Kutatások a MALDI-TOF tömegspektrometria szénhidrátkémia alkalmazási lehetőségeinek kiszélesítésére
Title in English
Investigation of widening of the MALDI-TOF MS applications in carbohydrate chemistry
Panel
Chemistry 2
Department or equivalent
Department of Inorganic and Analytical Chemistry (University of Debrecen)
Participants
Csávás, Magdolna Fekete, Anikó Gálné Remenyik, Judit Jánossy, Lóránt Kandra, Lili Nánási, Pál Sajtos, Ferenc
Starting date
2003-01-01
Closing date
2007-12-31
Funding (in million HUF)
7.544
FTE (full time equivalent)
0.00
state
closed project
Final report
Results in Hungarian
A kutatás fő célkitűzése volt szénhidrátok és származékaik (védőcsoportokat tartalmazó vagy fehérjéhez kötött oligoszacharidok) MALDI-TOF tömegspektrometriás meghatározásához optimális kísérleti körülmények megállapítása és így a szénhidrátkémiai kutatások segítése. Ciklodextrin modellvegyületek alkalmazásával vizsgáltuk a minta előkészítés és felvitel valamint a kísérleti paraméterek változtatásának hatását a spektrumra. Tanulmányozzuk a mátrix anyagának, a minta koncentrációjának, a mintafelvitel módjának és a reflektron detektor érzékenység hatását a spektrum minőségére. Védőcsoportokat tartalmazó oligoszacharidok mérésekor számos törvényszerűséget figyeltünk meg a védőcsoportok stabilitása, a különböző mátrixok és kísérleti paraméterek között. A MALDI mérések segítették a termékek és melléktermékek azonosítását kémiai és enzimes oligoszacharid szintézisek esetében. Fragmentációs vizsgálatokkal kémiai és enzimatikus szintézissel előállított oligoszacharidok, valamint természetes eredetű amiláz inhibítorok szerkezet felderítését végeztük el. Meghatároztuk különböző neoglikoproteinek oligoszacharid tartalmát, amely meghatározó a sikeres immunválasz kiváltásában. Méréseinkkel támogattuk a különböző neoglikoprotein előállítási módszerek szisztematikus vizsgálatát.
Results in English
The object of this research program was the application of MALDI-TOF MS in the field of carbohydrates and glycoconjugates. Cyclodextrins as model compounds were used to investigate the effect of the sample preparation methods and experimental parameters on the spectrum. The studied experimental parameters were: different matrix compounds, detector sensitivity, sample concentration and sample preparation methods. The stability of the protecting groups under the conditions of the evaporation/ionization was studied. The MALDI measurements assisted to identify products and byproducts of different chemical and enzymatic oligosaccharide syntheses (eg. sugar-sulfonates, sulfonic acid esters, PNP-glycosides and acarbose derivatives). Structural analysis and verification were made using post source decay fragmentation method in case of a tetrasaccharid component of N-glycanes, acarbose and its derivatives obtained by enzymatic synthesis and some natural alpha-amylase inhibitors. In addition we used this method for determination of molecular masses of neoglycoproteins.
Kandra L; Gyémánt G; Zajácz A; Batta G: Inhibitory effects of tannin on human salivary alpha-amylase, Biochem. Biophys. Res. Commun. 319/4 1265-1271, 2004
Remenyik J; Ragunath C; Ramasubbu N; Gyémánt G; Lipták A;, Kandra L: Introducing transglycosylation activity to human salivary alpha-amylase (HSA), ORG LETT 5 4895-4898, 2003
Lázár L; Csávás M; Borbás A; Gyémánt G; Lipták A: Synthesis of methyl 6-deoxy-4-O-(sodium sulfonato)-alpha-L-talopyranoside, its C-4 epimer and both isosteric [4-C-(potassium sulfonatomethyl)] derivatives, ARKIVOC (vii) 196-207, 2004
Lili Kandra, Gyöngyi Gyémánt, Judit Remenyik, Chandran Ragunath, Narayanan Ramasubbu: Transzglycosylations catalysed by Y151M mutant of human salivary alpha-amylase (HSA), Biologia, Bratislava 60, Supplement No. 15., 2005
4. Lili Kandra, Judit Remenyik, Gyula Batta, László Somsák, Gyöngyi Gyémánt, Kwan Hwa Park: Enzymatic synthesis of a new inhibitor of alpha-amylases: acarviosinyl-isomaltosyl-spirothiohidantoin, Carbohydr. Res. 340. 1311-1317., 2005
L. Kandra, G. Gyémánt, J. Remenyik,: Enzyme catalysed glycosylation reaction, 1st European Chemistry Congress, 2006. augusztus 27-31. Budapest, 2006
G. Gyémánt, K. Ágoston, É. Sasi-Szabó, Z. Szurmai: Study of efficiency of neoglycoprotein preparation methods using MALDI-TOF MS, 1st European Chemistry Congress, 2006. augusztus 27-31. Budapest, 2006
Events of the project
2009-03-04 08:21:18
Kutatóhely váltás
A kutatás helye megváltozott. Korábbi kutatóhely: TTK Biokémiai Tanszék (Debreceni Egyetem), Új kutatóhely: TTK Szervetlen és Analitikai Kémiai Tanszék (Debreceni Egyetem).
