Determination of the inhibitory mechanism for the P1 silencing suppressor of the Sweet potato mild mottle virus and characterization of its closest homologue, the P1 protein of the Sweet potato feathery mottle virus
A Sweet potato mild mottle virus P1 silencing szupresszor és legközelebbi rokona, a Sweet potato feathery mottle virus P1 fehérje pontos működési mechanizmusának meghatározása
Title in English
Determination of the inhibitory mechanism for the P1 silencing suppressor of the Sweet potato mild mottle virus and characterization of its closest homologue, the P1 protein of the Sweet potato feathery mottle virus
Horticulture (Council of Complex Environmental Sciences)
50 %
Ortelius classification: Gardening
Plant breeding (Council of Complex Environmental Sciences)
25 %
Crop protection (Council of Complex Environmental Sciences)
25 %
Ortelius classification: Crop protection
Panel
Complex agricultural sciences
Department or equivalent
Agricultural Biotechnology Institute (ABC) (National Agricultural Research and Innovation Centre)
Participants
Domokos, Klarissza Szabó, Edit Zsuzsanna
Starting date
2010-02-01
Closing date
2014-01-31
Funding (in million HUF)
6.307
FTE (full time equivalent)
1.82
state
closed project
Summary in Hungarian
Az RNS silencing egy olyan, a legtöbb eukariótában meglévő mechanizmus, ami képes a duplaszálú RNS-ek érzékelésére, és a megfelelő egyszálú RNS-ek szekvenciaspecifikus lebontására. Az RNS silencing lehetséges funkciója sokrétű, részt vesz a kromoszómák heterokromatikus régióinak kialakításában, a fejlődési program szabályozásában és antivirális szerepe is jelentős. A növényi virusok replikációjuk során hatékonyan indukálják az RNS silencing-et, azonban a vírusok RNS silencing szupresszoraik segítségével képesek a növényi antivirális válasz semlegesítésére. Korábbi munkáink során jellemeztünk több olyan silencing szuppresszort, ami az RNA induced silencing complex (RISC) kialakulását gátolja. Ezen szupresszor stratégia ellen az inverted repeat (IR) expresszáltatása hatékony antivirális védelmet nyújt. Ezzel szemben, a Sweet potato mild mottle vírus (SPMMV) P1 fehérjéje az eddig ismert egyetlen szupresszor, ami az aktív RISC mediálta RNS silencing-et gátolja. Tervezett munkánk során célul tűztük ki a P1 fehérje pontos működési mechanizmusának megismerését. Továbbá, szeretnénk az SPMMV P1 működését összehasonlítani, az egyetlen ismert homologjával, a Sweet potato feathery mottle virus (SPFMV) P1 fehérjéjével. Az aktív RISC-et gátló szupresszorok és a RISC felépülésért gátló (korábbi munkáink) szupresszorok működési mechanizmusnának ismeretében lehetővé válik olyan növények kialakítása, amelyek védettek lehetnek mindkét silencing szupresszor stratégiával szemben.
Summary
RNA silencing is a posttranscriptional sequence specific RNA degradation mechanism that serves as the major antiviral system in plants. Viral silencing suppressors were evolved to counteract with RNA silencing. RNA silencing could be inhibited at the level of RISC assembly and the level of the effector step (active RISC) by plant viral silencing suppressors. During our previous work, we found and characterized several viral silencing suppressors, which inhibit RISC assembly by sequestering viral siRNAs. Expression of an inverted repeat in the plant confers efficient protection against viruses having a suppressor strategy, which inhibits RISC assembly. However, our recent work shed the light on the silencing suppressor of the Sweet potato mild mottle virus (SPMMV), which inhibits active (assembled) RISC, but its exact inhibitory mechanism is not yet known. As a continuation of our work, we would like to characterize the P1 silencing suppressor protein of SPMMV and its only known homologue, the P1 protein of the Sweet potato feathery mottle virus (SPFMV) to understand their inhibitory mechanisms in depth. Together with our earlier results, the outcome of our project proposal will contribute to our understanding of the yet known plant viral silencing suppressor strategies. Thus based on this knowledge, we will be able to invent and test different strategies to amour crop plants against plant viruses having even any of the known silencing suppressor strategies.
Events of the project
2014-01-02 14:50:29
Kutatóhely váltás
A kutatás helye megváltozott. Korábbi kutatóhely: (Nemzeti Agrárkutatási és Innovációs Központ), Új kutatóhely: Mezőgazdasági Biotechnológiai Kutatóintézet (Nemzeti Agrárkutatási és Innovációs Központ).
