A new combined spectroscopic and molecular modeling approach to folding and assembly of membrane proteins  Page description

Help  Print 
Back »

 

Details of project

 
Identifier
112716
Type K
Principal investigator Páli, Tibor László
Title in Hungarian Membránfehérjék gombolyodásának és szerveződésének vizsgálata spektroszkópiai és molekula modellező módszerek újszerű, kombinált alkalmazásával
Title in English A new combined spectroscopic and molecular modeling approach to folding and assembly of membrane proteins
Keywords in Hungarian biofizika, membrán fehérje, fehérje gombolyodás, biomembrán, lipid-fehérje kölcsönhatás, spin labeling, EPR, ESR, FTIR, fluoreszcencia, spektroszkópia, kalorimetria, molekula modellezés
Keywords in English biophysics, membrane protein, protein folding, biomembrane, lipid-protein interaction, spinjelzés, EPR, ESR, FTIR, fluorescence, spectroscopy, calorimetry, molecular modeling
Discipline
Biophysics (e.g. transport mechanisms, bioenergetics, fluorescence) (Council of Medical and Biological Sciences)75 %
Ortelius classification: Molecular biophysics
Biophysics (Council of Physical Sciences)25 %
Panel Molecular and Structural Biology and Biochemistry
Department or equivalent Institute of Biophysics (HUN-REN Biological Research Centre Szeged)
Participants Kóta, Zoltán
Sebőkné Nagy, Krisztina
Starting date 2015-01-01
Closing date 2019-12-31
Funding (in million HUF) 28.866
FTE (full time equivalent) 6.55
state closed project
Summary in Hungarian
A kutatás összefoglalója, célkitűzései szakemberek számára
Itt írja le a kutatás fő célkitűzéseit a témában jártas szakember számára.

Eltérő szerkezeti osztályba tartozó membránfehérjék gombolyag szerkezetét, membránba épülését és szerveződését fogjuk tanulmányozni funkcionális állapotukban. Az egyik, transz-membrán hélix típusú, fehérje a vakuóláris proton-ATPáz (V-ATPáz) enzimnek, egy membránba épített molekuláris motornak, a membránban elhelyezkedő rotorját alkotó c alegysége, amely hexamer gyűrűs szerkezetet formál a V-ATPázban. A másik fehérje család a baktériumok külső membránjában található béta-hordó fehérjék, amelyek kristályosított állapotban a szalagszámtól függő átmérőjű transz-membrán pórus szerkezetet formálnak. A működőképes szerkezetek kialakulásának és a monomerek membránbeli szerveződésének folyamata egyik esetben sem ismert, mint ahogy nagy felbontású adatok sincsenek a működő struktúrákról. Új módszerünk a spektroszkópián alapuló funkcionális szerkezetbiológia, amelynek lényege, hogy spektroszkópiai módszerekkel szerkezeti adatokat gyűjtünk a gombolyodás folyamatáról és a funkcionális szerkezetről, amelyet mindkét esetben a membráncsatorna funkcióval fogunk ellenőrizni. Ezen adatok és szekvencia alapú predikciók kombinálásával molekula modelleket építünk, amelyek jóval megbízhatóbbak és a funkció szempontjából relevánsabbak lesznek, mint a tisztán szekvencia alapú szerkezeti predikciók. Módszerünk továbbfejlesztve más membránfehérjék szerkezeti predikciójára is alkalmas lesz. Célunk tehát módszerfejlesztés és két fontos fehérjecsalád szerkezetének vizsgálata. A projekt sikerét valószínűsíti az alkalmazott spektroszkópiai technikák, molekulamodellezés, és a membránok és membránfehérjék (azon belül a két fehérjecsalád) kutatása területén felhalmozott sokéves tapasztalatunk.

Mi a kutatás alapkérdése?
Ebben a részben írja le röviden, hogy mi a kutatás segítségével megválaszolni kívánt probléma, mi a kutatás kiinduló hipotézise, milyen kérdéseket válaszolnak meg a kísérletek.

A projekt a fehérjék gombolyodásának elméleti problémájához kapcsolódik: pusztán az aminosav sorrendje alapján megjósolható-e egy fehérje szerkezete? Jelenleg nem ismert a válasz. A praktikus kérdés inkább az, hogy milyen pótlólagos kísérleti szerkezeti adat lehet szükséges és elegendő? Ez fundamentális kérdés a (bio)fizikában, molekuláris- és szerkezetbiológiában, biokémiában és bioinformatikában egyszerre, mert a fehérjék szerkezetének meghatározása nehéz és költséges folyamat. Hipotézisünk az, hogy egy-egy membránfehérje vázszerkezetét a szekvenciája egyértelműen kódolja abban a környezetben, amelyben az adott fehérje működik. Ezért ha a működő fehérjéről gyűjtünk akár alacsony felbontású szerkezeti adatokat, esetünkben spektroszkópiai módszerekkel, akkor a szekvencia és szerkezet közötti korreláció jobban megragadható, mint pl. kristályosítással, azaz idegen környezetben és nem működő fehérjéről kapott szerkezet esetén. Ezt a spektroszkópiára alapozott funkcionális szerkezetbiológiai megközelítésünket már sikerrel alkalmaztuk "kézi" úton több membránfehérje esetén. Ebben a projektben számítógépes módszert fejlesztünk ki a hatékonyabb, pontosabb szerkezetjóslásra. A módszert két eltérő típusú membránfehérjéről kapott szerkezeti adatok felhasználásával fogjuk kidolgozni. A projekt várható eredményei: egy spektroszkópiai-modellező módszercsomag membránfehérjék funkcionálisan releváns, legalább aminosav felbontású térszerkezetének meghatározására, továbbá ismerni fogjuk a V-ATPáz rotorjának, a c-gyűrűnek, valamint eltérő szalagszámú béta-hordó fehérjéknek az alapvető csatorna funkciót produkálni képes szerkezetét.

Mi a kutatás jelentősége?
Röviden írja le, milyen új perspektívát nyitnak az alapkutatásban az elért eredmények, milyen társadalmi hasznosíthatóságnak teremtik meg a tudományos alapját. Mutassa be, hogy a megpályázott kutatási területen lévő hazai és a nemzetközi versenytársaihoz képest melyek az egyediségei és erősségei a pályázatának!

Az életfolyamatokban, betegségekben főszerepet játszó fehérjék, legalább aminosav felbontású vázszerkezetének ismerete feltétlenül szükséges ahhoz, hogy működésüket megértsük és azt befolyásolni tudjuk, pl. célzottan tervezett és szinetizált gátló, serkentő anyagokkal, gyógyszerekkel. Fontosságuk miatt a membránfehérjék esetében mostanában nagyon megnőtt a funkcionálisan releváns szerkezeti adatok iránti igény. A membránfehérjék sokkal kisebb arányban fordulnak elő a szerkezeti adatbázisokban, mint az ismert genomokban, azaz jelentőségükhöz mérten kevésnek ismerjük a szerkezetét. Ennek oka, hogy a klasszikus szerkezetbilógiai eljárások (X-ray, NMR) kevésbé alkalmazhatóak esetükben, mert igen nehéz őket gombolyodott formában kristályosítani, szolubilizálni. Emellett a nem natív környezetben kapott szerkezetek funkcionális relevanciája mindig vitatható. Mindez alternatív eljárásokat sürget. Bármilyen módszer, amivel szignifikánsan gyorsítható és javítható a membránfehérjék szerkezeti predikciója, a tudományos fontossága mellett jelentős társadalmi és gazdasági haszonnal kecsegtet, külünösen a gyógyászatban és kozmetikai iparban. A jelen projekt a membránfehérjék szerkezeti predikciójában kíván előre lépni egy kombinált kísérleti-elméleti megközelítést alkalmazva, amely nem csak a projektben vizsgált - egyébként reprezentatív - membránféhérjékre, hanem más membránfehérjékre is alkalmazható lesz, amit egy web szerver segítségével teszünk majd lehetőve. További konkrét várható eredménye a projektnek, hogy jóval többet fogunk tudni a vizsgált membránfehérjék szerkezetéről és a szerkezet-funkció kapcsolatáról. Ennek pedig szintén közvetlen gyógyászati jelentősége van, hiszen a V-ATPáz szerepet játszik daganatok áttétképződésében és a csontritkulásban is, a beta-hordó fehérjék pedig a baktériumok külső membránjának pórusfehérjéi, amelyeken keresztül pl. antibiotikumok is bejutnak a baktériumba. Nem elhanyagolható erénye projektünknek, hogy a témavezetőn kívül minden résztvevő fiatal kutató. Ez kiváló lehetőséget biztosít ezen fiatalok karrier építésére, hiszen fundamentális, de gyakorlati alkalmazást igérő kutatási problémán fognak dolgozni egy olyan projektben, ami nemzetközi együttműködést is magában foglal.

A kutatás összefoglalója, célkitűzései laikusok számára
Ebben a fejezetben írja le a kutatás fő célkitűzéseit alapműveltséggel rendelkező laikusok számára. Ez az összefoglaló a döntéshozók, a média, illetve az érdeklődők tájékoztatása szempontjából különösen fontos az NKFI Hivatal számára.

Minden élő szervezetben kiemelt szerepet játszanak a fehérjék, amelyek elsődlegesen a 20-féle aminosavból eltérő számút tartalmazó, különbőző hosszúságú láncoknak tekinthetők. A fehérjék döntő többsége nem a kinyújtott lánc formában működik, hanem feltekeredett, gombolyodott formában. Gombolyag forma azonban olyan sokféle van, hogy a teljes evolúciónak sem volt elég ideje egy-egy közepes méretű fehérje összes gombolyag formáját "végig tesztelni". Mégis, ahhoz, hogy részleteiben megértsük egy-egy fehérje működését elengedhetetlen, hogy megismerjük azt a gombolyott szerkezetét, amiben működni képes. A klasszikus szerkezetmeghatározó technikák membránfehréjékre siralmas eredményt hoztak, ugyanis alkalmazásukhoz a membránfehérjét el kell távolítani természetes lipid környezetéből. Tehát bármilyen alternatív módszer, amivel javítható a membránfehérjék gombolyag formájának meghatározása óriási előrelépést jelentene minden olyan területen, ahol membránfehérjék fontos szerepet játszanak (pl. gyógyászat, kozmetikai ipar, biotechnológia). Projektünkben olyan új módszert fejlesztünk ki, amely működőképes membránfehérjéken mért különféle szerkezeti adatok felhasználásával számolja ki a gombolyag szerkezetét. A módszert egy web szerver segítségével is elérhetőve tesszük majd a tudományos közösség számára. További várható eredmény, hogy jóval többet fogunk tudni a vizsgált membránfehérjék szerkezetéről és így működéséről is. Ennek pedig direkt gyógyászati jelentősége van, hiszen az egyik fehérje szerepet játszik daganatok áttétképződésében és a csontritkulásban, a másik pedig a baktériumok külső membránjában képez pórust, amelyen keresztül antibiotikumok is bejutnak a baktériumba.
Summary
Summary of the research and its aims for experts
Describe the major aims of the research for experts.

The structure, membrane insertion and assembly of membrane proteins, belonging to different structural classes, will be studied in their functional state. The first protein, the trans-membrane helix type, is the subunit c of the rotor of the vacuolar proton-ATPase (V-ATPase), a membrane bound molecular motor. Subunit c forms a hexameric ring structure in V-ATPase. The second proteins, or protein family, are the beta-barrels found in the outer membrane of bacteria, forming (in their crystal structure) trans-membrane pores, with a diameter that depends on the number of their strands. No high resolution structural data are available for any of these proteins in their functional form. It is also not known how the functional structures are formed and how they assemble in the membrane. Our new approach is spectroscopy-based functional structure biology, in which different spectroscopic techniques will be used to collect structural data on the folding process and the functional structures, which will be verified with the pore function of both proteins, and these data will be used to build molecular models. These functionally relevant models will help understanding the functioning of these important membrane proteins. After enhancing it further, our approach will be suitable for predicting the structure of other membrane proteins. The basic aims of the proposal are the development of a new approach and structural studies on two important protein families. Success of the project is likely because of our extensive experience in the spectroscopic techniques, molecular modelling, and in membranes and membrane proteins, including the selected ones.

What is the major research question?
Describe here briefly the problem to be solved by the research, the starting hypothesis, and the questions addressed by the experiments.

The project relates to the theoretical problem of protein folding: is the sequence of a protein alone enough to predict the structure of its backbone, or fold? Since the answer is not yet known, a more practical question is: what kind of additional structural data is sufficient and necessary? This is a common fundamental question in (bio)physics, molecular and structure biology, biochemistry and bioinformatics, because it is a very challenging and expensive process to determine the structure of proteins. Our hypothesis is that the sequence of a protein unequivocally codes its fold in the environment in which the protein is functioning. Therefore even low resolution structural data on a functioning protein, obtained in our case with spectroscopic techniques, has stronger correlation with the sequence than high resolution (e.g., crystal) structures obtained in a foreign environment from a non-functioning protein. We have already applied our spectroscopy-based functional structure biology approach successfully "by hand" for a number of membrane proteins, and in this project we develop a computational approach for more efficient and more accurate structure predictions. The approach will be worked out using structural data on trans-membrane proteins belonging to different structural classes. At the end of the project we will have a suite of spectroscopic-modelling techniques for predicting the structure of membrane proteins, at least at residue resolution, that are functionally relevant. In addition, we will know the structures, capable of the basic pore functions, of the subunit c of the rotor of V-ATPase and beta-barrel proteins of different number of strands.

What is the significance of the research?
Describe the new perspectives opened by the results achieved, including the scientific basics of potential societal applications. Please describe the unique strengths of your proposal in comparison to your domestic and international competitors in the given field.

It is necessary to know the backbone structure, at least at residue resolution, of proteins playing important roles in life processes and diseases if we want to understand and affect their functioning with, e.g., specifically designed and synthesised inhibitors, stimulators, drugs. Due to their importance, the demand on functionally relevant structural data on membrane proteins has recently increased greatly. Membrane proteins are alarmingly under-represented among atomic protein structures in comparison with their presence in known genomes. In other words, in contrast to their importance, too few membrane protein structures are known. The reason is the difficulty in crystallising and solubilising them in a folded form, which is, however, needed for classical structure biology approaches (X-ray, NMR). In addition, the functional relevance of structures in a non-native environment is always debatable. Alternative approaches are needed. Any technique that promises faster and more accurate structure prediction of membrane proteins would yield significant social and economical benefits, especially in medicine and the cosmetics industry, in addition to its importance in basic research. The present proposal aims at enhancing structure predictions of membrane proteins with a combined experimental-theoretical approach, first to be applied on selected, representative membrane proteins, and then also on others, in the form of a web service. Another expected result of the project will be more knowledge on the structure and structure-function relationship of the selected proteins. This has direct medical relevance, since V-ATPase plays a role in the metastasis of tumour cells and also in osteoporosis, whereas beta-barrel proteins of the outer membrane of bacteria allow some antibiotics to enter bacterial cells. Apart from the principal investigator, all participants of the project are young researchers. This offers great benefits to young researchers for carrier development, since this basic research project promises industrial and medical applications and involves close contacts with foreign laboratories, so the young researchers will gain experience in international collaborations too.

Summary and aims of the research for the public
Describe here the major aims of the research for an audience with average background information. This summary is especially important for NRDI Office in order to inform decision-makers, media, and others.

Proteins play a major role in all living organisms. They consist of a chain (sequence) containing different numbers of the 20 amino acids. Most of the proteins do not function in the extended form of the chain, but in a folded form. However, there are so many different folded forms for a given sequence even of a mid-sized protein, that even the whole evolution had no time to "test" all of them. Yet, if we want to understand the functioning of a protein in detail, it is unavoidable to determine its folded structure, in which it functions. Classical structure biology techniques perform very badly on membrane proteins because they require the membrane proteins to be taken out from their natural lipid environment. Therefore, any alternative approach that improves the determination of membrane protein folds would be an enormous step forward in areas where membrane proteins play important roles (e.g., medicine, cosmetic industry, biotechnology). In this project we develop an approach that determines the fold structure of membrane proteins from structural data collected from their functional form. We will make the approach available to the scientific community also as a web server. Further expected result is that we will know much more about the structure and function of the selected membrane proteins, which has direct medical significance, since one of the proteins play a role in the metastasis of tumour cells and also in osteoporosis, whereas members the second studied protein family form pores in the outer membrane of bacteria, through which antibiotics also enter into the bacteria.





 

Final report

 
Results in Hungarian
• A FomA fehérje gombolyodásának komplex biofizikai vizsgálatával meghatároztuk a fehérje másodlagos szerkezetét, a kapott β-hordó szerkezet kitekeredése reverzibilitásának feltételeit, kimértük az egyensúlyi ki- és visszatekeredés hőmérsékletfüggését és lényeges termodinamikai paramétereit. Ezek új adatok a biológiai gombolyodás figyelmbe vételéhez, elmélei szerkezetjóslásban. • Elsőként alkalmaztunk oszcilláló elektromos teret a vakuoláris proton-ATPáz (V-ATPáz) szerkezet-funkció viszgálatára, és határoztuk meg egy natív forgó enzim forgási frekvenciáját. • Optimalizáltuk a V-ATPáz valósidejű aktivitás mérésére alkalmas, NADH-val hajtott csatoló enzimrenszert, melyhez kapcsolódóan kimértük egy NADH analóg szabadgyökös reakcióit. • Új számítógép klaszterünkön elvégeztük a ductin fehérjék homológia vizsgálatát és meghatároztuk 10 fehérje konzervált régióit, és a másodlagos szerkezet és membrán lokalizáció szekvencia menti valószínűségeit. • Összefoglaltuk a fehérjék gombolyodása témakört, különös tekintettel a kísérleti és elméleti módszerekre. • Eredményeinkre alapozva leírtuk hogyan lehet spinjelzett lipidek EPR spektroszkópiájával funkcionálisan releváns szerkezeti adatokat mérni membránfehérjék modellezéséhez. • Javítottunk szabadgyökök, spinjelzők EPR spektrumát illesztő algoritmusunkon, amit egy NADH analóg gyökös reakcióinak vizsgálatára irányuló munkában használtunk először.
Results in English
• Based on a complex biophysical study on the FomA protein we have: determined its secondary structure, the conditions for a reversible unfolding of its beta-barrel form, the temperature dependence of the equilibrium un- and refolding and its important thermodynamic parameters. These serve as new data to take biological folding into account in structure prediction. • We have used, for the fist time, an oscillating electric field to study structure-function relationship in the vacuolar proton-ATPase (V-ATPase) and determined the rotation rate in a native rotary enzyme. • We have optmised a NADH-driven coupling enzyme system rendering real-time measurement of V-ATPase activity possible. We have also explored the radical reactions of an NADH analogue. • Using our new computer cluster we have made the homology analysis of the ductin famlity, and predicted the membrane location and secondary structure probabilities along the sequence of 10 selected proteins from the family. • We reviewed the protein folding problem, with focus on the experimental and theoretical approaches. • Based on our results we published a book chapter on how to use EPR spectroscopy of spin-labelled lipids to gain functionally relevant structural data on membranre proteins that serve as constraints in their modelling. • We have improved our algorithm fitting EPR spectra of free radicals and spin labels, which was first used in exploring the free radical reactions of an NADH analogue.
Full text https://www.otka-palyazat.hu/download.php?type=zarobeszamolo&projektid=112716
Decision
Yes





 

List of publications

 
Ferencz CM, Petrovszki P, Der A, Sebok-Nagy K, Kota Z, Pali T: Oscillating Electric Field Measures the Rotation Rate in a Native Rotary Enzyme., Scientific Reports 7: 45309, 2017
Sebők-Nagy, K., Rózsár, D., Puskás, L. G., Balázs, Á. and Páli, T.: Electron paramagnetic resonance spectroscopic studies of the electron transfer reaction of Hantzsch ester and a pyrylium salt., RSC Advances 8, 29924-29927., 2018
Páli T., Kóta Z.: Studying Lipid–Protein Interactions with Electron Paramagnetic Resonance Spectroscopy of Spin-Labeled Lipids, In: Methods in Molecular Biology, HUMANA PRESS INC. (2019) pp. 529-561., 2019
Pali, T., Sebok-Nagy, K. Kota, Z.: Protein folding, In: Vágvölgyi Cs, Siklós L (szerk.), Selected Topics from Contemporary Experimental Biology, Volume 2. 288 p. Szeged: MTA Szegedi Biológiai Központ, 2015. pp. 189-208., 2015
Kota, Z. Talmon, E., Kleinschmidt, J.H. and Pali, T.: Stability and unfolding of FomA, a β-barrel membrane protein, studied by fluorescence spectroscopy, 16th European Conference on the Spectroscopy of Biological Molecules (ECSBM), Bochum, Germany, Szeptember 6-10., 2015, 2015
Sebok-Nagy, K., Rozsar, D., Balazs, A., Puskas, L.G. and Pali, T.: Electron paramagnetic resonance studies of radical reactions of a NADH analague, Regional Biophysical Conference (RBC2016), Trieste, Italy, 2016
Ferencz, Cs-M., Petrovszki, P., Dér, A., Sebők-Nagy, K., Kóta, Z. and Páli, T.: Natív forgó ATPáz működése oszcilláló elektromos térben, A Magyar Biofizikai Társaság XXVI. Kongresszusa, MTA Szegedi Biológiai Kutatóközpont, Szeged, August, 2017, 2017
Sebőkné Nagy, K. and Páli T.: Az impulzus üzemmódú Fourier-transzformációs elektron paramágneses rezonancia spektroszkópia lehetőségei., A Magyar Biofizikai Társaság XXVI. Kongresszusa (MBFT), MTA Szegedi Biológiai Kutatóközpont, Szeged, August, 2017, 2017
Pali T: 3. Non-SLC transporters, 3.3 Pumps (ATP-ase), 3.3.2. V-type, In: Rakonczay, Z; Hegyi, P (szerk.) Transporter, channel, membrane diseases, Szegedi Tudományegyetem (2015) pp. e-dokumentum., 2015
Sebok-Nagy K, Pali T: 3. Non-SLC transporters, 3.3 Pumps (ATP-ase), 3.3.3. F-type, In: Rakonczay, Z; Hegyi, P (szerk.) Transporter, channel, membrane diseases, Szegedi Tudományegyetem (2015), 2015
Sebok-Nagy K, Pali T: 3. Non-SLC transporters, 3.3 Pumps (ATP-ase), P-type, In: Rakonczay, Z; Hegyi, P (szerk.) Transporter, channel, membrane diseases, Szegedi Tudományegyetem (2015) p. e., 2015
V Kozák: A FomA fehérje stabilitásának és gombolyodásának vizsgálata biofizikai módszerekkel, M.Sc diploma dolgozat, Szegedi Tudományegyetem, Természettudományi és Informatikai Kar és Szegedi Biológiai Kutatóközpont, 2017
Pali, T.: Functional structure biology of biomembranes and membrane proteins, Research Seminar at Institute of Integrative Biology, Life Sciences Building, University of Liverpool, July 6, 2015, 2015
B Sahu: A molecular modeling approach to folding and assembly of membrane proteins, International Training Course diploma work, Biological Research Centre, 2018
P Knódel: A vakuoláris proton-atpáz aktivitásának valósidejű mérése élesztő vakuólum eredetű lipid vezikulákban, B.Sc szakdolgozat, Szegedi Tudományegyetem, Mérnöki Kar és Szegedi Biológiai Kutatóközpont, 2019
D Kertész: A lizozim fehérje lipid membránokkal való kölcsönhatásának biofizikai vizsgálata, B.Sc szakodolgozat, Szegedi Tudományegyetem, Természettudományi és Informatikai Kar és Szegedi Biológiai Kutatóközpont, 2019
C Csonka, T Páli, P Bencsik, A Görbe, P Ferdinandy, T Csont: Measurement of NO in biological samples, BRITISH JOURNAL OF PHARMACOLOGY 172: (6) pp. 1620-1632., 2015
Veszelka S, Mészáros M, Kiss L, Kóta Z, Páli T, Hoyk Z, Bozsó Z, Fülöp L, Tóth A, Rákhely G, Deli MA: Biotin and glutathione targeting of solid nanoparticles to cross human brain endothelial cells, CURRENT PHARMACEUTICAL DESIGN 23: (28) pp. 4198-4205., 2017
Meszaros M, Porkolab G, Kiss L, Pilbat AM, Kota Z, Kupihar Z, Keri A, Galbacs G, Siklos L, Toth A, Fulop L, Csete M, Sipos A, Hulper P, Sipos P, Pali T, Rakhely G, Szabo-Revesz P, Deli MA, Veszelka S: Niosomes decorated with dual ligands targeting brain endothelial transporters increase cargo penetration across the blood-brain barrier., EUROPEAN JOURNAL OF PHARMACEUTICAL SCIENCES 123: pp. 228-240., 2018
Ágnes Dancs, Nóra V May, Katalin Selmeczi, Zsuzsanna Darula, Attila Szorcsik, Ferenc Matyuska, Tibor Páli, Tamás Gajda: Tuning the coordination properties of multi-histidine peptides by using a tripodal scaffold: solution chemical study and catechol oxidase mimicking, NEW JOURNAL OF CHEMISTRY 41: (2) pp. 808-823., 2017
Kota, Z. Talmon, E., Kleinschmidt, J.H. and Pali, T.: Stability and unfolding of FomA, a β-barrel membrane protein, studied by fluorescence spectroscopy, 16th European Conference on the Spectroscopy of Biological Molecules (ECSBM), Bochum, Germany, Szeptember 6-10., 2015, 2015
Pali, T., Sebok-Nagy, K. Kota, Z.: Protein folding, In: Vágvölgyi Cs, Siklós L (szerk.), Selected Topics from Contemporary Experimental Biology, Volume 2. 288 p. Szeged: MTA Szegedi Biológiai Központ, 2015. pp. 189-208., 2015
Sebok-Nagy, K., Rozsar, D., Balazs, A., Puskas, L.G. and Pali, T.: Electron paramagnetic resonance studies of radical reactions of a NADH analague, Regional Biophysics Conference (RBC2016) August 25-28, 2016, Trieste, Italy, 2016
Sebok-Nagy, K., Rozsar, D., Balazs, A., Puskas, L.G. and Pali, T.: Electron paramagnetic resonance studies of radical reactions of a NADH analague, Straub Days 2016, Biological Research Centre, May 25-26, 2016, 2016
Kota, Z., Talmon, E., Kleinschmidt, J.H. and Pali, T.: Stability and unfolding of FomA, a β-barrel membrane protein, studied by fluorescence spectroscopy, Straub Days 2016, Biological Research Centre, May 25-26, 2016, 2016
Ferencz CM, Petrovszki P, Der A, Sebok-Nagy K, Kota Z, Pali T: Oscillating Electric Field Measures the Rotation Rate in a Native Rotary Enzyme., SCI REP 7: 45309, 2017
Sebők-Nagy, K., Rózsár, D., Puskás, L. G., Balázs, Á. and Páli, T.: Electron paramagnetic resonance spectroscopic studies of the electron transfer reaction of Hantzsch ester and a pyrylium salt., RSC Advances 8, 29924-29927., 2018
Sebőkné Nagy, K. and Páli T.: Az impulzus üzemmódú Fourier-transzformációs elektron paramágneses rezonancia spektroszkópia lehetőségei., Straub Days 2018, Biological Research Centre, May 10-11, 2018., 2018
Pali, T.: Natív forgó ATPáz oszcilláló elektromos térben, 48. Sümegi Membrán-Transzport Konferencia, Sümeg (Hungary), May 15-18, 2018., 2018
Pali, T.: The Rotary Mechanism of the Vacuolar Proton-ATPase., Workshop on Autophagy in model organisms, Eötvös Loránd University, Budapest (Hungary), September 6-8, 2018., 2018





 

Events of the project

 
2015-12-21 08:43:53
Résztvevők változása




Back »