The roles of two bZIP transcription factors in governing oxidative stress responses in Aspergillus nidulans  Page description

Help  Print 
Back »
 

Details of project

  
Identifier
125671
Type NN
Principal investigator Pócsi, István
Title in Hungarian Két bZIP transzkripciós faktor szerepe az oxidatív stresszválaszok irányításában Aspergillus nidulansban
Title in English The roles of two bZIP transcription factors in governing oxidative stress responses in Aspergillus nidulans
Keywords in Hungarian oxidatív stresszválasz, aszexuális sporuláció, bZIP transzkripciós faktorok
Keywords in English oxidative stress response, asexual sporulation, bZIP transcription factors
Discipline
Microbiology: virology, bacteriology, parasitology, mycology (Council of Medical and Biological Sciences)60 %
Genomics, comparative genomics, functional genomics (Council of Medical and Biological Sciences)20 %
Molecular biology (Council of Medical and Biological Sciences)20 %
Ortelius classification: Molecular biology
Panel Genetics, Genomics, Bioinformatics and Systems Biology
Department or equivalent Department of Molecular Biotechnology and Microbiology (University of Debrecen)
Participants Amin, Mohamed Ali Elbadry Hafez
Bákány, Bernadett
Dienes, Beatrix
Emri, Tamás
Gálné dr. Miklós, Ida
Jakab, Ágnes
Karányi, Zsolt Ákos
Keresztessy, Zsolt
Király, Anita
Kocsis, Beatrix
Leiter, Éva
Máthéné Szigeti, Zsuzsa
Pfliegler, Valter Péter
Vig, Ildikó
Virág, Eszter Andrea
Starting date 2017-12-01
Closing date 2022-11-30
Funding (in million HUF) 47.979
FTE (full time equivalent) 17.46
state running project





 

Final report

  
Results in Hungarian
Az AtfA és AtfB bZIP-típusú transzkripciós faktorok élettani funkcióinak és lehetséges genetikai és fizikai kölcsönhatásainak a felderítése érdekében átfogó vizsgálatot végeztünk el Aspergillus nidulansban. Ennek során atfA és atfB géndeléciós és túltermelő mutánsok sorozatát hoztuk létre valamint elvégeztük ezek fenotípusos jellemzését. Az AtfA fontos szerepet játszott az oxidatív stressz elleni védekezés, a sterigmatocisztin (ST) termelés és a kleisztotécium képződés szabályozásában. Figyelemre méltó, hogy a ΔatfA törzs nem termelt ST-t, míg a ΔatfAΔatfB kettős géndeléciós mutáns ST-termelése vad típusú szintű volt. Ugyanakkor a termőtest kialakulása egyaránt gátlódott mind a ΔatfA, mind a ΔatfAΔatfB törzsekben, ami jelzi az AtfA-AtfB genetikai kölcsönhatások bonyolultságát. Az AtfA fontosabb globális szabályozónak tűnik az MSB stresszválaszban és a vegetatív micéliumok és konídiumok fenntartásában, mint az AtfB, és az AtfA szabályozza az atfB expresszióját vegetatív mycéliumokban. Az AtfA által regulált gének közül az atfA deléció sokoldalú élettani hatását a phosphorelay választ szabályozó gének magyarázhatják. Jelenleg az AtfA által szabályozott gének teljes készletét ChIP-seq analízisekkel határozzuk meg. Mivel AtfA-AtfB fizikai kölcsönhatást sem vegetatív micéliumban, sem konídiumban nem tudtunk BiFC-alapú technikával megerősíteni a tesztelt kísérleti körülmények között, ezért az AtfA és AtfB közötti heterodimerképződést most FRET analízissel vizsgáljuk in vitro.
Results in English
A comprehensive study was performed to elucidate the physiological functions of and the possible genetic and physical interactions between two bZIP-type transcription factors, AtfA and AtfB in Aspergillus nidulans. The study included the generation and phenotypic characterization of a series atfA and atfB gene deletion and overexpression mutants. AtfA played an important role in the regulation of oxidative stress defence, sterigmatocystin (ST) production and cleistothecium formation. Remarkably, the ΔatfA strain was defected in ST production meanwhile the ΔatfAΔatfB double gene deletion mutant produced ST at wild-type level. Concomitantly, fruiting body formation was equally hampered in both the ΔatfA and ΔatfAΔatfB strains revealing the high complexity of AtfA-AtfB genetic interactions. AtfA seems to be a more important global regulator in MSB stress response and in the maintenance of vegetative mycelia and conidia than AtfB and AtfA controls atfB expression in vegetative mycelia. Among AtfA-regulated genes, phosphorelay response regulator genes may explain the versatile physiological effects of atfA deletion. Currently, we are determining the full set of genes regulated by AtfA by ChIP-seq analyses. Because no AtfA-AtfB physical interaction has been confirmed in either vegetative mycelia or conidia under any experimental conditions tested using a BiFC-based technique heterodimer formation between AtfA and AtfB is now being studied by FRET analysis in vitro.
Full text https://www.otka-palyazat.hu/download.php?type=zarobeszamolo&projektid=125671
Decision
Yes





 

List of publications

  
Károly Antal, Barnabás Cs. Gila, István Pócsi, Tamás Emri: General stress response or adaptation to rapid growth in Aspergillus nidulans?, Fungal Biology, in press, 2019
Tamás Emri, Vivien Kurucz , Ágnes Jakab , Károly Antal , Olaf Kniemeyer, István Pócsi: Coping with two stressors concomitantly, Annals of the International Symposium on Fungal Stress – ISFUS , San José dos Campos, Brazil; Abstract Book pp. 52-53., 2019
Tamás Emri , Erzsébet Orosz, Bianka Huszti, Éva Leiter, Károly Antal, Jae-Hyuk Yu, István Pócsi: Genome-wide analyses of cadmium stress response in Aspergillus nidulans, 30th Fungal Genetics Conference abstract book, Asilomar, USA; Abstract Book p 135., 2019
Tamás Emri, Vivien Kurucz , Ágnes Jakab , Károly Antal , Viktor Dombrádi, Olaf Kniemeyer, István Pócsi: Combinatorial stress responses in fungi, 18th International Congress of HSM, Budapest; Acta Microbiologica et Immunologica Hungarica, Volume 66, Supplement 1, p. 128., 2019
Barnabás Cs. Gila, Zoltán Kenyeres, Károly Antal, István Pócsi, Tamás Emri: Combinatorial stress responses in fungi, 18th International Congress of HSM, Budapest; Acta Microbiologica et Immunologica Hungarica, Volume 66, Supplement 1, p. 137., 2019
Antal K, Gila B Cs, Pócsi I, Emri T: General stress response or adaptation to rapid growth in Aspergillus nidulans?, Fungal Biol 124(5):376-386., 2020
Alder-Rangel A, Idnurm A, Brand AC, Brown AJP, Gorbushina A, Kelliher CM, Campos CB, Levin DE, Bell-Pedersen D, Dadachova E, Bauer FF, Gadd GM, Braus GH, Braga GUL, Brancini GTP, Walker GM, Druzhinina I, Pócsi I, Dijksterhuis J, Aguirre J, Hallsworth JE, Schumacher J, Wong KH, Selbmann L, Corrochano LM, Kupiec M, Momany M, Molin M, Requena N, Yarden O, Cordero RJB, Fischer R, Pascon RC, Mancinelli RL, Emri T, Basso TO, Rangel DEN: The Third International Symposium on Fungal Stress – ISFUS., Fungal Biol 124(5):235-252., 2020
Pócsi I: The bZIP-type transcription factor FvAtfA regulates fumonisin, bikaverin and carotenoid productions in the maize pathogen Fusarium verticillioides, MycoTWIN-MycoKey International conference, Bari, Italy, 2021
Bákány, B., Yin, W.-B., Dienes, B., Nagy, T., Leiter, É., Emri, T., Keller, N.P., Pócsi, I.: Study on the bZIP-type transcription factors NapA and RsmA in the regulation of intracellular reactive species levels and sterigmatocystin production of Aspergillus nidul, Int J Mol Sci 22, Article number 1577, 2021
Kocsis Beatrix, Lee Mi-Kyung, Yu Jae-Hyuk, Nagy Tibor, Daróczi Lajos, Batta Gyula, Pócsi István, Leiter Éva: Functional analysis of the bZIP-type transcription factors AtfA and AtfB in Aspergillus nidulans, FRONTIERS IN MICROBIOLOGY 13: 1003709, 2022
Bákány Bernadett, Yin Wen-Bing, Dienes Beatrix, Nagy Tibor, Leiter Éva, Emri Tamás, Keller Nancy P., Pócsi István: Study on the bZIP-Type Transcription Factors NapA and RsmA in the Regulation of Intracellular Reactive Species Levels and Sterigmatocystin Production of Aspergillus nidulans, INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES 22: (21) 11577, 2021
Emri Tamás, Gila Barnabás, Antal Károly, Fekete Fanni, Moon Heungyun, Yu Jae-Hyuk, Pócsi István: AtfA-Independent Adaptation to the Toxic Heavy Metal Cadmium in Aspergillus nidulans, MICROORGANISMS 9: (7) p. 1433., 2021
Gila Barnabás Cs., Moon Heungyun, Antal Károly, Hajdu Márton, Kovács Réka, Jónás Andrea P., Pusztahelyi Tünde, Yu Jae-Hyuk, Pócsi István, Emri Tamás: The DUG Pathway Governs Degradation of Intracellular Glutathione in Aspergillus nidulans, APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY 87: (9) e01321-20, 2021
Leiter Éva, Emri Tamás, Pákozdi Klaudia, Hornok László, Pócsi István: The impact of bZIP Atf1ortholog global regulators in fungi, APPLIED MICROBIOLOGY AND BIOTECHNOLOGY 105: pp. 5769-5783., 2021
Antal K., Gila B.C., Pócsi I., Emri T.: General stress response or adaptation to rapid growth in Aspergillus nidulans?, FUNGAL BIOLOGY 124: (5) pp. 376-386., 2020
Csillag Kinga, Emri Tamás, Rangel Drauzio E.N., Pócsi István: pH-dependent effect of Congo Red on the growth of Aspergillus nidulans and Aspergillus niger, FUNGAL BIOLOGY, 2022
Emri Tamás, Antal Károly, Gila Barnabás, Jónás Andrea P., Pócsi István: Stress Responses Elicited by Glucose Withdrawal in Aspergillus fumigatus, JOURNAL OF FUNGI 8: (11) 1226, 2022
Emri Tamás, Sümegi-Győri Veronika M, Páll Krisztián, Gila Barnabás Cs, Pócsi István: Effect of the combinatorial iron-chelation and oxidative stress on the growth of Aspergillus species., RESEARCH IN MICROBIOLOGY 173: (8) 103969, 2022
Gila BC, Antal K, Birkó Z, Keserű JS, Pócsi I, Emri T.: Strategies shaping the transcription of carbohydrate-active enzyme genes in Aspergillus nidulans, J Fungi (Basel) 8(1):79, 2022




 

Events of the project

  
2022-02-08 16:36:47
Résztvevők változása
2020-07-20 12:32:03
Résztvevők változása
2019-10-18 16:32:32
Résztvevők változása
2019-08-03 00:37:41
Résztvevők változása
2018-08-01 14:35:57
Résztvevők változása



Back »