Investigation of plant pathogens causing decline in fruit tree plantations by molecular biology methods  Page description

Help  Print 
Back »
 

Details of project

  
Identifier
127951
Type K
Principal investigator Várallyay, Éva
Title in Hungarian Gyümölcsfapusztulásokért felelős kórokozók vizsgálata molekuláris biológiai módszerekkel
Title in English Investigation of plant pathogens causing decline in fruit tree plantations by molecular biology methods
Keywords in Hungarian növénykórtan, metagenomika, fitoplazma, vírus, fapusztulás
Keywords in English plytopathology, metagenomics, phytoplasma, virus, decline of orchards
Discipline
Plant pathology, molecular plant pathology (Council of Complex Environmental Sciences)100 %
Panel Complex agricultural sciences
Department or equivalent Növényvédelmi Intézet (MATE) (Hungarian University of Agriculture and Life Sciences)
Participants Baráth, Dániel
Fákó, Vivien
Miloro, Fabio
Nagyné Galbács, Zsuzsanna
Preininger, Éva
Szabó, Luca Krisztina
Starting date 2018-09-01
Closing date 2023-11-30
Funding (in million HUF) 48.000
FTE (full time equivalent) 6.68
state running project





 

Final report

  
Results in Hungarian
Kutatásunk során az ország különböző részein található kajszibarack-, őszibarack-, alma-, cseresznye- és meggyültetvényeket viromját határoztuk meg, a csoport által optimalizált kis RNS HTS módszerrel. Ennek eredményeként nemcsak az országban ismert, ezeket a fajokat tudottan fertőző vírusokat találtuk meg, hanem 8 olyan vírust és 2 olyan viroidot is, amelyek jelenlétét Magyarországon, vagy a vizsgált növényen még nem írták le: a nektarin stem pitting asszociált vírust, őszibarack luteovirust és őszibarack látens mozaik viroidet őszibarackban, a Citrus concave gum asszociált vírust, az alma luteovirust, az alma rubbery wood asszociált vírust és az alma hammerhead viroidot almában, a cseresznyevírus A-t, a Prunus virus F-et cseresznéyben és meggyben, és a Prunus virus I-t Clematisban. A kimutatott vírusok szekvenciáinak filogenetikai elemzése arra utal, hogy a fertőzés fő forrása a szaporítóanyag. A fitoplazmával fertőzött modellnövények és gyümölcsfák metagenomikai vizsgálata azt mutatta, hogy a tünetek általában korreláltak a fitoplazma jelenlétével és koncentrációjával, és nem mutattak összefüggést a vírusok, baktériumok és gombák jelenlétével. A pályázat eredményeként 8 angol és 2 magyar nyelvű közleményt publikáltunk. Nemzetközi konferenciákon 4, országos konferenciákon 13 szóbeli előadást tartottunk, nemzetközi konferenciákon 7, országos konferenciákon 4 posztert mutattunk be. A projekt 1 DSc, 1 PhD, 1 posztgraduális, 4 MSc és 2 BSc dolgozatot támogatott.
Results in English
Apricot, peach, apple, cherry and sour cherry orchards at different part of the country were surveyed, and their viromes using small RNA HTS, which method was optimised. As a result, we found not only viruses known to be present in the country and infecting these species, but 8 viruses and 2 viroids which presence in Hungary, or not even on the investigated plant had been described: Nectarine stem pitting associated virus, peach luteovirus and peach latent mosaic viroid in peach, Citrus concave gum associated virus, apple luteovirus, apple rubbery wood associated virus and apple hammerhead viroid in apple, cherry virus A, Prunus virus F in cherry and sour cherry, Prunus virus I in Clematis. Phylogenetic analysis of the sequences of the detected viruses suggest that the main source of the infection is the propagation material. Metagenomic investigation of phytoplasma infected model plants and fruit trees showed that the symptoms usually correlated with the phytoplasma presence and concentration, no correlation was found between the presence of viruses, bacteria and fungi and the decline or symptoms on the tree. As a result, we published 8 papers in English and 2 papers in Hungarian. We had 4 oral presentations at international, and 13 at national conferences, presented 7 posters at international and 4 at national conferences. The project supported 1 DSc, 1 PhD, 1 postgraduate, 4 MSc and 2 BSc thesises.
Full text https://www.otka-palyazat.hu/download.php?type=zarobeszamolo&projektid=127951
Decision
Yes





 

List of publications

  
Yuri Zambon, Nicoletta Contaldo, Assunta Bertaccini, Eva Varallyay: Small RNA profiling of aster yellows infected Catharanthus roseus plants., Phytopathogenic Mollicutes, vol9, no1, 2019
Salamon, P.; Nagyne-Galbacs, Z.; Demian, E.; Achs, A.; Alaxin, P.; Predajňa, L.; Agyemang, E.D.; Desiderio, F.; Takacs, A.P.; Menzel, W.; Skoric, D.; Glasa, M.; Varallyay E.: Clematis vitalba Is a Natural Host of the Novel Ilarvirus, Prunus Virus I., Viruses, 2023
Jaksa-Czotter, N., Nagyné Galbács, Z., Jahan, A., Demián, E., Várallyay, É.: Viromes of Plants Determined by High-Throughput Sequencing of Virus-Derived siRNAs, Viral Metagenomics. Methods in Molecular Biology, vol 2732, 2023
Contaldo, N.; Zambon, Y.; Galbacs, Z.N.; Miloro, F.; Havelda, Z.; Bertaccini, A.; Varallyay, E.: Small RNA Profiling of Aster Yellows Phytoplasma-Infected Catharanthus roseus Plants Showing Different Symptoms., Genes 2023, 14, 1114., 2023
Várallyay, E.; Přibylová, J.; Galbacs, Z.N.; Jahan, A.; Varga, T.; Špak, J.; Lenz, O.; Fránová, J.; Sedlák, J.; Koloniuk, I.: Detection of Apple Hammerhead Viroid, Apple Luteovirus 1 and Citrus Concave Gum-Associated Virus in Apple Propagation Materials and Orchards in the Czech Republic and Hun, MDPI Viruses 2022, 14, 2347. https://doi.org/10.3390/v14112347, 2022
Nagyné Galbács Zsuzsanna, Almash Jahan, Várallyay Éva: Újonnan felfedezett vírusok és viroid jelenlétének felmérése magyarországi almaültetvényeken, Növényvédelem, 83 [N.S.58]:11, 473-483., 2022
Koloniuk, I.; Matyášová, A.; Brázdová, S.; Veselá, J.; Přibylová, J.; Várallyay, E.; Fránová, J.: Analysis of Virus-Derived siRNAs in Strawberry Plants Co-Infected with Multiple Viruses and Their Genotypes., Plants 2023, 12, 2564. https://doi.org/10.3390/plants12132564, 2023
Almash Jahan, Zsuzsanna Nagyne Galbacs, Eva Várallyay: Unveiling viruses and viroid in apple germplasm and orchards in Hungary using high throughput sequencing, Book of Abstract, 25th International Conference of ICVF, 2023
Desiderio, Francesco, Galbács Nagyné, Zsuzsanna, Várallyay, Éva: Investigating the presence and distribution of PrVF in Hungarian sour and sweet cherry., Book of Abstract, 25th International Conference of ICVF, page 52, 2023
Francesco Desiderio, Zsuzsanna Nagyné Galbács, Éva Várallyay: Prunus virus F is widespread in Hungarian sour cherry orchards., Book of abstract International ADvances in Plant Virology 2022, page 78, 2022
Francesco Desiderio, Zsuzsanna Nagyné Galbács and Éva Várallyay: New player in the field: Prunus virus F is present and spread in Hungarian cherry orchards, Program of the XXXII. Keszthelyi Növényvédelmi Fórum, 2023
Francesco Desiderio, Zsuzsanna Nagyné Galbács, Éva Várallyay: The detection of Prunus virus F and its distribution in Hungarian sour cherry orchards, The abstarct book of MADOSZ Conference, 2023
Pál Salamon, Evans Duah Agyemang, Francesco Desiderio, Emese Demian, Zsuszsanna Nagyné-Galbács, Andras Takacs, Eva Varallyay: Clematis vitalba is an alternative host plant of Prunus virus I., Book of Abstract, 25th International Conference of ICVF, page 59, 2023
Luca Krisztina Szabó, Francesco Desiderio, Éva Preininger,, Éva Várallyay: The effect of in vitro chemotherapy and heat treatment used for virus elimination from stone fruit species., FIBOK 2022 április 11-12, Gödöllő, Hungary, 2022
Evans Duah Agyemang, Francesco Desiderio, Emese Demian, Andras Takacs, Pal Salamon, Eva Varallyay:: Egy cseresznyét fertőző vírus kimutatása tünetes iszalagon., XXXI. Keszthelyi Növényvédelmi Fórum, 2022. január 19-21, 2022
Daniel Barath, David Czako, Rozalia Zsovakne-Hangyal, Tunde Varga, Aliz Furton, Mohammad Omran, Klara Nyerges and Eva Varallyay: Comparison of biotest and smallRNA NGS as a virus diagnostics method on fruit trees., abstract book Final Meeting of COST-DIVAS Action: HTS Technologies for the study and diagnostic of plant viruses, Liège (Belgium) 26th to 30th November 2018., 2018
BARÁTH DÁNIEL, JAKSA-CZOTTER NIKOLETTA, VARGA TÜNDE, BÜKKI ALEXANDRA, BALÁSSY JÚLIA, OLÁH BEATRIX, SZABÓ LUCA, KIRILLA ZOLTÁN, BALÁSSY JÚLIA, PREININGER ÉVA és VÁRALLYAY ÉVA: Kajszi és őszibarack ültetvény vírusdiagnosztikai vizsgálata kis RNS-ek újgenerációs szekvenálásával, 65. NTN összefoglalók, 2019
Dániel Baráth, Nikoletta Jaksa-Czotter, Tünde Varga, Luca Szabó, Zoltán Kirilla, Éva Preininger, Éva Várallyay: VIROME OF HUNGARIAN PEACH PLANTATIONS IDENTIFIED BY SMALL RNA NGS, abstract book of LIFE Nemzetközi Élettudományi Konferencia, Eger, 2019 március 29-31., 2019
Yuri Zambon, Nicoletta Contaldo, Assunta Bertaccini, Eva Varallyay: Small RNA profiling of aster yellows infected Catharanthus roseus plants., Phytopathogenic Mollicutes, vol9, no1, 2019
Almash Jahan, Daniel Barath, Nandor Majercsik, Tünde Varga, Nikoletta Jaksa-Czotter, Éva Várallyay: Small RNA HTS revealed the presence of CCGaV and AHVd in apple trees in Hungary, Advances in Plant Virology, Rome, 2019
Nagyné Galbács Zsuzsanna, Baráth Dániel, Várallyay Éva: Fapusztulások okainak kivizsgálása alma és kajszi ültetvényekben, MBK Napok, 2019
Almash Jahan, Baráth Dániel, Majercsik Nándor, Varga Tünde, Jaksa-Czotter Nikoletta és Várallyay Éva: Small RNA HTS revealed the presence of CCGaV and AHVd in apple trees in Hungary, MBK Napok, 2019
Almash Jahan, Baráth Dániel, Nagyné Galbács Zsuzsa, Varga Tünde, Jaksa-Czotter Nikoletta és Várallyay Éva: Magyarországon eddig nem detektált vírusok jelenlétének kimutatása almaültetvényeken, 66. Növényvédelmi Tudományos Napok, Budapest, 2020 február 18-19, 2020
Nagyné, Galbács Zsuzsanna és Várallyay Éva: Investigation causative agents of tree decline in apricot and apple orchards in Hungary, FIBOK 2020, 2020
Baráth Dániel, Jaksa-Czotter Nikoletta, Varga Tünde, Várallyay Éva: Őszibarackfák vírusdiagnosztikai vizsgálata kis RNS-ek szekvenálásával, Növényvédelem, 2020
Nagyné Galbács Zsuzsanna, Almash Jahan, Varga Tünde, Baráth Dániel, Jaksa-Czotter Nikoletta, Várallyay Éva: Új vírusok és viroid detektálása almaültetvények virológiai vizsgálata során, MBK Napok olnine, 2020
Agyemang, Evans Duah, Desiderio, Francesco, Emese Demian, Andras Takacs, Pal Salamon, Eva Varallyay: Searching for the causative agent of a viral-like symptom in Clematis vitalba, Forum For young RNA Investigators (online conference), 2020
Agyemang, Evans Duah, Desiderio, Francesco, Emese Demian, Andras Takacs, Pal Salamon, Eva Varallyay: Putative Ilarvirus found in Clematis vitalba showing virus-like symptoms, XXIV. Tavaszi Szél Konferencia, 2020
Agyemang, Evans Duah, Desiderio, Francesco, Emese Demian, Andras Takacs, Pal Salamon, Eva Varallyay: Searching for the causative agent of a viral-like symptom in Clematis vitalba, Forum For young RNA Investigators (online conference), 2021
Várallyay Éva: Növényeket fertőző vírusok gazdanövényre gyakorolt hatásának vizsgálata, diagnosztikája és felhasználása a molekuláris biológiában, MTA doktori, 2021
Barath Dániel: Kajszi és őszibarack fajták vírusdiagnosztikai vizsgálata új generációs szekvenálással, MATE BTDI, 2021
Evans Duah Agyemang, Francesco Desiderio, Emese Demian, Andras Takacs, Pal Salamon, Eva Varallyay: Symptom on Clematis vitalba could be a reason for an infection with Prunus virus I., Hungarian Molecular Life Science Conference, 2021 november 5-7, Eger., 2021
Francesco Desiderio, Evans Duah Agyemang, Andras Takacs, Eva Varallyay: Prunus virus F is present in Hungarian sour cherries,, Hungarian Molecular Life Science Conference, 2021 november 5-7, Eger., 2021
Francesco Desiderio, Evans Duah Agyemang, Emese Demian, Andras Takacs, Pal Salamon, Eva Varallyay: Symptoms on Clematis vitalba can be a reason of Prunus virus I infection., GBI Napok, Gödöllő, 2021, December 14-15., 2021
Dániel Barát, Nikoletta Jaksa-Czotter, Tünde Varga, Éva Varallyay: Viromes of Hungarian Peach Trees Identified by High-Throughput Sequencing of Small RNAs, MDPI Plants 2022, 11, 1591., 2022
Jaksa-Czotter, Nikoletta, Várallyay, Éva:: Does growing fruit trees in isolator house affect the detectability of their virus infection?, FIBOK 2022 április 11-12, Gödöllő, Hungary, 2022
Nagyné Galbács, Zsuzsanna, Yuri Zambon, Nicoletta Contaldo, Várallyay, Éva: Small RNA profiling of aster yellows infected Catharanthus roseus and apple proliferation phytoplasma infected apple plants., FIBOK 2022 április 11-12, Gödöllő, Hungary, 2022
Jahan Almash, Zsuzsanna Nagyne Galbacs and Varallyay Eva:: Analysis of molecular variability of apple hammerhead viroid found in different apple cultivars, FIBOK 2022 április 11-12, Gödöllő, Hungary, 2022
Desiderio Francesco, Galbacs Nagyné Zsuzsanna, Varallyay Éva: New Putative Viruses in Hungarian Sour Cherry Genebank Collection, FIBOK 2022 április 11-12, Gödöllő, Hungary, 2022




 

Events of the project

  
2023-10-25 16:37:03
Résztvevők változása
2019-11-05 17:54:44
Résztvevők változása



Back »