Human polyomaviruses: functional analyzis of genomes and prevalence study  Page description

Help  Print 
Back »

 

Details of project

 
Identifier
128533
Type FK
Principal investigator Csoma, Eszter
Title in Hungarian Humán polyomavírusok: genom funkcionális analízise és prevalencia felmérés
Title in English Human polyomaviruses: functional analyzis of genomes and prevalence study
Keywords in Hungarian polyomavírus, promoter, génexpresszió, prevalencia
Keywords in English polyomavirus, promoter, gene expression, prevalence
Discipline
Microbiology: virology, bacteriology, parasitology, mycology (Council of Medical and Biological Sciences)100 %
Ortelius classification: Virology
Panel Immunity, Cancer and Microbiology
Department or equivalent Department of Medical Microbiology (University of Debrecen)
Starting date 2018-09-01
Closing date 2023-08-31
Funding (in million HUF) 21.414
FTE (full time equivalent) 2.50
state running project





 

Final report

 
Results in Hungarian
Az elmúlt években több új, humán polyomavírust (PyV) írtak le, ám zömük klinikai jelentőségét még nem ismerjük. A vírusok megismerése érdekében kutatásainkat 3 vonalon folytattuk: (I.) Szeroprevelancia vizsgálatainkkal — amelyhez saját ELISA módszereket fejlesztettünk — 10 humán polyomavírus elleni ellenanyagokat vizsgáltunk vírusonként 619-1038 személy vérmintájában. Megállapítottuk, hogy a vírusok széles körben elterjedtek, a felnőttek körében csak a HPyV9 és NJPyV fertőzésen átesettek aránya <50%, a többi vírus esetében 55-94 %. A primer fertőzés korai gyermekkorban (<6 év) történhet a KI, WU és STLPyV-vel, míg a többi vírus esetén életkorral növekvő a szeropozitivitás, bizonyos esetekben idős korban csökkenő. Eredményeinket az összes már publikált adattal összevetettük, elemeztük, amely alapján bizonyos vírusok földrajzi különbségei feltételezhetőek. (II) A vírusok jelenlétét különböző légúti mintákban (garat és orrgarat, középfülváladék, orr- és garatmandula szövetben) vizsgáltuk, kimutatva, hogy a KI, WU, MW és STL vírusok légúti terjedése igen valószínű. (III) A nem-kódoló, kontroll régió vírusreplikációt szabályozó hatását in vitro vizsgáltuk különböző sejtkultúrákban. Tanulmányoztuk a szekvencia különbségek hatását, a korai és késői expressziós régiók közti különbségeket, illetve a szabályozó LT antigén hatását a promoterekre. Célunk volt potenciális target sejtek kiválasztása is jövőbeli vírusizolálási célokra.
Results in English
Several new human polyomaviruses (PyV) have been described, but the clinical significance of most of them is still unknown. In order to learn about the viruses, the project focused on 3 major points: (I.) During the seroprevalence study— for which we developed ELISA methods — we tested antibodies against 10 human polyomaviruses in the blood samples of 619-1038 individuals per virus. We found that the viruses are widespread, only the proportion of adults infected with HPyV9 and NJPyV is <50%, and for the other viruses 55-94%. Primary infection can occur in early childhood (<6 years) with KI, WU and STLPyV, while for the other viruses, seropositivity increases with age, and in some cases decreases in elderly individuals. We compared and analyzed our results with all the already published data, based on which geographical differences of certain viruses can be suggested. (II) The presence of viruses in different respiratory tract samples (pharyngeal, nasopharyngeal, middle ear, adenoid and tonsil tissue) was examined, showing that the respiratory spread of KI, WU, MW and STL viruses is very likely. (III) The effect of the non-coding control region on viral replication was investigated in vitro in different cell cultures. We studied the effect of sequence differences, the differences between early and late expression regions, and the effect of the regulatory LT antigen on the promoters. We also aimed to select potential target cells for future virus isolation purposes.
Full text https://www.otka-palyazat.hu/download.php?type=zarobeszamolo&projektid=128533
Decision
Yes





 

List of publications

 
Jeles Krisztina, Katona Melinda, Csoma Eszter: Seroprevalence of Four Polyomaviruses Linked to Dermatological Diseases: New Findings and a Comprehensive Analysis, VIRUSES 14: (10) 2282, 2022
Eszter Csoma, Melinda Katona, Krisztina Jeles, Tamás, Gáll, Anita, Szalmás, Lajos, Gergely: Prevalence of human polyomavirus 11: is it transmitted via respiratory route?, Acta Microbiologica et Immunologica Hungarica Volume 66 Supplement 1 : Abstracts of the 18th International Congress of the Hungarian Society for Microbiology , Budapest,, 2019
Melinda Katona, Anita Szalmás, Krisztina Jeles, Lajos, Gergely, Eszter, Csoma: Human polyomavirus 10: DNA prevalence in respiratory samples and seroprevalence, Acta Microbiologica et Immunologica Hungarica Volume 66 Supplement 1 : Abstracts of the 18th International Congress of the Hungarian Society for Microbiology, 2019
Katona Melinda, Jeles Krisztina, Kovács Renátó, Csoma Eszter: KI and WU Polyomaviruses: Seroprevalence Study and DNA Prevalence in SARS-CoV-2 RNA Positive and Negative Respiratory Samples, MICROORGANISMS 10: (4) 752, 2022




Back »