Molecular and morpho-taxonomical studies in the Rubiaceae family  Page description

Help  Print 
Back »
 

Details of project

  
Identifier
68538
Type K
Principal investigator Borhidi, Attila
Title in Hungarian Molekuláris és morfotaxonómiai kutatások a Rubiaceae család növényein
Title in English Molecular and morpho-taxonomical studies in the Rubiaceae family
Keywords in Hungarian molekuláris filogenetika, citológia, szekvencia-analízis,ITS, tnrF-L, rps-16, Rondeletieae, Gardenieae
Keywords in English molecular phylogeny, cytology, sequence analyses, ITS, trnF-L, rps-16, Rondeletieae, Gardenieae
Discipline
Community ecology, systems ecology, ecosystem services (Council of Complex Environmental Sciences)60 %
General biochemistry and metabolism (Council of Medical and Biological Sciences)30 %
Environmental biology, ecotoxicology (Council of Complex Environmental Sciences)10 %
Panel Ecology and evolution 1
Department or equivalent Insitute of Biology (University of Pécs)
Participants Stranczinger, Szilvia
Varróné dr. Darók, Judit
Starting date 2007-07-01
Closing date 2012-07-31
Funding (in million HUF) 16.795
FTE (full time equivalent) 8.37
state closed project
Summary in Hungarian
A Rubiaceae család fajszám tekintetében a negyedik legnagyobb a ma ismert virágos növénycsaládok között. Mint a kétszikűek evolúciójának egyik csúcsálló taxonja, ma is folyamatos fejlődésben és mozgásban van, naponta jelennek meg új fajleírások.
Kutatásunk célja olyan molekuláris filogenetikai rendszer kidolgozása, amely választ ad a család egyes tribuszaiban levő nemzetségek és fajok filogenetikai helyzetének tisztázásához. A jelen pályázat keretében a témavezető, aki 35 éve foglalkozik a Rubiaceae család taxonómiájával, a Flora Mesoamericana projekt részére Mexikó Rubiaceae flórájának megírását tervezi, amely több mint 100 nemzetséget és mintegy 580 eddig felfedezett fajt tartalmaz. Ehhez szükséges a kritikus fajcsoportok, különösen a Rondeletia, Cinchoneae és Gardenieae tribusz egyes nemzetségeinek és fajcsoportjainak (pl. Deppea-komplex, Randia-komplex, Rondeletia-komplex) szekvencia analízisével a fajok filogenetikai távolságának és egymáshoz viszonyított rendszertani helyzetének meghatározása, illetve a nemzetségek rendszertani helyének és filogenetikai kapcsolatainak molekuláris taxonómiai és növényanatómiai módszerekkel való tisztázása.
A molekuláris filogenetikai vizsgálatokhoz előzetes kutatási eredmények és irodalmi adatok alapján az ITS (internal transcribed spacer), rps16 és trnF intron szekvencia analízisét tervezzük. A szekvencia adatok és a morfológiai vizsgálatok eredményeinek komplex analízise átfogó képet adhat Mexikó első Rubiaceae flóraművének megírásához.
Summary
Rubiaceae is one of the largest and most diverse families of flowering plants with mostly pantropical distribution. As one of the evolutionally most developed groups of dicots, the family is continuously developing even nowadays, and new species descriptions appear daily.
The aim of this study is to develop a phylogenetic system which clarifies the accurate taxonomic position of species and genera of the tribes in the family. In the present application the supervisor - who has been attended to the taxonomy of Rubiaceae for 35 years - plans to write the flora of Rubiaceae for the project of Flora Mesoamericana. Intended project contains more than 100 genera and about 580 species. To determine the right position of some critical genera and species groups (Deppea-complex, Randia-complex and Rondeletia-complex of the Rondeletia, Cinchoneae and Gardenieae tribes) DNA sequence analysis is necessary. To define the phylogenetic distance, -relationships and taxonomic position of the species and genera with molecular taxonomic methods combined with plant anatomic characters is indispensable as well.
The molecular phylogenetic study is planned to be completed with sequence analysis of ITS (internal transcribe spacer), rps16 and trnF-L introns by the grounds of previous research results and literature data. Complex analysis of the results of sequence analysis and morphological studies can give comprehensive aspect for the first publishable monograph on Rubiaceae of Mexico.




 

Final report

  
Results in Hungarian
A projektet megelőző kutatási időszak eredményeit az Akadémiai Kiadónál 2006-ban megjelent Rubiáceas de México című flóraműben 512 oldalon összegeztük. Az új projekt keretében 75 a tudományra új növényfajt fedeztünk fel és írtunk le, ami a tervidőszak összes felfedezésének 89%-a. A molekuláris és mikromorfológiai vizsgálatok kombinált alkalmazásával: 1) kimutattuk és leírtuk a Rondeletia tribusz egy a tudományra új genuszát a Rondeletia komplex Donnellyanthus Borhidi nevű nemzetségét. 2) Igazoltuk a Deppea komplex korábban általunk javasolt felosztását Bellizinca, Csapodya, Deppea, és Edithea nemzetségekre, és 3) Felfedeztük és leírtuk a Deppea komplex egy ötödik új nemzetségét, a 4 fajt tartalmazó Deppeopsis Borhidi & Stranczinger nevű génuszt. 4) Kimutattuk, hogy a Renistipula nemzetség nem a Rondeletieae, hanem a Hamelieae tribuszba tartozik. 5) A bizonytalan rendszertani helyzetű Hedyotis serpyllaceus Schltdl. részére felállítottuk az új Terrellianthus nemzetséget. 6) A kis fehér, bozontosvirágú Bouvardia fajokat (5 faj) egy új nemzetségbe vontuk össze Martensianthus néven Új taxonjainkat (8 nemzetség és 75 faj) a Kew Index érvényesnek elfogadta és katalogizálta. Az új eredmények 3 könyben és 49 cikkben jelentek meg. 2012 július 10-én megjelent a Rubiáceas de México 2. bővitett kiadása 608 oldalon 127 ábrával az Akadémiai Kiadónál.
Results in English
The results obtained before the project started were summarized in the flora work Rubiáceas de México, in 2006, edited by the Akadémiai Kiadó on 512 pages. In the frame of the new project 75 new plant species were detected and described, 89% of all the discoveries realized in the period. Using combined application of molecular and micro-morphological methods 1) we documented and described the Donnellyanthus Borhidi genus new to science of the Rondeletieae tribe; 2) our results proved right the subdivision of the Deppea s.l. into Bellizinca, Csapodya, Deppes s.str. and Edithea genera proposed earlier by us; 3) we discovered and described a new genus of the Deppea-complex named as Deppeopsis Borhidi & Stranczinger with 4 species; 4) we demonstrated that the Renistipula genus belong to the Hamelieae tribe instead of Rondeletieae; 5) we established the new Terrellianthus genus for finding a correct taxonomic placement for the Hedyotis serpyllaceus Schltdl. of uncertain position; 6) for 5 Bouvardia species having special small white hairy flowers we established a new genus named as Martensianthus. All our new taxa (8 genera and 75 species) have been registered as valid ones by the Kew Index; The new results were published in 3 books and 49 papers and in the 2. amplified edition of the Rubiáceas de México on 608 pages with 127 figures by the Akadémiai Kiadó, 2012, Budapest.
Full text https://www.otka-palyazat.hu/download.php?type=zarobeszamolo&projektid=68538
Decision
Yes





 

List of publications

  
Borhidi, A.: An attempt to transform molecular cladistic trees of angiosperms into a comprehensive system., Acta Bot. Hung. 49: 305–310., 2007
Stranczinger, Sz., Borhidi, A., Szentpéteri, J.L. & Jakab, F.: The phylogenetic relationships among some Randia (Rubiaceae) taxa., Acta Biol. Hung. 58: 235–244, 2007
Borhidi, A.: Una espécie nueva del género Chiococca P. Browne (Rubiaceae) de Guatemala., Acta Bot. Hung. 49: 115–117., 2007
Borhidi, A. & Reyes-García A.: Estudios sobre Rubiáceas Mexicanas XV. Una espécie nueva del género Guettarda de Chiapas., Acta Bot. Hung. 49: 111–113., 2007
Borhidi, A. García-Gonzalez, I. & Martinez Salas E.: Estudios sobre Rubiáceas Mexicanas XIV. Tres taxa nuevos del género Randia L., Acta Bot. Hung. 49: 105–109., 2007
Borhidi, A., Martínez Salas E. & Saynes, A.: Estudios sobre Rubiáceas Mexicanas XIII. Dos especies nuevas del género Deppea Cham. Et Schltdl., Acta Bot. Hung. 49: 99–103., 2007
Borhidi, A. & Lozada L.: Estudios sobre Rubiáceas Mexicanas XII. El género Mitracarpus Zucc ex Schult. et Schult. f. (Spermacoceae) en México., Acta Bot. Hung. 49: 81-98., 2007
Borhidi, A. & Reyes-García A.: Estudios sobre Rubiáceas Mexicanas XI. Revisión del género Csapodya Borhidi (Rondeletieae) endémico de Chiapas con tres especies., Acta Bot. Hung. 49: 67–79., 2007
Borhidi, A.: Resinanthus, género nuevo de Rubiaceae (Guettardeae)., Acta Bot. Hung. 49: 311–317., 2007
Borhidi, A. & N. Diego-Pérez: Flora de Guerrero. Vol. 35. Coussareae, Gardenieae, Hedyotideae, Mussendeae, Naucleae, Rondeletieae (Rubiaceae)., Fac de Ciencias, UNAM. 1–122., 2008
Borhidi, A.: Revalidation of the genus Tournefortiopsis Rusby (Guettardeae) and a new Guettarda from Costa Rica., Acta Bot. Hung. 50: 61-70., 2008
Borhidi, A.: Taxa et combinationes novae Florae Antillanae., Acta Bot. Hung. 50: 275-280., 2008
Borhidi, A. & Lorea-Hernández, F. G.,: Estudios sobre Rubiáceas Méxicanas XVI. Psychotria lozadae, una especie nueva en la flora del estado Guerrero., Acta Bot. Hung. 50: 281-285., 2008
Borhidi, A. & Salas-Morales, S.: Estudios sobre Rubiáceas Méxicanas XVII. Dos especies nuevas en el género Hoffmannia Sw. (Rubiaceae, Hamelieae)., Acta Bot. Hung. 50: 287-292., 2008
Borhidi, A. & Salas-Morales, S.: Estudios sobre Rubiáceas Méxicanas XVIII. Una nueva especies del género Crusea Schltdl. et Cham. (Rubiaceae, Spermacoceae)., Acta Bot. Hung. 50: 293-296., 2008
Borhidi, A., Martinez-Salas, E. & Salas-Morales, S.: Estudios sobre Rubiáceas Méxicanas XX. Cuatro especies nuevas del género Bouvardia (Spermacoceae) de Oaxaca y Chiapas., Acta Bot. Hung. 50: 305-314., 2008
Borhidi, A.: La familia Rubiaceae en la Flora de Cuba enfocada a los estudios moleculares., VIII. Congreso de Botánica Internacional de Cuba, La Habana, 28 Jun. – 5 Jul., 2008
Borhidi A, Darók, J., Kocsis, M. & Stranczinger, S.: The taxonomy of Rondeletia L. and its allied genera., IV Intern. Symp. of Rubiaceae, Xalapa, México, 18-25 Oct., 2008
Borhidi, A. & N. Diego-Pérez,: Estudios sobre Rubiaceas Mexicanas XXI. Una nueva especies de Arachnothryx Planch. (Rondeletieae) en Guerrero., Acta Bot. Hung. 51: 11-14., 2009
Borhidi, A. & S. Salas-Morales,: Estudios sobre Rubiáceas Mexicanas XXII. Psychotria oaxacensis sp. n. y Chomelia crassifolia nueva para Oaxaca., Acta Bot. Hung. 51: 15-20., 2009
Borhidi, A. & S. Salas-Morales,: Estudios sobre Rubiáceas Mexicanas XXIII. Dos especies nuevas del género Randia L. en Oaxaca., Acta Bot. Hung. 51: 21-26., 2009
Borhidi, A. & I. García-González,: Estudios sobre Rubiáceas Mexicanas XXIV. Contribuciones al conocimiento de Randia lanuginosa Borhidi & I. García-González., Acta Bot. Hung. 51: 27-28., 2009
Galambos, A., Stranczinger, Sz., & Borhidi, A.: Génusz- és fajszintű molekuláris filogenetikai vizsgálatok a Rubiaceae család Hamelieae szekciójában., VIII. Magyar Genetikai Kongresszus XV. Sejt- és Fejlődésbiológiai Napok Nyíregyháza. 2009. ápr. 17-19. Poszter (PG21). Összefoglalók p. 109-110., 2009
Borhidi, A. y K. Velasco-Gutierrez: Estudios sobre Rubiaceas Mexicanas XXV. Una especie nueva en el género Omiltemia Standl. (Hamelieae)., Acta Bot. Hung. 52:35–39., 2010
Borhidi, A. y K.Velasco-Gutierrez: Estudios sobre Rubiáceas Mexicanas XXVI. Paradeppea sect. nova del género Deppea Cham. & Schltdl. (Hamelieae) y dos espcies nuevas de Oeste de Oaxaca., Acta Bot. Hung. 52: 41–48., 2010
Borhidi, A., .E. Martínez-Salas, y S. Salas-Morales: Estudios sobre Rubiáceas Mexicanas XXVII. Una revisión breve y cuatro espécies nuevas del género Deppea (Hamelieae)., Acta Bot. Hung. 52:49–65., 2010
Borhidi, A. & L. Lozada-Pérez: Martensianthus nomen novum to replace Neomartensia Borhidi et Lozada-Pérez 2010 (Rubiaceae) non Yoshida et Mikami 1996 (Delesseriaceae)., Acta Bot. Hung. 53: 37–42., 2010
Stranczinger Sz., Galambos A., Borhidi A.: Phylogenetic Study On Genus and Species Level of the Deppea Complex (Hamelieae Section)., The Fifth International Rubiaceae and Gentianales Conference Stockholm, Sweden. Abstracts 58. p., 2010
Borhidi, A. & Fernández-Zequeira, M.: Una Rondeletia nueva an Sur-Oriente de Cuba., Acta Bot. Hung. 53: 269–271., 2011
Borhidi, A.: Estudios sobre Rubiáceas Mexicanas XXXV Chiococca motleyana nomen novum., Acta Bot. Hung. 53: 267–268., 2011
Borhidi, A.: Estudios sobre Rubiáceas Mexicanas XXXIV. Hoffmannia silviarum spec nova y una variedad nueva (Hamelieae)., Acta Bot. Hung. 53: 261–266., 2011
Borhidi, A.: Estudios sobre Rubiáceas Mexicanas XXXIII. Tres especies nuevas del género Deppea Schltdl. et Cham. (Hamelieae)., Acta Bot. Hung. 53: 251–260., 2011
Borhidi, A.: Transfer of the Mexican species of Psychotria subgen. Heteropsychotria to Palicourea based on morphological and molacular evidences., Acta Bot. Hung. 53: 241–250., 2011
Borhidi, A.: Dos especies nuevas en la flora de Hispaniola., Acta Bot. Hung. 53: 235–239., 2011
Stranczinger, Sz., Galambos, A., Borhidi A.: Molekuláris filogenetikai vizsgálatok újabb eredményei a Deppea (Rubiaceae, Hamelieae) nemzetségben., IX. Magyar Genetikai Kongresszus XVI. Sejt- és Fejlődésbiológiai Napok Siófok. 202. o, 2011
Borhidi, A., Darók, J. & Stranczinger, Sz.: Donnellyanthus, (Rubiaceae, Rondeletieae) a new genus int he Flora of Mexico and Meso-America., Acta Bot. Hung. 53(3-4) in print., 2011
Borhidi, A., E. Martínez-Salas & S. Salas-Morales: Estudios sobre Rubiáceas Mexicanas XXXII. Dos especies nuevas de Bouvardia Salisb. Con revisión corta del subgen. Bouvardioides Schltdl., Acta Bot. Hung. 53(1-2): 75–84., 2011
Borhidi, A., L. Lozada-Pérez & S. Salas-Morales: Estudios sobre Rubiáceas Mexicanas. XXXI. Trichosiphon y Gymnosiphon Borhidi, sect nov. Subgen. Bouvardiastrum (Bouvardia Salisb.) con seis especies nuevas., Acta Bot. Hung. 53(1-2): 53–73., 2011
Borhidi, A. & E. Martínez-Salas: Estudios sobre Rubiáceas Mexicanas XXX. Tres especies nuevas y un nombre nuevo en el género Randia., Acta Bot. Hung. 53(1-2): 43–52., 2011
Borhidi, A. & Fonseca R-M.: Una subespecie nueva de la Psychotria horizontalis Sw., Acta Bot. Hung. 54: (3-4) 47-51, 2012
Borhidi, A.,: Bouvardia pascualii spec. nova (sect. Gymnosiphon, Rubiaceae) en Oaxaca, México, Acta Bot. Hung. 54: (3-4) 41-46., 2012
Borhidi, A, & Stranczinger, Sz.: Deppeopsis, un género nuevo (Hamelieae, Rubiaceae)de México y Guatemala., Acta Bot. Hung. 54: 85–90., 2012
Borhidi, A & Stranczinger, Sz.: Combinaciones nuevas en la familia Rubiaceae de la flora de México., Acta Bot. Hung. 54: 81–84., 2012
Borhidi, A. & Martínez-Salas, E.: Estudios sobre Rubiáceas Mexicanas XXXIX. Dos especies nuevas de Didymaea Hook.f. y una especie nueva de Mitracarpus Zucc et Schult. et Schult.f. in Roem. et Schult. (Spermacoceae), Acta Bot. Hung. 54: 73–79., 2012
Borhidi, A.: Földindulás vagy földosztás? A molekuláris filogenetikai növény rendszerek fejlődése napjainkig. – „ Egy új korszak kezdetén...” Molekuláris biológiai módszerek az ökológiai és taxonómiai kutatás szolgálatában., MTA Közgyűlési előadások 2012. május 14., 2012
Borhidi, A. & Martínez-Salas E.: Estudios sobre Rubiáceas Mexicanas XXXVIII. Una especie nueva más de Deppea Schltdl. (Hamelieae) de Oaxaca., Acta Bot. Hung. 54: 67–71., 2012
Borhidi, A., Martínez-Salas, E. & Salas-Morales, S.: Estudios sobre Rubiáceas Mexicanas XXXVII. Dos especies nuevas del género Randia L (Gardenioideae) en Oaxaca y Veracruz., Acta Bot. Hung. 54: 59–66., 2012
Borhidi, A. & Velasco-Gutierrez, K.: Estudios sobre Rubiáceas Mexicana XXXVI. Dos especies nuevas en el género Rogiera Planch. (Rondeletieae), Acta Bot. Hung. 54: 51–58., 2012
Borhidi, A.: Terrellianthus género nuevo (Spermacoceae, Rubiaceae) para México y Meso-América., Acta Bot. Hung. 54: 45–49., 2012
Borhidi, A.: Rubiáceas de México. Seguda y ampliada edición., Akadémiai Kiadó, Budapest. 610 pp., 2012
Borhidi, A. y K. Velasco-Gutierrez: Estudios sobre Rubiaceas Mexicanas XXV. Una especie nueva en el género Omiltemia Standl. (Hamelieae)., Acta Bot. Hung. 52:23–27., 2010
Borhidi, A. y K. Velasco-Gutierrez: Estudios sobre Rubiáceas Mexicanas XXVI. Paradeppea sect. nova del género Deppea Cham. & Schltdl. (Hamelieae) y dos espcies nuevas de Oeste de Oaxaca., Acta Bot. Hung. 52: 29–36., 2010
Borhidi, A., .E. Martínez-Salas, y S. Salas-Morales: Estudios sobre Rubiáceas Mexicanas XXVII. Una revisión breve y cuatro espécies nuevas del género Deppea (Hamelieae)., Acta Bot. Hung. 52:37–53., 2010
Borhidi, A.: Estudios sobre rubiáceas mexicanas XXVIII. El género Coussarea Aubl. (Coussareae) en México con dos especies nuevas., Acta Bot. Hung. 52: 67-76., 2010
Borhidi, A.y S. Salas-Morales: Estudios sobre Rubiáceas Méxivanas XXIX. Arachnothryx sanchezii (Guettardeae) y Bouvardia mitlensis (Spermacoceae) nuevas especies de Oaxaca., Acta Bot. Hung. 52:77-84., 2010
A.Borhidi, E. Martinez S. y J. Linares: Una especie nueva de Rudgea Salisb. (Rubiaceae, Psychotrieae) de Honduras., Acta Bot. Hung. 52:85-88., 2010
Borhidi, A. & Lozada-Pérez, L.: Neomartensia (Spermacoceae, Rubiaceae) género nuevo de México. O la posición final del vagabundo Declieuxia galeottii M. Martens., Acta Bot. Hung. 52 (3-4): 251–264, 2010
Borhidi, A. & L. Lozada-Pérez: Martensianthus nomen novum toreplace Neomartensia Borhidi et Lozada-Pérez 2010 (Rubiaceae) non Yoshida et Mikami 1996 (Delesseriaceae)., Acta Bot. Hung. 53(1-2): 37–42, 2010
Borhidi, A. & L. Lozada-Pérez: Neomartensia (Spermacoceae, Rubiaceae): género nuevo de México., Vth Intern. Rubiaceae and Gentianales Conf., Stockholm, 6–10 September, Abstracts, p. 26., 2010
Borhidi, A. & Serrano-Cárdenas, V.: Estudios sobre Rubiáceas Méxicanas XIX. Novedades en el Herbário de Querétaro “Dr. Jerzy Rzedowski” (QMEX)., Acta Bot. Hung. 50: 297-303., 2008
Stranczinger,Sz., Galambos, A. & Borhidi, A.: Phylogenetic study on genus and species levele on the Deppea complex (Hamelieae section)., Vth Intern. Rubiaceae and Gentianales Conf., Stockholm, 6–10 September, Abstracts, p. 58., 2010
Borhidi, A. & Diego-Pérez, N.: Flora de Guerrero. No. 41. Crusea (Spermacoceae, Rubiaceae)., Fac. de Ciencias, UNAM. 1–43., 2010
Stranczinger Sz., Szalontai, B., Galambos, A., & Borhidi, A.: A Deppea-komplex (Rubiaceae, Hamelieae) szövedékének integratív filogenetikai felfejtése., „ Egy új korszak kezdetén...” Molekuláris biológiai módszerek az ökológiai és taxonómiai kutatás szolgálatában. MTA Közgyűlési előadások 2012. május 14., 2012
Borhidi, A., Darók, J., Stranczinger, Sz., Martínez Salas, E., & Ramos, H. C.: molekuláris filogenetikai és morfometriai kutatások kölcsönhatásainak néhány eredménye a Boraginaceae és a Rubiaceae családban., „ Egy új korszak kezdetén...” Molekuláris biológiai módszerek az ökológiai és taxonómiai kutatás szolgálatában. MTA Közgyűlési előadások 2012. május 14., 2012



Back »