Dissecting the transcriptional network allowing macrophages to control angiogenesis  Page description

Help  Print 
Back »

 

Details of project

 
Identifier
126885
Type KH
Principal investigator Nagy, László
Title in Hungarian A makrofágok angiogenikus hatésénak transzkripciós alapjai
Title in English Dissecting the transcriptional network allowing macrophages to control angiogenesis
Keywords in Hungarian génexpresszió, magreceptorok, makrofág, angiogenezis
Keywords in English gene expression, nuclear receptors, macrophage, angiogenesis
Discipline
Epigenetics and gene regulation (Council of Medical and Biological Sciences)50 %
Molecular biology (Council of Medical and Biological Sciences)30 %
Ortelius classification: Molecular biology
Genomics, comparative genomics, functional genomics (Council of Medical and Biological Sciences)20 %
Panel Genetics, Genomics, Bioinformatics and Systems Biology
Department or equivalent Department of Biochemistry and Molecular Biology (University of Debrecen)
Participants Czimmerer, Zsolt
Tzerpos, Petros
Starting date 2017-12-01
Closing date 2019-11-30
Funding (in million HUF) 20.000
FTE (full time equivalent) 1.73
state running project





 

Final report

 
Results in Hungarian
Makrofágok gyorsan változtatják a sejtes fenotípusukat és polarizálódnak. Munkánk során epigenomikai (RNA-seq, CHIP-seq es ATAC-seq) és bioinformatikai módszereket használva az ún. alternatív polarizációt tanulmányoztuk és meghatároztuk a magreceptor, PPARg szerepét a polarizáció folyamatában illetve azonosítottuk az Egr2 transzkripciós faktort, mint, ami összeköti a polarizációt szabályozó IL4/STAT6 szignálútvonalat a polarizáció másodlagos transzkripciós eseményeivel. Ezek az eredmények arra utalnak, hogy az IL4 mint polarizációs szignál egy tranziens transzkripciós jelet hoz létre a STAT6 foszforilációja és genomi kötése által. Ez a néhány óra alatt lezajló folyamat ez Egr2 transzkripciós faktor indukálásával elindít egy transzkripciós kaszkádot, aminek egyik tagja a PPARg magreceptor egyéb más transzkripciós faktorokkal együtt. A PPARg nagyrészt ligand hatása nélkül az epigenom szerkezeti fehérjéjeként játszik szerepet génexpresszió kifejezés szabályozásában.
Results in English
Macrophages rapidly change their phenotype and polarize into functionally distinct subtypes while responding to microenvironmental cues. The proximal transcription factors (TFs) of the polarization signals are identified, but their activity is typically transient and thus fail to explain the sustained and fixed genomic programs achieved. Here, by mapping the early and late epigenomic changes of interleukin-4 (IL-4)-mediated alternative macrophage polarization we identified the TF Early Growth Response 2 (EGR2), bridging the proximal (early) and secondary (late) gene expression program of polarization. EGR2 is a directly IL-4/STAT6-regulated TF, responsible for 77% of the induced, polarization gene signature, including a large TF network. Mechanistically, EGR2 binding induced chromatin accessibility, recruited chromatin remodelers, cofactors and RNA-polymerase II for the execution of the late polarization program. Thus, our study identified EGR2, as a STAT6-dependent TF, representing a key link into the secondary transcriptional events of alternative macrophage polarization.
Full text https://www.otka-palyazat.hu/download.php?type=zarobeszamolo&projektid=126885
Decision
Yes





 

List of publications

 
Horvath Attila, Daniel Bence, Szeles Lajos, Cuaranta-Monroy Ixchelt, Czimmerer Zsolt, Ozgyin Lilla, Steiner Laszlo, Kiss Mate, Simandi Zoltan, Poliska Szilard, Giannakis Nikolas, Raineri Emanuele, Gut Ivo G, Nagy Benedek, Nagy Laszlo: Labelled regulatory elements are pervasive features of the macrophage genome and are dynamically utilized by classical and alternative polarization signals, NUCLEIC ACIDS RESEARCH 47: (6) pp. 2778-2792., 2019
Patsalos Andreas, Tzerpos Petros, Halasz Laszlo, Nagy Gergely, Pap Attila, Giannakis Nikolas, Lyroni Konstantina, Koliaraki Vasiliki, Pintye Eva, Dezso Balazs, Kollias George, Spilianakis Charalampos G., Nagy Laszlo: The BACH1–HMOX1 Regulatory Axis Is Indispensable for Proper Macrophage Subtype Specification and Skeletal Muscle Regeneration, JOURNAL OF IMMUNOLOGY 203: pp. 1532-1547., 2019
Simándi Zoltán, Pajer Krisztián, Károlyi Katalin, Sieler Tatiana, Jiang Lu-Lin, Kolostyák Zsuzsanna, Sári Zsanett, Fekecs Zoltán, Pap Attila, Patsalos Andreas, Contreras Gerardo Alvarado, Rehó Bálint, Papp Zoltán, Guo Xiufang, Horváth Attila, Kiss Gréta, Keresztessy Zsolt, Vámosi György, Hickman James, Xu Huaxi, Dormann Dorothee, Hortobágyi Tibor, Antal Miklós, Nógrádi Antal, Nagy László: Arginine Methyltransferase PRMT8 Provides Cellular Stress Tolerance in Aging Motoneurons, JOURNAL OF NEUROSCIENCE 38: (35) pp. 7683-7700., 2018
Czimmerer Z, Daniel B, Horvath A, Ruckerl D, Nagy G, Kiss M, Peloquin M, Budai MM, Cuaranta-Monroy I, Simandi Z, Steiner L, Nagy B Jr, Poliska S, Banko C, Bacso Z, Schulman IG, Sauer S, Deleuze JF, Allen JE, Benko S, Nagy L: The Transcription Factor STAT6 Mediates Direct Repression of Inflammatory Enhancers and Limits Activation of Alternatively Polarized Macrophages., IMMUNITY 48: (1) pp. 75-90., 2018
Daniel B, Nagy G, Horvath A, Czimmerer Z, Cuaranta-Monroy I, Poliska S, Hays TT, Sauer S, Francois-Deleuze J, Nagy L: The IL-4/STAT6/PPARgamma signaling axis is driving the expansion of the RXR heterodimer cistrome, providing complex ligand responsiveness in macrophages., NUCLEIC ACIDS RES 46: (9) pp. 4425-4439., 2018
Zsolt Czimmerer, Attila Horvath, Bence Daniel, Gergely Nagy, Ixchelt Cuaranta-Monroy, Mate Kiss, Zsuzsanna Kolostyak, Szilard Poliska, Laszlo Steiner, Nikolas Giannakis, Tamas Varga, Laszlo Nagy: Dynamic transcriptional control of macrophage miRNA signature via inflammation responsive enhancers revealed using a combination of next generation sequencing-based appro, Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Gene Regulatory Mechanisms 1861 pp. 14-28., 2018, 2018
Zsolt Czimmerer, Zsuzsanna S.Nagy, Gergely Nagy, Attila Horvath, Timea Silye-Cseh, Agnes Kriston, David Jonas, Sascha Sauer, Laszlo Steiner, Bence Daniel, Jean-Francois Deleuze, Laszlo Nagy: Extensive and functional overlap of the STAT6 and RXR cistromes in the active enhancer repertoire of human CD14+ monocyte derived differentiating macrophages, Mol Cell Endocrinol. (471): 63-74., 2018, 2018
Bence Daniel,Gergely Nagy, Zsolt Czimmerer, Attila Horvath, David W.Hammers, Ixchelt Cuaranta-Monroy, Szilard Poliska, Petros Tzerpos, Zsuzsanna Kolostyak, Tristan T.Hays, Andreas Patsalos, René Houtman, Sascha Sauer, Jean Francois-Deleuze, Fraydoon Rastinejad, Balint L.Balint, Lee Sweeney, Laszlo Nagy: The Nuclear Receptor PPARγ Controls Progressive Macrophage Polarization as a Ligand-Insensitive Epigenomic Ratchet of Transcriptional Memory, Immunity 49: (4) pp. 615-626., 2018, 2018
Andreas Patsalos, Zoltan Simandi, Tristan T. Hays, Matthew Peloquin, Matine Hajian, Isabella Restrepo, Paul M. Coen, Alan J. Russell, Laszlo Nagy: n vivo GDF3 administration abrogates aging related muscle regeneration delay following acute sterile injury, AGING CELL 17 : 5 Paper: e12815 (2018), 2018
Daniel B, Nagy G, Horvath A, Czimmerer Z, Cuaranta-Monroy I, Poliska S, Hays TT, Sauer S, Francois-Deleuze J, Nagy L: The IL-4/STAT6/PPARgamma signaling axis is driving the expansion of the RXR heterodimer cistrome, providing complex ligand responsiveness in macrophages., NUCLEIC ACIDS RES 46: (9) pp. 4425-4439., 2018





 

Events of the project

 
2018-12-19 12:57:20
Résztvevők változása
2018-10-15 15:38:44
Résztvevők változása




Back »