összeg (MFt) 29.843
FTE (kutatóév egyenérték) 4.88
állapot lezárult projekt
magyar összefoglaló
A kutatás összefoglalója, célkitűzései szakemberek számára
Itt írja le a kutatás fő célkitűzéseit a témában jártas szakember számára.

Az anaerob biodegradáció, és a folyamat során keletkező biogáz a szerves hulladékok kezelésének egyik legígéretesebb módja. A metanogén törzsek egyedi metabolizmussal rendelkeznek, képesek a hidrogént és szén-dioxidot, formátot, metilált C1 komponenseket, acetátot felhasználni szén és energia forrásként növekedésükhöz. Korábbi méréseink bebizonyították, hogy a hidrogénnek fontos szerepe van az anaerob lebontási folyamatban. A metanogének biológiai aktivitása nagy mennyiségű hidrogént igényel, hogy a redox reakcióik megfelelően le tudjanak zajlani. A hidrogénből és szén-dioxidból történő metán képzés első lépését a formilmetanofurán-dehidrogenáz enzim végzi a hidrogenotróf metanogének csoportjában. Egyéb hidrogenáz enzimek is jelen vannak metanogén törzsekben, mint az F420-redukáló hidrogenáz, a F420-nemredukáló hidrogenáz, az Ech hidrogenáz, valamint a F420 H2 dehidrogenáz. Ez az élővilágban egyedülálló rendszer az evolúció korai szakaszán alakult ki de mai is sikeresen működik. A redox rendszerek az életműködés molekuláris alapjainak meghatározó elemei. A komponenseiben egyszerű, működésében sokkal bonyolultabb redox folyamatok megismerése az alapvető életfolyamatok megértéséhez járulhat hozzá eredményesen. A munka célja meghatározni a hidrogén szabályozó szerepét a biogáz képző rendszerekben résztvevő mikrobák életfolyamataiban és bioenergetikai egyensúlyaiban, vizsgálni a hidrogenáz enzimek génjeinek kifejeződését eltérő körülmények között, valamint új generációs szekvenáló rendszer segítségével vizsgálni tiszta kultúrában és a természetes mikroba közösségekben növesztett metanogén sejtek expressziós profilját.

Mi a kutatás alapkérdése?
Ebben a részben írja le röviden, hogy mi a kutatás segítségével megválaszolni kívánt probléma, mi a kutatás kiinduló hipotézise, milyen kérdéseket válaszolnak meg a kísérletek.

A kutatás fő alapkérdése, hogy a hidrogén milyen szabályozó szerepet játszik a metanogén mikrobák metán termelésében és bioenergetikai anyagcsere folyamataiban. Korábbi kutatási eredményeink alapján tudjuk, hogy a metanogén törszek metán termelésében kulcsszerepet játszik a rendelkezésükre álló hidrogén mennyisége. A hidrogén hasznosításért felelős enzimek a hidrogenázok. A hidrogenáz enzimeket kódoló gének kifejeződését befolyásoló körülmények feltárása új és fontos tudományos alapkutatási eredményekkel és emellett a gyakorlatban is hasznosítható ismertekkel gazdagíthatja tudásunkat. A metanogének energia háztartásának molekuláris szerveződése és szabályozása fontos bioenergetikai elvek tisztázásához vezet várakozásaink szerint.

Mi a kutatás jelentősége?
Röviden írja le, milyen új perspektívát nyitnak az alapkutatásban az elért eredmények, milyen társadalmi hasznosíthatóságnak teremtik meg a tudományos alapját. Mutassa be, hogy a megpályázott kutatási területen lévő hazai és a nemzetközi versenytársaihoz képest melyek az egyediségei és erősségei a pályázatának!

Korábbi kutatási eredményeink megmutatták, hogy – ha megismerjük a folyamat egyes sebesség meghatározó lépéseinek szerepét, ami esetünkben a rendszerben termelődő hidrogén mennyisége volt – a közösség élete befolyásolható és a biogáz termelés serkenthető. A korábbi kutatásaink jelentőségét abban látjuk, hogy kísérletesen bebizonyosodott: lehetséges a mikroba közösség életébe kívülről, mikrobiológiai, biotechnológiai megközelítéssel úgy beavatkozni, hogy a “spontán” kialakult közösség gyorsabban alakítja át a biomasszát biogázzá. A közelmúltban elvégzett metagenomikai vizsgálatok utólag megerősítették, hogy a hidrogént hasznosító hidrogenotróf metanogéneknek valóban sokkal nagyobb szerepük van a biogáz termelésben, mint korábban gondolták. A hidrogén szabályozó szerepe a biogáz termelő rendszerekben eddig igen kevéssé vizsgált, a gyakorlatban is hasznosítható eredményeink alapvetően empírikus megfigyelésekre épültek. A tervezett vizsgálatok segítségével megérthetjük a hidrogén szabályozó szerepét a metanogén mikrobák metán képzésében és új utakat tárhatunk fel az anaerob mikrobiológiai eseményeket meghatározó redox folyamatok molekuláris szintű szabályozásának megértésében. A kísérletek eredményei segítenek tisztázni a metanogén törzsek membránkötött enzimei által katalizált elektron transzport lánc működését.
Az utóbbi időben a megújuló forrásokból, elsősorban a szél és fotovoltalikus alapon történő elektromos energia előállítás, hazánkban is előtérbe került. Az elektromos hálózat nem rendelkezik pufferkapacitással, az elektromos energia nem tárolható, az esetleges ingadozásokat a rendszer kevésbé tolerálja. Egy lehetséges megoldás a “power to gas” elv használata. Az elektromos áram felhasználásával vízbontás segítségével hidrogén állítható elő, mely biogáz fermentorban metánná alakítható. A metán jól tárolható, a földgázvezetékben szállítható és minden olyan célra felhasználható, melyre a földgáz alkalmas. A hidrogén hatékonyabb átalakításhoz szükséges ismernünk az azt felhasználó mikrobák hidrogenáz enzimeinek működését, melynek ismeretében a metán hozam maximalizálható. Az elméleti, felfedező kutatási eredmények így hamarosan gyakorlati hasznosításban is érvényesíthetőek lesznek.

A kutatás összefoglalója, célkitűzései laikusok számára
Ebben a fejezetben írja le a kutatás fő célkitűzéseit alapműveltséggel rendelkező laikusok számára. Ez az összefoglaló a döntéshozók, a média, illetve az érdeklődők tájékoztatása szempontjából különösen fontos az NKFI Hivatal számára.

Széles körben ismert, hogy a világ környezetvédelmi problémákkal küzd a globális klímaváltozás miatt, ezért egyre nagyobb szükség van tehát a megújuló energiahordozókra. Ezek közül kiemelkedik a biogáz termelés, amely egyszerre képes a környezetszennyező hulladékok, melléktermékek ártalmatlanítására és egy sokoldalúan hasznosítható energiahordozó, a magas metántartalmú biogáz előállítására. A levegőtől elzárt környezetben spontán kialakuló, több száz különféle mikrobából álló közösségek viszonylag alacsony hatékonysággal termelik a biogázt, ezért a technológia ma még önmagában ritkán versenyképes. A biomassza átalakítását végző mikroba közösségekről kevés ismeret áll a rendelkezésünkre, mert a klasszikus mikrobiológiai módszerekkel ilyen bonyolult rendszerek nehezen vizsgálhatók. A modern molekuláris biológiai technikák rohamosan fejlődnek, segítségükkel megismerhetjük a mikroba közösségek tagjait, a biogáz termelésének folyamatában szerepet játszó enzimeket. Ebből a közösség egészének összetett működésére vonatkozó információkat nyerhetünk. A kutatásban biogáz termelő mikrobákat, mikroba közösségeket tanulmányozunk, ezért a megszerzett tudományos ismeretek rövid úton gyakorlati hasznosítást is nyerhetnek. Ezeket a hasznosítási lehetőségeket ma még azért nem tudjuk kihasználni, mert nem ismerjük pontosan azokat a meghatározó biokémiai, molekuláris biológiai folyamatokat, amelyek a reakciósort limitáló metanogénekben zajlanak le. A metanogének hidrogén anyagcseréje az élővilágban egyedi folyamatok, amelyek működésének és szabályozásának tisztázása a bioenergetika alapkérdéseinek megválaszolásához járulhat hozzá.
angol összefoglaló
Summary of the research and its aims for experts
Describe the major aims of the research for experts.

Anaerobic digestion (AD) with concomitant biogas production is an environmentally attractive technology for the treatment of organic waste. Methanogenic archaea have an unusual type of metabolism because they use hydrogen and carbon-dioxide, formate, methylated C1 compounds, or acetate as energy and carbon sources for growth. The methanogens produce methane as the major end product of their metabolism in a unique energy-generating process. Our previous studies demonstrated that hydrogen has an important role in the anaerobic digestion process. The biological activity of methanogens requires a good supply of hydrogen to carry out the redox reaction. The series of reactions involved in methane formation from hydrogen and carbon-dioxide are initiated by the formylmethanofuran dehydrogenase enzyme which is found int the group of hydrogenotrophic methanogens. Other hydrogenases are found in the H+ translocating system of the methanogens, like F420-reducing hydrogenase, F420-nonreducing hydrogenase, Ech hydrogenase, F420H2 dehydrogenase. This unique system was developed in the early phase of the evolution, but it still works properly. The redox systems are one of the main components of the molecular systems in archaeal and bacterial cells. Investigation of the redox reactions help us to understand the basic life pocesses. Our goal is to determine the regulatory role of the hydrogen in a biogas forming system, examining the expression level of the hydrogenase genes under different conditions. In pure cultures the expression profile of the cells will be investigated with next generation sequencing method.

What is the major research question?
Describe here briefly the problem to be solved by the research, the starting hypothesis, and the questions addressed by the experiments.

The central question to be answered in the planned research program is the regulatory role of the hydrogen in methane formation and in the bioenergetical metabolic pocesses in methanogenic strains. Our previous studies demonstrated that hydrogen has an important role in the activity and methane production of the hydrogenotrophic methanogens. The key enzymes in the hydrogen conversion are the hydrogenases. The exploration of the biochemical details, which affect the expression of the hydrogenase genes will increase our knowledge of the basic research events involved. The results will also be exploited in improving biogas production efficiency. The molecular organization and regulation of the energetical system in methanogenic strains helps us to clear up main bienergetical principles.

What is the significance of the research?
Describe the new perspectives opened by the results achieved, including the scientific basics of potential societal applications. Please describe the unique strengths of your proposal in comparison to your domestic and international competitors in the given field.

Earlier studies conducted in our laboratory demonstrated that identification of certain rate limiting steps, which was the availability of hydrogen in our case, in the overall process the community performance can be improved and biogas production can be intensified by applying relatively simple biotechnological measures. Our papers published in the scientific literature were recognized by the expert community and the patent filed has been acquired by one of the largest international biogas companies. The importance of these previous studies is in providing experimental evidence for the rational intervention and making the microbial community able to decompose biomass faster than the biogas generating “spontaneous” microbial population. Incidentally, recent metagenomic results corroborated the importance of hydrogen consuming hydrogenotrophic methanogens in biogas formation. The precise regulatory role of the hydrogen has not been examined in a biogas forming natural consortium. The results of the planned study help us to understand the regulatory role of the hydrogen in the methane formation of methanogens, and it is possible that discover new molecular pathways in the regulation of the redox systems in anaerob microbes. The result of the experiments help us to understand the redox reactions as catalyzed by the membrane-bound electron transport chains coupled to proton translocation across the cytoplasmic membrane.
Throughout the world renewable electricity production, primarily form wind and photovoltaic conversion, is increasing rapidly. The electricity grid being not flexible enough to buffer the fluctuations in the input renewable electricity as environmental conditions change. One possible solution is the introduction of the “power to gas” principle. This comprises the conversion of electricity, which is difficult to store, in the well-known water electrolysis process and then conversion of the produced hydrogen to methane in anaerobic digesters. Methane is conveniently stored and transported in the natural gas grid system. For the most efficient conversation of hydrogen we have to investigate the enzymes involved in the conversation of hydrogen to methane to maximize the methane production.

Summary and aims of the research for the public
Describe here the major aims of the research for an audience with average background information. This summary is especially important for NRDI Office in order to inform decision-makers, media, and others.

It is widely recognized that environmental problems are accumulating as a result of global climate change due to the excessive use of fossil fuels. The fossil fuel prices are rising due to depleting resources. These considerations call for renewable energy carriers. Biogas is one of them, its outstanding property is the combination of elimination of organic waste with the production of a gas that eventually can be used in all areas we utilize fossil natural gas today. Biogas can be made from almost any kind of biomass and the decomposition of the substrates is done by an array of various beneficial microbes under anaerobic (air excluded) conditions. The process works with a modest efficacy, which renders biogas production economically not yet competitive. Little is known about the fine details of the relationships among members of the community thus the system is understood only in a broad sense. This is mostly due to the limitations of the toolbox of classical microbiology. The modern molecular methods develop rapidly and recent progress helps us to investigate complicated systems with high resolution, such as those leading to biogas formation. The new techniques allow the expansion of our knowledge by providing hitherto unexplored information. We selected biogas producing microbial strains, microbe communities for our studies hence the know-how obtained from this work can also be directly applied in large-scale facilities.





 

Zárójelentés

 
kutatási eredmények (magyarul)
A kutatási eredmények megmutatták, hogy az autotróf metanogének esetében a H2/CO2 hatékony regulátora a metán szintézisnek. A H2/CO2 hiánya a sejt teljes metabolikus rendszerére hatással van, ezek nélkül a sejtek szinte teljes mértékben “kikapcsolnak”. Ez igazolja, hogy a H2/CO2 szabályozza a sejtek teljes metabolizmusát, a sejtek redox rendszerén keresztül a fő energia termelő és felhasználó útvonalakat is. Azokban a metanogénekben, amelyek képesek az ecet- és hangyasavat is felhasználni szén és redukáló erő forrásként a H2/CO2 nem elengedhetetlen az aktív metabolizmushoz. Ez azt jelenti, hogy a Power to Gas rendszerekben aktivitásuk nem szabályozható kizárólag H2/CO2-al, szerepük elsősorban az ecet- és hangyasav metánná történő átalakításában van. Metatranszkriptom analízist is végeztünk kevert mikroba közösségekkel, hogy meghatározzuk azokat a géneket, melyek kifejeződésére a H2 hatással van. Az eredmények azt mutatták, hogy a H2 jelenlétére a közösség igen gyorsan reagált, valamint az archeákon kívül számos baktérium törzs metabolikus aktivitása is jelentősen megváltozott válaszul a H2-re. Mindez azt mutatja, hogy a H2 nem csak a metanogenezisen szerepet játszó génekre van hatással, hanem az egész mikroba közösség expressziós profiljára, vagyis a H2 nagyobb jelentőséggel bír a kevert anaerob mikroba populációk életében, mint az korábban feltételezett volt.
kutatási eredmények (angolul)
The results of the experiments demonstrated that in autotrophic methanogens H2/CO2 is sufficient regulator of methane biosynthesis. The entire metabolism of these methanogens is affected, in the absence of H2/CO2 the microbes are practically completely “switched off”. This indicates that H2/CO2 regulates the entire metabolism, probably via generalized redox regulation of the main energy production and utilization pathways. In methanogens that can also utilize acetate/formate as carbon and reductant source, H2/CO2 is not indispensable for active metabolism. This means that they cannot be “switched-on and switched-off”, by using H2/CO2 as the single regulatory element in the Power-to-Gas process. These methanogens seem outstandingly suitable for converting acetate/formate to biomethane. This may offer a bypass to avoid the obstacle of extremely low solubility of H2, which limits the efficacy of the Power-to-Gas process. Metatranscriptomic analyses have been carried out to determine the changes of the expression levels of the different genes take part in the methanogenesis. The results indicated that the microbial community responded instantaneously to the presence of H2. Tthe metabolic activity of numerous bacterial strains changed substantially as a response to H2. Clearly, the excess H2 does not only affect the methanogenesis pathways in Archaea, rather the microbial community respond with a complete gene expression profile change, which seems to be rather selective.
a zárójelentés teljes szövege https://www.otka-palyazat.hu/download.php?type=zarobeszamolo&projektid=123902
döntés eredménye
igen





 

Közleményjegyzék

 
Norbert Ács, Márk Szuhaj, Roland Wirth, Zoltán Bagi, Gergely Maróti, Gábor Rákhely, Kornél L., Kovács: Microbial Community Rearrangements in Power-to-Biomethane Reactors Employing Mesophilic Biogas Digestate, Frontiers in Energy Research, 2019
Márk Szuhaj, Norbert Ács, Gábor Rákhely, Zoltán Bagi, Kornél L. Kovács: Utilization of fermentation residue for biogas upgrading with H2, II. Sustainable Raw Materials Conference Book, 2019
Balázs Kakuk, Zoltán Bagi, Gábor Rákhely, Gergely Maróti, Roland Wirth, Dénes Dudits, Péter Kós, Dorothea Rajtik, Kornel L. Kovács: Metagenomic insights into the continuous anaerobic digestion of biomass from early harvest of short rotation coppie willow, II. Sustainable Raw Materials Conference Book, 2019
Norbert Ács, Márk Szuhaj, Roland Wirth, Zoltán Bagi, Gergely Maróti, Gábor Rákhely, Kornél L., Kovács: Microbial Community Rearrangements in Power-to-Biomethane Reactors Employing Mesophilic Biogas Digestate, Frontiers in Energy Research, 2019
Roland Wirth, Bernadett Pap, Dénes Dudits, Balázs Kakuk, Zoltán Bagi, Prateek Shetty, Kornél L. Kovács, Gergely Maróti: Genome-centric incestigation of anaerobic digestion using sustainble second and third generation substrates, Journal of Biotechnology (submitted manuscript), 2021
Balázs Kakuk, Roland Wirth, Gergely Maróti, Márk Szuhaj, Gábor Rákhely, Krisztián Laczi, Kornél L. Kovács, Zoltán Bagi: Early response of methanogenic archaea to H2 as evaluated by metagenomics and metatranscriptomics, Microbial Cell Factories (submitted manuscript), 2021
Márk Szuhaj, Zoltán Bagi, Kornél L. Kovács: A “Power-to-Gas” és kapcsolódó biogáz tisztítási biotechnológiai eljárások., Energiagazdálkodás, 2019
Márk Szuhaj, Roland Wirth, Gergely Maróti, Balázs Kakuk, Gábor Rákhely, Kornél L. Kovács, Zoltán Bagi: Pangenomic reconstitution and exploration of H2 metabolic pathways in methanogens., manustript, ready for submission, 2021
Roland Wirth, Gyula Kádár, Balázs Kakuk, Gergely Maróti, Zoltán Bagi, Árpád Szilágyi, Gábor Rákhely, József Horváth, Kornél L. Kovács: The planktonic core microbiome and core functions in the cattle rumen by next generation sequencing, Frontiers of Microbiology, 2018
Márk Szuhaj, Roland Wirth, Gábor Rákhely, Kornél L.Kovács, Zoltán Bagi: Sustainable Thermophilic Power-to-Biogas systems, International Conference on Anaerobic Digestion konferenciakiadvány, 2018
Zoltán Bagi, Márk Szuhaj, Balázs Kakuk, Gábor Rákhely, Kornél L. Kovács: The regulatory role of the hydrogenase enzymes in the methane production of hydrogenotrophic methanogens, International Conference on Anaerobic Digestion konferenciakiadvány, 2018
Zoltán Bagi, Márk Szuhaj, Balázs Kakuk, Gábor Rákhely, Kornél L. Kovács: The role of the hydrogen in the formation of methane in methanogens, II. Sustainable Raw Materials Conference Book, 2019





 

Projekt eseményei

 
2017-10-18 10:19:40
Résztvevők változása
2017-08-08 12:53:48
Résztvevők változása




vissza »