Investigations on non-covalent interactions of biological importance: protein binding, nucleic acid binding, self-assembly  Page description

Help  Print 
Back »

 

Details of project

 
Identifier
49721
Type K
Principal investigator Simonyi, Miklós
Title in Hungarian Biológiailag jelentős nem-kovalens kölcsönhatások tanulmányozása: fehérje-kötődés, nukleinsav-kötődés, önszerveződés
Title in English Investigations on non-covalent interactions of biological importance: protein binding, nucleic acid binding, self-assembly
Panel Natural Sciences Committee Chairs
Department or equivalent CRC HAS Institute of Biomolecular Chemistry (Chemical Research Center of the HAS)
Participants Benéné Visy, Júlia
Bikádi, Zsolt Ede
Fitos, Ilona
Hazai, Eszter
Mády, György
Németh, Krisztina
Vikmon, Andrásné
Zsila, Ferenc
Starting date 2005-10-01
Closing date 2009-09-30
Funding (in million HUF) 14.040
FTE (full time equivalent) 14.70
state closed project





 

Final report

 
Results in Hungarian
Nem-kovalens kölcsönhatások (fehérjekötődés, aggregáció) kisérleti vizsgálatára UV-Vis, fluoreszcencia és kiroptikai spektroszkópiai módszereket alkalmaztak, a vizsgálati minták tisztítását kromatográfiás (HPLC, kapilláris elektroforézis) technikákkal végezték. A humán vérplazma minor fehérje komponensének (alfa-1 savas glikoprotein, AGP) részletes vizsgálata kimutatta, hogy az AGP genetikai variánsai eltérő, a kötődési erősségtől függő módon csökkentik a myeloid leukémia gyógyszerének (Imatinib, Glivec®, Novartis) hatásosságát. Daganatos betegek klinikai vérmintáiból kidolgozták nagy tisztaságú AGP kinyerését és kapilláris elektroforézissel igazolták, hogy az AGP cukorláncának változatossága (glycoform heterogeneity) különféle daganatos megbetegedések érzékeny markere. Enantiomerek elválasztására egy ciklodextrin származékot tartalmazó új királis állófázist fejlesztettek ki. Megfigyelték, hogy AGP kötődésben királis inverzió következhet be. A kiroptikai spektrumokban megjelenő exciton sávpár intenzitását nem-kovalens kölcsönhatások esetére elméleti alapon indokolták.
Results in English
UV-Vis, fluorescence and chiroptical spectroscopic methods have been applied for experimental studies of non-covalent interactions, the purification of the samples were done by chromatographic (HPLC, capillary electrophoresis) techniques. Detailed studies of the minor protein component of human blood plasma, alpha-1 acid glycoprotein (AGP) revealed that the decrease in the efficiency of the medication against chronic myelogenous leukaemia, Imatinib (Glivec®, Novartis) brought about by the genetic variants of AGP was in correlation with their binding strength. Highly purified AGP samples were prepared from clinical blood samples of cancer patients and their capillary electrophoretic analysis proved the variability of sugar-chain of AGP (glycoform heterogeneity) to be a sensitive marker of several malignant diseases. New chiral stationary phase containing a cyclodextrin derivative has been developed for enantiomer separation. Chiral inversion has been demonstrated in AGP binding. The intensity of exciton couplets appearing in chiroptical spectra has been explained on theoretical grounds for non-covalent interactions.
Full text https://www.otka-palyazat.hu/download.php?type=zarobeszamolo&projektid=49721
Decision
Yes





 

List of publications

 
Fitos I, Visy J, Zsila F, Mády Gy, Simonyi M: Selective binding of imatinib to the genetic variants of human alpha-1 glycoprotein, Biochim Biophys Acta 1760, 1704-1712, 2006
Hazai E, Visy J, Fitos I, Bikádi Z, Simonyi M:: Selective binding of coumarin enantiomers to human α1-acid glycoprotein genetic variants, Bioorg Med Chem, 14, 1959-1965, 2006
F Zsila, G Nadolski, SL Lockwood:: Association studies of aggregated aqueous lutein diphosphate with serum albumin and alpha-1 acid glycoprotein in vitro, Bioorg Med Chem Lett, 16, 3797-3801, 2006
F Zsila, H Matsunaga, Z Bikádi, J Haginaka: Multiple ligand-binding properties of the lipocalin member chicken alpha-1 acid glycoprotein studied by circular dichroism and electronic absorption spectroscopy, Biochim Biophys Acta 1760, 1248-1273, 2006
Fitos I, Visy J, Zsila F, Mády Gy, Simonyi M: Conformation selectivity in the binding of diazepam and analogues to α1-acid glycoprotein, Bioorg. Med. Chem. 15, 4857-4862, 2007
Zsila F: Overlapping ligand specificity of P-glycoprotein and serum alpha1-acid glycoprotein: evidences and potential implications, Curr. Drug Metab. 8, 563-593, 2007
Zsila F, Iwao Y: The drug binding site of human α1-acid glycoprotein: Insight from induced circular dichroism and electronic absorption spectra, Biochim. Biophys. Acta 1770, 797-809, 2007
Zsila F, Visy J, Mády Gy, Fitos I: Selective plasma protein binding of antimalarial drugs to α1-acid glycoprotein, Bioorg Med Chem, 16, 3759-3772, 2008
Molnár T, Visy J, Simon Á, Moldvai I, Temesvári-Major E, Dörnyei G, Kutiné Fekete E, Kardos J: Validation of high-affinity binding sites for succinic acid through distinguishable binding of gamma-hydroxy-butyric acid receptor-specific NCS 382 antipodes, Bioorg Med Chem. Lett, 18, 6290-6292, 2008
Zsila F, Bikádi Z, Hazai E, Simon Á, Fitos I, Mády Gy: Organogold complexes probe a large β-barrel cavity for human serum α1-acid glycoprotein, Biochim Biophys Acta 1784, 1106-1114, 2008
Zsila F, Mády Gy: Biliverdin is the endogenous ligand of human serum α1-acid glycoprotein, Biochem. Biophys. Res. Commun, 372, 503-507, 2008
Simonyi M: Királis Gyógyszerek az elmúlt negyedszázadban, Farmakokinetika és Gyógyszermetabolizmus Továbbképző Szimpózium, 2008
Németh K, Kremmer T, Kocsis L, Visy J: Glycoform Heterogeneity of Human Serum α1-Acid Glycoprotein Determined by Capillary Zone Electrophoresis in Malignant Diseases, Chromatographia, 69, 1307-1313, 2009
Varga G, Tárkányi G, Németh K, Iványi R, Jicsinszky L, Tőke O, Visy J, Szente L, Szemán J, Simonyi M: Chiral separation by a monofunctionalized cyclodextrin derivative: From selector to permethyl-beta-cyclodextrin bonded stationary phase, J. Pharmaceutical and Biomedical Analyses, 51, 84–89, 2010
Fitos I, Visy J, Simonyi M, Mády Gy, Zsila F:: Selective binding interactions of deramciclane to the genetic variants of human α1-acid glycoprotein, Biochim Biophys Acta accepted manuscript, doi: 10.1016/j.bbagen.2009.08.006, 2010
Simonyi M:: Factors Affecting Supramolecular Exciton Intensity, Chirality submitted for publication, 2010




Back »