Molekuláris genetika, reverz genetika, RNS-interferencia (Orvosi és Biológiai Tudományok Kollégiuma)
70 %
Mikrobiológia: virológia, bakteriológia, parazitológia, mikológia (Orvosi és Biológiai Tudományok Kollégiuma)
30 %
zsűri
Genetika, Genomika, Bioinformatika és Rendszerbiológia
Kutatóhely
TTK Genetikai és Alkalmazott Mikrobiológiai Tanszék (Debreceni Egyetem)
résztvevők
Szilágyi Zsolt
projekt kezdete
2007-07-01
projekt vége
2011-12-31
aktuális összeg (MFt)
17.179
FTE (kutatóév egyenérték)
0.77
állapot
lezárult projekt
magyar összefoglaló
Az elmúlt két évtizedben számos új sejtciklus-gént írtunk le. A sep1 és az ace2 transzkripciós faktorokat kódolnak, amelyek számos M-fázis- és citokinezis-gén transzkripciójához kellenek. A sep10/MED31, amely inaktiválása citokinezis-defektussal jár, a Mediátor-komplex alegységét kódolja. A tervezett munka fő céljai (1) a Sep10 által kontrollált gének identifikálása a S. pombe genomjában, (2) a köztük előforduló, még ismeretlen citokinezis-gének megtalálása és (3) a Sep10 fehérje funkcionális kölcsönhatásainak vizsgálata a Sep1 és az Ace2 transzkripciós faktorokkal.
angol összefoglaló
Over the last two decades we have described numerous novel cell cycle genes. sep1 and ace2 turned out to act as transcription factors of many M-phase and cytokinesis genes. sep10/MED31, whose inactivation causes defective cytokinesis, encodes a subunit of the Mediator complex, a major regulator of transcription. The aims of the proposed project are (i) to identify all Sep10-dependent genes in the Sch. pombe genome, (ii) to find novel cytokinesis genes among them and (iii) to investigate the interactions between the Sep10 protein and the transcription factors Sep1 and Ace2.
Zárójelentés
kutatási eredmények (magyarul)
Az elmúlt két évtizedben számos új sejtciklus-gént írtunk le. A sep1 és az ace2 transzkripciós faktorokat kódolnak, amelyek számos M-fázis- és citokinezis-gén transzkripciójához kellenek a Schizosaccharomyces pombe-ben. A sep10/MED31, amely inaktiválása citokinezis-defektussal jár, a Mediátor-komplex alegységét kódolja. A Mediátor egy általános transzkripciós faktor. Ebben a projektben azokat a géneket identifikáltuk a S. pombe genomjában, amelyek transzkripciójához szükséges a Sep10 protein aktivitása. A gének között találtunk újabb citokinezis géneket is, de sem a sep1 sem az ace2 nem bizonyult Sep10-függőnek. Az utóbbi eredményből arra következtettünk, hogy a Sep10 koaktivátorként működhet együtt az Ace2-vel a citokinezis-gének promóterein. Kiderítettük, hogy a SAGA komplex egyik alegységét képviselő Sep9 fehérje a citokinezist két szinten is regulálja: mint az ace2 transzkripciójának szabályzója és mint az Ace2 fehérjével együttműködő koaktivátor a citokinezis-gének promóterein. Észrevettük, hogy a Kin1 kináz részt vesz a citokinezis végén lejátszódó sejtszeparáció finom-hangolásában. Végül a citokinezisben szereplő egyes fehérjékkel filogenetikai analízist is végeztünk, amiből kiderült, hogy a Schizosaccharomyces fehérjék egy különálló evolúciós ágat alkotnak a gombák birodalmában.
kutatási eredmények (angolul)
Over the last two decades we have described numerous novel cell cycle genes. The products of sep1 and ace2 turned out to act as transcription factors of many M-phase and cytokinesis genes in Schizosaccharomyces pombe. sep10/MED31, whose inactivation causes defective cytokinesis, encodes a subunit of the Mediator complex, a major regulator of transcription. In this project we identified genes in the S. pombe genome that require active Sep10 protein for being transcribed and found novel cytokinesis genes among them. Neither sep1 nor ace2 are among the controlled genes, indicating that the Sep10 protein may act as a coactivator of ace2 at the promoters of the cytokinesis genes. We revealed that the SAGA-complex subunit Sep9 regulates the cytokinesis genes at two levels: as the regulator of ace2 and as a coactivator cooperating with Ace2 at the promoters of the cytokinesis genes. We noticed that the Kin1 kinase is involved in the fine-tuning of the cell separation machinery at the end of cytokinesis. Finally we performed a phylogenetic analysis of certain components of the cytokinetic machinery and found that the Schizosaccharomyces proteins represent a unique evolutionary lineage in the Kingdom of Fungi.
Miklos, I., Szilagyi, Z., Watt, S., Zilahi, E., Batta, G., Antunovics, Z., Enczi, K., Nagy, R., Szaszi, E., Bahler, J., Sipiczki, M.: Transcriptional regulation in Schizosaccharomyces pombe cells., Acta Microbiol Immunol. Hung. 54:83-84, 2007
Szilagyi, Z., Linder, T., Miklos, I., Batta, G., Sipiczki, M., Gustafsson, C.M.: The role of the Mediator complex in the regulation of cell separation., Fourth International Fission Yeast Meeting, Copenhagen, p.: 257, 2007
Sipiczki, M.: The end is the beginning: cell separation after cytokinesis. . Power of Microbes in Industry and Environment., Central European Symposium on Industrial Microbiology and Microbial Ecology. Zadar, Croatia. Programme and Abstracts, 2007
Sipiczki, M.: Splitting of the Schizosaccharomyces septum., 37th Annual Conference on Yeasts. Smolenice, Slovakia. Program and Abstracts, p. 53, 2009
Sipiczki, M.,: Septum splitting, The 5th Int. Fission Yeast Meeting, Tokyo, Japan, Abstract Book p. 73, 2009
Munoz, J., Sipiczki, M., Cortes, J.C.G., Moreno, B., Ramos, M., Clemente-Ramos, J.A., Duran, A., Ribas, J.C.: .: The glucan synthase Bgs4 is essential for secondary septum synthesis and primary septum stability., The 5th Int. Fission Yeast Meeting, Tokyo, Japan, Abstract Book p. 256, 2009
Miklos, I., Sipiczki, M.: A nucleotide substitution (spl1-1) in the internal promoter of the proline tRNA-CGG gene causes a cell separation defect., The 5th Int. Fission Yeast Meeting, Tokyo, Japan, Abstract Book p. 276, 2009
Madar, A., Balazs, A., Banyai, G., Batta, G., Gyuricza, K., Miklos, I., Sipiczki, M.: Interspecific complementation of mutations in genes coding for regulators of cell separation in S. pombe., The 5th Int. Fission Yeast Meeting, Tokyo, Japan, Abstract Book p. 277, 2009
