Betekintés a növényi rendszerbiológiai trendekbe nemzetközi konferencia részvétellel
Title in English
Insight into plant systems biology trends by attending an international conference
Keywords in Hungarian
növény-mikrobiom kölcsönhatás, növényi metabolomika, fitokémia, rendszerbiológia, metagenomika, endofitonok
Keywords in English
plant-microbiome interactions, plant metabolomics, phytochemistry, systems biology, metagenomics, endophytes
Discipline
Plant pathology, molecular plant pathology (Council of Complex Environmental Sciences)
50 %
Crop protection (Council of Complex Environmental Sciences)
50 %
Panel
Science Patronage - subprogram 1
Department or equivalent
Department of Botany (University of Debrecen)
Starting date
2022-01-01
Closing date
2023-12-31
Funding (in million HUF)
1.050
FTE (full time equivalent)
0.00
state
closed project
Summary in Hungarian
A projekt keretében látogatni tervezett nemzetközi tudományos konferencia bemutatása és a tervezett részvétel ismertetése Mutassa be a nemzetközi rendezvény jellegét, célját, szervezőit és jelentőségét a nemzetközi tudományos életben. Ismertesse a részvétel célját (pl. előadás, poszter, egyéb aktivitás), a rendezvényen való részvétel várható hatását és jelentőségét a saját kutatói karrier építésében. A pályázat keretében meglátogatni tervezett rendezvény az IS-MPMI (Nemzetközi Növény-Mikróba Interakció Társaság) néhány évente megrendezett, 19.kongresszusa. A mintegy 750 tagot számláló szakmai testület által 1996 óta megrendezett rendezvény a növény-mikróba interakció szakterületének egyik legnagyobb jelentőségű seregszemléje. Méretén felül, a konferencia erősségei a szatellit meeting-ek (tematikus minikonferenciák) és a tematikusan, nagy számú alszekciókra osztott előadási és poszter prezentációs lehetőség: 2019-ben több, mint 15 poszter szekció és 25 előadás szekció biztosította az érdeklődésnek leginkább megfelelő munkák megismerését, mintegy 150 előadás és 1000 poszter került bemutatásra. A növény-mikróba molekuláris interakcióktól kezdve, gazda-mikróba koevolúción, apoplasztbeli interakciókon át a fitobiomokig számos terület kerül érintésre.
Részvételem célja a szakterület jelenlegi feltörekvő trendjeibe való betekintés, amely az elkövetkező években meghatározhatja saját kutatási módszereim bővítésének irányát. Ezt a jelenleg metabolomikai fókuszú módszertanunk rendszerbiológiai vizsgálatokká történő fejlesztése követeli meg. Természetesen saját eredményeim bemutatása (előadás/poszter) is meghatározó cél, amely mentén szakmai kapcsolatok és potenciális kooperációs lehetőségek építését tervezem. Saját szűkebb szakterületem, a növény által termelt kémiai vegyületekkel való interakcióval kapcsolatos munkánk egy rendszerbiológiai szinten jelenleg alig vizsgált terület, amely a "mikrobiom és fitobiom" témakörbe illeszkedik leginkább. Mivel a tipikusan molekuláris biológiai vizsgálati módszerektől eltérő, komplementer megközelítést alkalmazunk, és az általunk vizsgált vegyületek a legjelentősebb modellnövényével megegyeznek, véleményem szerint újabb eredményeinkkel kapcsolatban érdeklődésre lehet számítani. A 2019-es kongresszuson a párhuzamos szekciókban a hozzám hasonló szakmai tapasztalattal rendelkező kollégák is kaphattak lehetőséget előadás megtartására.
A projekt összefoglalója, célkitűzései laikusok számára Adjon egy rövid, közérthető ismertetést a látogatni tervezett nemzetközi rendezvényről, illetve a részvétel céljáról, várható eredményeiről. A pályázat keretében meglátogatni tervezett rendezvény az IS-MPMI (Nemzetközi Növény-Mikróba Interakció Társaság) néhány évente megrendezett, 19. kongresszusa. A mintegy 750 tagot számláló szakmai testület által 1996 óta megrendezett rendezvény a növény-mikróba kölcsönhatás szakterületének egyik legnagyobb jelentőségű seregszemléje. Méretén felül, a konferencia erősségei a tematikusan, nagy számú alszekciókra osztott előadási és poszter prezentációs lehetőség: 2019-ben több, mint 15 poszter szekció és 25 előadás szekció biztosította az érdeklődésnek leginkább megfelelő munkák megismerését, mintegy 150 előadás és 1000 poszter került bemutatásra. A témák az alapkutatási módszerfejlesztésektől a jelentősebb termesztett növények növényvédelmén át számos területet ölelnek fel.
Részvételem célja a szakterület jelenlegi feltörekvő trendjeibe való betekintés, amely az elkövetkező években meghatározhatja saját kutatási módszereim bővítésének irányát. Jelenlegi kémiai vizsgálataimat kiegészítő eljárásokkal, és az azokat professzionális szinten művelő kollégákkal kívánok megismerkedni. Természetesen saját eredményeim bemutatása is meghatározó cél, amely mentén szakmai kapcsolatok és potenciális kooperációs lehetőségek építését tervezem. Saját szűkebb szakterületem, a mikróbák növény által termelt hatóanyagokkal való kölcsönhatása a tipikusan molekuláris biológiai vizsgálati módszerektől eltérő módszerekkel kerül vizsgálatra. Mivel az általunk vizsgált vegyületek a legjelentősebb modellnövényével megegyeznek, véleményem szerint újabb eredményeinkkel kapcsolatban érdeklődésre lehet számítani.
Summary
Presentation of the international scientific conference to be visited in the project and description of the proposed participation Present the type, purpose, organizers, and significance of the international event in the scientific community. Present the purpose of the participation (e.g., paper, poster, other activity), the expected impact of the participation in the event and its significance in building your own research career. The conference to attend is the 19. congress of IS-MPMI (International Society for Molecular Plant Microbe Interactions). The society has approximately 750 members and it organizes this congress every few years, since 1996. It is one of the largest meetings of the scientists of the field of plant-microbe interactions. Apart from its impressive size, the strengths of the conference include thematic satellite mini-conferences and the large number of subsections enabling presentation to the most interested audience: in 2019, more than 15 poster and 25 oral presentation sections included about 150 oral presentations and 1000 poster presentations. Topics spanned from molecular plant-microbe interactions, through host-microbe coevolution and apoplastic interactions to phytobiomes and many more.
My aim is to get an insight into the trends of the field of plant-microbe interactions, that would determine the path of the expansion of our range of scientific methods for the upcoming years. This is a necessary next step we have to take to upgrade our metabolomics-focussed studies to a systems biology level approach. Of course, presenting my own results as a lecture or poster is also an important aim, which would allow me to build potential cooperation possibilities and professional relations. My narrow field of research is the interaction between the bioactive compounds produced by the plant and the phytobiome, which fits well within the conference section "microbiome and phytobiome". This topic is currently not intensively studied at a systems biology level. As we use methods complementary to the usual molecular biological ones, and the compounds we examine are the same those of the most widely studied model plant Arabidopsis thaliana, we expect that our results might generate interest. During the 2019 congress, presenters of oral lectures also included scientists who are at my level of professional experience.
Summary and aims of the project for a general audience Provide a short, general introduction to the international event to be visited, the purpose of the participation, and its expected results. The conference to attend is the 19. congress of IS-MPMI (International Society for Molecular Plant Microbe Interactions). The society has approximately 750 members and it organizes this congress every few years, since 1996. It is one of the largest meetings of the scientists of the field of plant-microbe interactions. Apart from its impressive size, the strengths of the conference include thematic satellite mini-conferences and the large number of subsections enabling presentation to the most interested audience: in 2019, more than 15 poster and 25 oral presentation sections included about 150 oral presentations and 1000 poster presentations. Topics spanned many areas from methods in basic research to plant protection applications of the most widely grown crops.
My aim is to get an insight into the trends of the scientific field that would determine the path of the expansion of our range of scientific methods for the upcoming years. This is a necessary next step we have to take to upgrade our chemistry-focussed studies to a higher level approach. Of course, presenting my own results as a lecture or poster is also an important aim, which would allow me to build potential cooperation possibilities and professional relations. My narrow field of research, the interaction between the bioactive compounds produced by the plant and the microorganisms living in contact with the plant, is typically examined via chemical methods, complementary to the typically used molecular biological methods in this field. We examine the same compounds as those of the most widely studied model plant, therefore we expect that our results might generate interest.
Final report
Results in Hungarian
A konferencia részvétellel fő céljaim a növény-mikróba interakció szakterület jelenlegi trendjeibe való betekintés, szakmai kapcsolatépítés és saját eredményeim bemutatása voltak.
Az első kapcsán egyértelművé vált számomra, hogy a jelenlegi trendek a nagy léptékű, nagy elemszámmal dolgozó szkríning-vizsgálatok további előretörése, valamint a teljes genom szekvenálás adta lehetőségek minél komolyabb kiaknázása. Utóbbit új bioinformatikai és ár-érték arányban kiváló, elérhető szekvenálási módszerek fejlesztése hajtja. Egyértelműen elvált, hogy jelenleg mit tart a kurrens molekuláris biológia bizonyító erejű kísérleti elrendezésnek. Ezek a tanulságok az elkövetkező időszakban biztosan befolyással lesznek a kutatási módszereinkre és megközelítéseinkre.
Nem célzott metabolomikával és növényi mikrobiommal foglalkozó csoportok közül viszonylag kevesen képviseltették magukat, a konferenciát mikroszkópos, illetve genetikai, transzkriptomikai módszertanra építő kutatók dominálták. Kivétel volt pl. a Swammerdam Institute for Life Sciences (SILS, Hollandia) egyik kollégája, akivel az exudátum analitikáról és a metabolomikáról sikerült módszertani részleteket cserélnünk. A közeljövőben a csoportot meg is kívánom látogatni.
Az általam poszteren bemutatott kutatás metabolom - mikrobiom hálózatok feltárását célozta egy kultúrnövényben. Az érdeklődők elsősorban a vegyületek annotációjának módszereiről akartak minél többet megtudni.
Results in English
My main objectives in attending the conference were getting an insight into the current trends in the field of plant-microbe interactions, to network and to present my own results.
Regarding the first aim, it became clear to me that the current trends include large-scale screening studies and making the most use of whole-genome sequencing. The latter is being driven by new bioinformatic approaches and new available sequencing methods of excellent value. I obtained clues about what current molecular biology considers to be a sufficient experimental setup to prove hypotheses. These lessons will certainly influence our research methods and approaches in the near future.
Researchers using untargeted metabolomics as core methodology and plant microbiome studies
were relatively under-represented. The conference was dominated by colleagues with microscopy and genetic and transcriptomic backgrounds. One of the exceptions was a colleague from the Swammerdam Institute for Life Sciences (SILS, The Netherlands), with whom I was able to discuss methodological details on exudate analysis and metabolomics. I intend to visit the group in the near future.
The poster I presented was prepared from the results of a metabolome - microbiome network study in a cultivated plant. The ones interested wanted to know the most about the methods for annotation of compounds.
