Biológiailag jelentős nem-kovalens kölcsönhatások tanulmányozása: fehérje-kötődés, nukleinsav-kötődés, önszerveződés
Title in English
Investigations on non-covalent interactions of biological importance: protein binding, nucleic acid binding, self-assembly
Panel
Natural Sciences Committee Chairs
Department or equivalent
CRC HAS Institute of Biomolecular Chemistry (Chemical Research Center of the HAS)
Participants
Benéné Visy, Júlia Bikádi, Zsolt Ede Fitos, Ilona Hazai, Eszter Mády, György Németh, Krisztina Vikmon, Andrásné Zsila, Ferenc
Starting date
2005-10-01
Closing date
2009-09-30
Funding (in million HUF)
14.040
FTE (full time equivalent)
14.70
state
closed project
Final report
Results in Hungarian
Nem-kovalens kölcsönhatások (fehérjekötődés, aggregáció) kisérleti vizsgálatára UV-Vis, fluoreszcencia és kiroptikai spektroszkópiai módszereket alkalmaztak, a vizsgálati minták tisztítását kromatográfiás (HPLC, kapilláris elektroforézis) technikákkal végezték. A humán vérplazma minor fehérje komponensének (alfa-1 savas glikoprotein, AGP) részletes vizsgálata kimutatta, hogy az AGP genetikai variánsai eltérő, a kötődési erősségtől függő módon csökkentik a myeloid leukémia gyógyszerének (Imatinib, Glivec®, Novartis) hatásosságát. Daganatos betegek klinikai vérmintáiból kidolgozták nagy tisztaságú AGP kinyerését és kapilláris elektroforézissel igazolták, hogy az AGP cukorláncának változatossága (glycoform heterogeneity) különféle daganatos megbetegedések érzékeny markere. Enantiomerek elválasztására egy ciklodextrin származékot tartalmazó új királis állófázist fejlesztettek ki. Megfigyelték, hogy AGP kötődésben királis inverzió következhet be. A kiroptikai spektrumokban megjelenő exciton sávpár intenzitását nem-kovalens kölcsönhatások esetére elméleti alapon indokolták.
Results in English
UV-Vis, fluorescence and chiroptical spectroscopic methods have been applied for experimental studies of non-covalent interactions, the purification of the samples were done by chromatographic (HPLC, capillary electrophoresis) techniques. Detailed studies of the minor protein component of human blood plasma, alpha-1 acid glycoprotein (AGP) revealed that the decrease in the efficiency of the medication against chronic myelogenous leukaemia, Imatinib (Glivec®, Novartis) brought about by the genetic variants of AGP was in correlation with their binding strength. Highly purified AGP samples were prepared from clinical blood samples of cancer patients and their capillary electrophoretic analysis proved the variability of sugar-chain of AGP (glycoform heterogeneity) to be a sensitive marker of several malignant diseases. New chiral stationary phase containing a cyclodextrin derivative has been developed for enantiomer separation. Chiral inversion has been demonstrated in AGP binding. The intensity of exciton couplets appearing in chiroptical spectra has been explained on theoretical grounds for non-covalent interactions.