Biophysics (e.g. transport mechanisms, bioenergetics, fluorescence) (Council of Medical and Biological Sciences)
100 %
Ortelius classification: Molecular biophysics
Panel
Molecular and Structural Biology and Biochemistry
Department or equivalent
Institute of Biophysics (HUN-REN Biological Research Centre Szeged)
Starting date
2016-10-01
Closing date
2020-09-30
Funding (in million HUF)
15.264
FTE (full time equivalent)
2.57
state
running project
Final report
Results in Hungarian
A projekt során flavin-adenin-dinukleotid (FAD) és nikotinamid-adenin-dinukleotid (NADH) koenzimek molekuláris szerkezetének jellemzésére kísérleteket végeztünk ezen molekulák 50 fs és 10 ns között mért autofluoreszcenciája kinetikai paramétereinek meghatározására és ezek hozzárendelésére különböző konformációkhoz. A kísérleti mérések elemzését újonnan kidolgozott matematikai módszerrel végeztük, mely ötvözi a gépi tanulás és optimalizálás módszereit. Az elvégzett molekula mechanikai számítások jó egyezést mutatnak a kísérleti eredmények matematikai értelmezésével.
Results in English
During the project we performed experiments to characterize the molecular structures of coenzymes flavin adenine dinucleotide (FAD) and nicotinamide adenine dinucleotide (NADH) with mapping the different kinetical parameters taking place in the autofluorescence of the coenzymes detected in an unusual wide range from 50 fs to 10 ns and to compare these to a set of different structures The experimental data were analyzed with a newly developed mathematical method combining machine learning and optimization. The molecular mechanical calculations are in good agreement with the results of the mathematical analysis of the experimental data.
Ferenc Sarlós, Zoltán Násztor, Áron Sipos, János Horváth, Rita Nagypál, András Dér, Géza I. Groma: Hofmeister effect on coenzyme FAD revealed by ultrafast fluorescence kinetics and molecular dynamics simulation, előadás, 2017
