The association of cytokine genetic polymorphisms with perinatal complications of premature infants  Page description

Help  Print 
Back »
 

Details of project

  
Identifier
46086
Type K
Principal investigator Vásárhelyi, Barna
Title in Hungarian Citokin-gén polimorfizmusok kapcsolata koraszülöttek perinatális szövődményeivel
Title in English The association of cytokine genetic polymorphisms with perinatal complications of premature infants
Discipline
Medical engineering and technology (Council of Medical and Biological Sciences)100 %
Panel Genetics, Genomics, Bioinformatics and Systems Biology
Department or equivalent 1st Dept. of Pediatrics (Semmelweis University)
Participants Derzbach, László
Erdei, Gábor
Győrffy, Balázs
Kocsis, István
Tóth Heyn, Péter
Treszl, András
Starting date 2004-01-01
Closing date 2008-12-31
Funding (in million HUF) 6.037
FTE (full time equivalent) 0.00
state closed project





 

Final report

  
Results in Hungarian
Vizsgálatsorozatunk kapcsán több mint 300 kis súlyú koraszülött bevonásával 32 különböző genetikai polimorfizmus (SNP) hordozás kapcsolatát elemeztük a perinatális szövődményekkel. Több olyan elemre sikerült rámutatni, amelynek jelentősége lehet egy adott szövődmény kialakulásában. Ilyen az ösztrogén-receptorral szembeni érzékenységet befolyásoló SNP, illetve a renin-angiotenzin rendszer polimorfizmusok összefüggése a perinatalis adaptációs zavarokkal, a VEGF SNP-k perinatalis szövődményekkel való kapcsolata, a TNF-alfa és az IFN-gamma, valamint az IL-12 SNP-k lélegeztetés iránti igénnyel való kapcsolata. Vizsgálataink a gyógyszerfejlesztés, valamint a terápia optimálása szempontjából végzett klinikai vizsgálatok számára kiindulási alapot jelenthetnek. Az eredmények másik hasznosítási területe a szövődmény-predikció lehet. Azt, hogy a genotípus-mintázat ismerete a megszületéskor mennyire segíti ezt a célt, egy új statisztikai eljárással (random forest technikával) elemeztük. Ezzel a módszerrel meghatároztuk, hogy az egyes SNP-k milyen mértékben segítik önmagukban a predikciót, illetve olyan SNP-mintázatokat állítottunk össze, amelyekkel megszületéskor a szövődmény-predikció pontossága fokozható.
Results in English
During our studies we enrolled more than 300 preterm infants and determined the association between carrier status of 32 different genetic polymorphisms with the risk of perinatal complications. Several SNPs with a possible involvement in the investigated complications were identified. These include the association of perinatal adaptational disturaűbances with an SNP with an impact on estrogen sensitivity and with genetic polymorphisms of renin-angiotensin system; the association between VEGF SNPs and some perinatal complications; the link between TNF-alpha, IFN-gamma and IL-12 SNPs and need for ventilatory support. These results may for a basis for studies aiming drug developemnt and optimization of therapy. Another psosible field for the use of these results is complication prediction. We applied a new statistical approach (random forest technique) to determine, whether the information about genotype patterns at birth may improve complication prediction. For this purpose we established the importance score values of individual SNPs and created optimized SNP patterns with the highest predictive value.
Full text http://real.mtak.hu/1296/
Decision
Yes





 

List of publications

  
Nobilis A, Szabó M, Kocsis I, Sulyok E, Tulassay T, Vásárhelyi B: Angiotensin-converting enzyme DD genotype is preventive against circulatory failure in very low-birth-weight neonates, Acta Paediatrica, 2006
Balogh Á, Derzbach L, Vannay Á, Vásárhelyi B: Lack of association between insulin-like growth factor I receptor G+3174A polymorphism and retinopathy of prematurity, Graefes Archive for Clinical and Experimental Ophthalmology, 2005
Bányász I, Bokodi G, Vannay Á, Szebeni B, Treszl A, Vásárhelyi B, Tulassay T, Szabó A: Genetic polymorphisms of vascular endothelial growth factor and angiopoietin 2 in retinopathy of prematurity, Curr Eye Res, 2006
Bokodi G, Derzbach L, Vásárhelyi B: Deletion allele of angiotensin-converting enzyme, J Pediatrics, 2006
Balogh A, Treszl A, Vannay A, Vásárhelyi B: A prevalent functional polymorphism of insulin-like growth factor system is not associated with perinatal complications in preterm infants, Pediatrics, 2005
Bokodi G, Treszl A, Derzbach L, Balogh Á, Vásárhelyi B: The association of the carrier state of the tumor necrosis factor-alpha (TNFalpha) (-308)A allele with the duration of oxygen supplementation in preterm neonates, Eur Cytokine Network, 2005
Szebeni B, Szekeres R, Rusai K, Vannay Á, Veres G, Treszl A, Arató A, Tulassay T, Vásárhelyi B: Genetic polymorphisms of CD14, toll-like receptor 4, and caspase-recruitment domain 15 are not associated with necrotizing enterocolitis in very low birth weight infants, J. Ped Gastroenterol Nutr, 2006
Szőnyi L, Dobos M, Vásárhelyi B, Héninger E, Vas T, Nagy J, Kovács T: Prevalence of alpha-1 antitrypsin phenotypes in patients with IgA nephropathy, Clinical Nephrology, 2004
Rigó J, Bőze T, Derzsy Z, Derzbach L, Treszl A, Sober S, Vásárhelyi B: Family history of early-onset cardiovascular disorders is associated with risk of preeclampsia, Eur J Obst Gyn Reprod Biol, 2006
Vásárhelyi B, Cseh Á, Kocsis I, Treszl A, Györffy B, Rigó J: Three mechanisms in the pathogenesis of pre-eclampsia suggested by over-represented transcription factor-binding sites detected with comparative promoter analysis, Molecular Human Reproduction, 2006
Bányász I, Szabó Sz, Bokodi G, Vannay Á, Vásárhelyi B, Szabó A, Tulassay T, Rigó J: Genetic polymorphisms of vascular endothelial growth factor in severe pre-eclampsia, Molecular Human Reproduction, 2006
Svec P, Vásárhelyi B, Pászthy B, Körner A, Kovács L, Tulassay T, Treszl A: Do regulatory T cells contribute to Th1 skewness in obesity?, Exp Clin Endocrinol Diabetes, 2007
Pászthy B, ©vec P, Vásárhelyi B, Túry F, Mazzag J, Tulassay T, Treszl A: Investigation of regulatory T cells in anorexia nervosa, Eur J Clin Nutr, 2007
Bányász I, Bokodi G, Vásárhelyi B, Treszl A, Derzbach L, Szabó A, Tulassay T, Vannay Á: Genetic polymorphisms of vascular endothelial growth factor in perinatal complications., Eur Cytokine Network, 2007
Treszl A, Németh K, Kocsis I, Vásárhelyi B, Fekete Gy, Tulassay T, Szathmári M: The prevalence deltaF-508 in primary osteoporotic patients, European Respiratory Journal, 2005
Pászthy B, Svec P, Túry F, Kovács L, Vásárhelyi B, Tulassay T, Treszl A.: Impact of anorexia nervosa on activation characteristics of lymphocytes., Neuro Endocrinol Lett, 2007
Szebeni B, Veres G, Dezsofi A, Rusai K, Vannay A, Bokodi G, Vásárhelyi B, Korponay-Szabó IR, Tulassay T, Arató A.: Increased mucosal expression of Toll-like receptor (TLR)2 and TLR4 in coeliac disease., J Pediatr Gastroenterol Nutr., 2007
Róka A, Vásárhelyi B, Bodrogi E, Machay T, Szabó M.: Changes in laboratory parameters indicating cell necrosis and organ dysfunction in asphyxiated neonates on moderate systemic hypothermia., Acta Paediatr, 2007
Balogh A, Szabó M, Kelen D, Bokodi G, Prechl J, Bösze S, Vásárhelyi B.: Prohepcidin levels during human perinatal adaptation., Pediatr Hematol Oncol., 2007
Treszl A, Kaposi A, Hajdú J, Szabó M, Tulassay T, Vásárhelyi B.: The extent to which genotype information may add to the prediction of disturbed perinatal adaptation: none, minor, or major?, Pediatr Res, 2007
Vásárhelyi B, Tóth-Heyn P, Treszl A, Tulassay T.: Genetic polymorphisms and risk for acute renal failure in preterm neonates. Mini-review., Pediatric Nephrology, 2005
Treszl A, Tulassay T, Vásárhelyi B: Genetic basis for necrotizing enterocolitis – risk factor and their relations to genetic polymorphisms, Front Biosci, 2006
Derzbach L, Treszl A, Vannay Á, Balogh Á, Vásárhelyi B, Tulassay T, Rigó J: Gender dependent association between perinatal morbidity and estrogen receptor-α PvuII polymorphism, Journal of Perinatal Medicine, 2005
Bokodi G, Derzbach L, Bányász I, Tulassay T, Vásárhelyi B: The association of interferon.gamma T+874A and interleukin-12 p40 promoter CTCTAA/GC polymorphism with the need for respiratory support and perinatal complications in low, Arch Dis Childhood, 2006
Derzbach L, Bokodi G, Treszl A, Vásárhelyi B, Nobilis A, Rigó J: Selectin polymorphisms and perinatal morbidity in low birth weight infants, Acta Paediatrica, 2006
Vannay Á, Vásárhelyi B, Környei M, Treszl A, Kozma G, Tulassay T, Sulyok E: Single nucleotide polymorphisms of VEGF gene are associated with risk of congenital valvuloseptal heart defects, American Heart Journal, 2006
Bokodi G, Treszl A, Kovács L, Tulassay T, Vásárhelyi B.: Dysplasia: a review, Pediatr Pulmonol, 2007
Vannay Á, Dunai Gy, Bányász I, Szabó M, Vámos R, Treszl A, Tulassay T, Vásárhelyi B: Genetic polymorphisms of vascular endothelial growth factor are associated with the risk of retinopathy of prematurity, Pediatric Research, 2005
Derzbach L, Balogh Á, Bokodi G, Vásárhelyi B, Rigó J: The Ser128Arg E-selectin and Thr715Pro P-selectin polymorphisms and severe preeclampsia, J Reprod Med, 2007



Back »