gene expression, signal transduction, gene duplication, stress response
Discipline
Cell biology and molecular transport mechanisms (Council of Medical and Biological Sciences)
100 %
Panel
Publications Panel
Department or equivalent
Institute of Plant Biology (HUN-REN Biological Research Centre Szeged)
Starting date
2009-01-01
Closing date
2009-03-31
Funding (in million HUF)
0.285
FTE (full time equivalent)
0.00
state
closed project
Summary in Hungarian
A RHO GTP-áz aktivált kináz kaszkádok élesztő és állati sejtekben jól jellemzettek és számos alapvető sejt folyamatban szerpet játszanak. Hasonló RHO-kináz jelátviteli lépés növényekben még eddig nem volt ismert. Kutatócsoportunkban elsők között azonosítottunk a növényi RHO GTPázokkal kölcsönható növényi kinázokat. Ezek egy növény specifikus család, az RLCK VI kináz család tagjai. Közleményünkben ezt a családot (14 tag) jellemeztük Arabidopsisban elsősorban szerkezetük és gén expressziós mintázatuk alapján. A családot két csoportra osztottuk és új nomenklaturát javasoltunk. Kiemeltük a génduplikáció szerepét a család kialakulásában és a génkifejeződési mintázatok szétválásában. Ezek az első publikált adatok ezekkel a kinázokkal kapcsolatban. Közleményünket egy alapnak tekintjük, amire a fehérjecsalád és a jelátviteli lépés további kutatása során építhetünk.
Summary
RHO GTPase-mediated signaling through kinase cascades is well known in yeast and animal cells but not yet demonstrated in plants. In our laboratory we could identify RHO GTPase-interacting plant kinases belonging to a plant-specific protein family RLCK Class VI. In our publication we report the basic characterization of this family (14 members) in Arabidopsis. This characterization includes structural and phylogenetic classification into two groups and gene expression profiling. We emphasized the role of gene duplication in the evolution of the kinase family and the diversification of the expression patterns. These are the first published data on this family. We aimed to provide a basic report to support further research on this specific family and on this new signaling step.
Final report
Results in Hungarian
A RHO GTP-áz aktivált kináz kaszkádok élesztő és állati sejtekben jól jellemzettek és számos alapvető sejt folyamatban szerpet játszanak. Hasonló RHO-kináz jelátviteli lépés növényekben még eddig nem volt ismert. Kutatócsoportunkban elsők között azonosítottunk a növényi RHO GTPázokkal kölcsönható növényi kinázokat. Ezek egy növény specifikus család, az RLCK VI kináz család tagjai. Közleményünkben ezt a családot (14 tag) jellemeztük Arabidopsisban elsősorban szerkezetük és gén expressziós mintázatuk alapján. A családot két csoportra osztottuk és új nomenklaturát javasoltunk. Kiemeltük a génduplikáció szerepét a család kialakulásában és a génkifejeződési mintázatok szétválásában. Ezek az első publikált adatok ezekkel a kinázokkal kapcsolatban. Közleményünket egy alapnak tekintjük, amire a fehérjecsalád és a jelátviteli lépés további kutatása során építhetünk.
A pályázott közlemény megjelent:
Jurca ME, Bottka S, Feher A
Characterization of a family of Arabidopsis receptor-like cytoplasmic kinases (RLCK class VI)
PLANT CELL REP 27: (4)739-748 (2008)
IF: 1.974
Results in English
RHO GTPase-mediated signaling through kinase cascades is well known in yeast and animal cells but not yet demonstrated in plants. In our laboratory we could identify RHO GTPase-interacting plant kinases belonging to a plant-specific protein family RLCK Class VI. In our publication we report the basic characterization of this family (14 members) in Arabidopsis. This characterization includes structural and phylogenetic classification into two groups and gene expression profiling. We emphasized the role of gene duplication in the evolution of the kinase family and the diversification of the expression patterns. These are the first published data on this family. We aimed to provide a basic report to support further research on this specific family and on this new signaling step.
The article got published as below
Jurca ME, Bottka S, Feher A
Characterization of a family of Arabidopsis receptor-like cytoplasmic kinases (RLCK class VI)
PLANT CELL REP 27: (4)739-748 (2008)
IF: 1.974
Jurca ME, Bottka S, Feher A: Characterization of a family of Arabidopsis receptor-like cytoplasmic kinases (RLCK class VI), PLANT CELL REP 27: (4)739-748, 2009