Information Technology (Council of Physical Sciences)
20 %
Bioinformatics (Council of Medical and Biological Sciences)
10 %
Panel
Science Patronage - subprogram 1
Department or equivalent
Department of Optics and Quantum Electronics (University of Szeged)
Starting date
2022-04-01
Closing date
2022-04-30
Funding (in million HUF)
0.467
FTE (full time equivalent)
0.00
state
closed project
Summary in Hungarian
A projekt keretében látogatni tervezett nemzetközi tudományos konferencia bemutatása és a tervezett részvétel ismertetése Mutassa be a nemzetközi rendezvény jellegét, célját, szervezőit és jelentőségét a nemzetközi tudományos életben. Ismertesse a részvétel célját (pl. előadás, poszter, egyéb aktivitás), a rendezvényen való részvétel várható hatását és jelentőségét a saját kutatói karrier építésében. A FOM, azaz a Focus On Microscopy egy 1988 óta fennálló éves konferencia sorozat a legújabb innovációkról és fejlesztésekről az optikai mikroszkópia terén, illetve ezek alkalmazása terén a biológiában, orvoslásban és anyagtudományokban. A FOM konferenciák hatékony találkozási pontot képeznek mind a fejlesztők, mind a felhasználók számára, akik ezen a gyorsan fejlődő területen tevékenykednek, fontos szerepet játszva ezzel az új fejlesztésekről való információ terjesztésében. A FOM konferenciák része egy kiállítás, ahol bemutatják a legújabb technikai fejlesztéseket a mikroszkópia területén. A 2022-es FOM szervezőbizottsága három tagú: Paula Sampaio (University of Porto, Portugália), Hans Gerritsen (University of Utrecht, Hollandia) és Fred Brakenhoff (University of Amsterdam, Hollandia). A FOM témái kiterjednek a nagyfeloldású mikroszkópiás képalkotásra (PALM, STORM, GSDIM, SOFI és ezzel kapcsolatban álló technikák), az ezekben a technikákban elért eredményekre, valamint a megszerzett adat elemzésére és vizualizációjára, amivel én magam is foglalkozom. A mesterséges intelligencia, illetve a gépi tanulás fellendülőben lévő területek, amiknek alkalmazása a mikroszkópiában is megjelentek és ennek megfelelően már néhány éve a FOM témái között is szerepelnek és egyre hangsúlyosabb szerephez jutnak. A rendezvényen poszteren tervezem ismertetni a nagyfeloldású lokalizációs mikroszkópiás felvételek mesterséges intelligenciával való elemzésében elért eredményeimet, melynek során új ismeretségeket és ötleteket szerzek, valamint esetlegesen együttműködések bontakoznak ki. A konferencián sok hasonló témában tevékenykedő kutatóval nyílik lehetőségem konzultálni.
A projekt összefoglalója, célkitűzései laikusok számára Adjon egy rövid, közérthető ismertetést a látogatni tervezett nemzetközi rendezvényről, illetve a részvétel céljáról, várható eredményeiről. FOM (Focus On Microscopy) egy nagy múlttal rendelkező éves szinten megrendezésre kerülő konferencia, ami egy találkozási helyül szolgál az optikai mikroszkópia területén tevékenykedő kutatók és felhasználók között. A konferencián lehetőségem nyílik megismerkedni a mikroszkópiában és mikroszkópiás mérési eredmények elemzéseiben elért legújabb eredményekkel, illetve résztvevőként betekintést kapok abba, hogy az ezen területen dolgozó vezető kutatók mivel foglalkoznak, milyen eredményeket értek el és milyen problémákkal küzdenek. A kutatók közötti konzultáció segít meglátnom a fontos irányokat, ötleteket ad, illetve segíti a tudomány fejlődését. Az optikai mikroszkópia egyik fontos területe a feloldás növelése, ami lehetővé teszi, hogy egyre kisebb struktúrákat vizsgáljunk. Emiatt az úgynevezett nagyfeloldású technikák 2006-os megjelenése óta egyre népszerűbbek. Az optikai mikroszkópia másik rendkívül fontos területe, hogy a különböző technikákkal nyert mérési adatot értelmezzük. Ennek során egyre összetettebb kérdéseket akarunk megválaszolni. Komplex feladatok elvégzésére napjainkban a mesterséges intelligencia, illetve a gépi tanulás a leghatékonyabb eszközök. A konferencián a nagyfeloldású felvételek mesterséges intelligenciával való elemzésében elért eredményeimet szeretném megismertetni, illetve a hasonló területen dolgozó kutatókkal konzultálva ötleteket adni, illetve szerezni, valamint a felhasználókkal konzultálva megismerni az igényeket.
Summary
Presentation of the international scientific conference to be visited in the project and description of the proposed participation Present the type, purpose, organizers, and significance of the international event in the scientific community. Present the purpose of the participation (e.g., paper, poster, other activity), the expected impact of the participation in the event and its significance in building your own research career. FOM or Focus On Microscopy is an annual conference series since 1988 reporting the latest innovations and developments in the field of optical microscopy and their application in biology, medicine and the material sciences. The FOM conferences constitute a significant meeting point for developers and users working in this rapidly evolving field, playing an important role in the dissemination of information about new results. The FOM conferences are accompanied by a technical exhibition showing the recent technical novelties in microscopy. The organizing committee has three members: Paula Sampaio (University of Porto, Portugal), Hans Gerritsen (University of Utrecht, The Netherlands) and Fred Brakenhoff (University of Amsterdam, The Netherlands). Topics of the FOM conference include super-resolution microscopy imaging (PALM, STORM, GSDIM, SOFI and related techniques), the achieved results in these fields and image processing and visualization of data, which is one of the tasks I myself work with. Artificial intelligence and machine learning are emerging areas in various fields of science, including microscopy. Therefore these are topics of FOM conference with an increasingly important role. I plan to present my findings about the analysis of super-resolution localization microscopy data via artificial intelligence during the poster presentation event of this conference, where, by making acquaintances and getting ideas, collaborations may develop. During the conference I would have the opportunity to consult with many researchers who work in the same field as I do.
Summary and aims of the project for a general audience Provide a short, general introduction to the international event to be visited, the purpose of the participation, and its expected results. FOM (Focus On Microscopy) is a long standing, yearly conference series, which is a meeting point for researchers and users working in the field of optical microscopy. I would have the opportunity to get acquainted with the latest findings in the field of microscopy and in the analysis of microscopy data. As a participant of this event, I would get an insight into the work, results and problems of leading researchers. Consultations with the participants could help me to see the important directions, give me ideas and help the development of science. Increasing the spatial resolution is an important task in optical microscopy, which allows us to examine smaller and smaller structures. For this reason the super-resolution techniques have been growing in popularity since their invention in 2006. Another extremely important area of optical microscopy is to interpret measurement data obtained by various techniques. In doing so, we want to answer increasingly complex questions. Nowadays, artificial intelligence and machine learning are the most effective tools for performing complex tasks like these. At the conference, I would like to present my results in the analysis of super-resolution images with artificial intelligence, and to give and obtain ideas in consultation with researchers working in the same field, and to learn about the needs of the users.
Final report
Results in Hungarian
A konferencián lehetőségem nyílt megismerkedni a mikroszkópiában és mikroszkópiás mérési eredményeinek elemzéseiben elért legújabb eredményekkel, illetve résztvevőként betekintést kaptam abba, hogy az ezen területen dolgozó vezető kutatók mivel foglalkoznak, milyen eredményeket értek el és milyen problémákkal küzdenek. A kutatók közötti konzultáció segített meglátnom a fontos irányokat, ötleteket adott, illetve ilyen módon segítette a tudomány fejlődését. Most van egy publikációm is beküldés alatt, amit ez a konferencia inspirált.
A konferencián konferencia előadás keretében megismertettem a nagyfeloldású felvételek mesterséges intelligenciával való elemzésében elért eredményeimet. A hasonló területen dolgozó kutatókkal konzultálva ötleteket adtam, illetve szereztem, valamint a felhasználókkal konzultálva megismertem az igényeket, amiket a jövőben érdemes kielégíteni. A konferencia ezen túl nagy lendületet adott a disszertációm befejezéséhez.
Results in English
The conference gave me an excellent opportunity to learn about the latest advances in microscopy and the analysis of microscopic measurements, and as a participant, to gain insight into what leading researchers in this field are doing, what they have achieved and what problems they are facing. The consultation between researchers helped me to see important directions, gave me ideas and helped the science to develop. I have a publication in submission now, inspired by this conference.
At the conference, I gave a conference presentation on my achievements in analysing high-resolution images with artificial intelligence. By consulting with researchers working in the same field, I provided and obtained ideas, and by consulting with users, I identified needs that should be addressed in the future. In addition, the conference gave a great impetus to the completion of my dissertation.
