Gene expression profiles characteristic to rice varieties cultivated under water-saver irrigation regime  Page description

Help  Print 
Back »

 

Details of project

 
Identifier
46495
Type K
Principal investigator Györgyey, János
Title in Hungarian Víztakarékos öntözéstechnikával termeszthető rizsfajtákra jellemző génexpressziós mintázatok
Title in English Gene expression profiles characteristic to rice varieties cultivated under water-saver irrigation regime
Panel Plant and animal breeding
Department or equivalent Institute of Plant Biology (Biological Research Centre Szeged)
Participants Fónad, Péter
Kovácsné Lendvai, Ágnes
Mai, Antal
Pauk, János
Starting date 2004-01-01
Closing date 2007-12-31
Funding (in million HUF) 13.416
FTE (full time equivalent) 0.00
state closed project





 

Final report

 
Results in Hungarian
Eltérő vízigényű rizsfajták (''szárazrizsek'' és hagyományos fajták) növekedési, termesztési paramétereit határoztuk meg árasztásos ill csak kiegészítő öntözéses körülmények között annak érdekében, hogy a korlátozott vízellátáshoz jól adaptálódó fajtákra jellemző tulajdonságokat megállapíthassuk. Kidolgoztunk egy olyan kísérleti rendszert, melyben ezeknek a fajtáknak a gyökérnövekedését vizsgálhatjuk, illetve génexpressziós vizsgálatokhoz mintát gyűjthetünk. Transzkript profilok microarray hibridizációs felvételével megállapítottuk, hogy a mélyrehatoló, erőteljes gyökérzet meghatározó jellemzője a száraz körülmények között is jól teljesítő fajtáknak, és több száz olyan gént találtunk, melynek transzkript-szintje vízellátástól függő napszakos változásokat mutat a legnagyobb tűrőképességű Sandora fajta gyökérzetében. Valósidejű kvantitatív PCR-rel ellenőriztük számos gén expressziós mintázatát, ez döntő többségében megerősítette a microarray hibridizációval kapottakat, egyúttal más aszályérzékenységű rizsfajtákban is meghatároztuk ezen gének expressziós mintázatát.
Results in English
Rice cultivars featuring different water demand (upland and traditional cultivars) were studied in this project. Growth and harvest parameters of these cultivars were determined under flooding and limited sprinkle irrigation in order to find features characteristic to genotypes adapting well to water limitation. An experimental system was established that allows studies of root growth as well as collection of samples for gene expression experiments. Microarray hybridizations revealed the transcript profile of Sandora cultivar that develops strong and deep root system which is an important component of good yield performance under drought stress. Several hundred genes were found which showed water supply dependent transcript level changes in the roots of this cultivar on a daily manner. Microarray results were confirmed by quantitative real-time PCR for several genes. The expression patterns of these genes were also checked in cultivars being less drought tolerant.
Full text http://real.mtak.hu/1458/
Decision
Yes





 

List of publications

 
Zoltán Zombori, Antal Mai, Katalin Török, Dénes Dudits, János Györgyey: Development of expression cassettes for stress-induced and root-specific expression in cereals, World Conference of Stress 2007, 2007
Jancsó M., Majer P., Lantos C., Simon-Kiss I., Dudits D., PAUK J.: Diagnostic system for detection of drought tolerant rice genotypes, pp. 330-331 In: Bocchi S., Ferrero A., Porro A., editors Proceedings of the Fourth Temperate Rice Conference, 25-28 June 2007, Novara, Italy. 384 p., 2007
Jancsó M., Sonkoly B., Lantos C., Simon-Kiss I., PAUK J.: Hungarian rice varieties for tissue cultures to promote biotech breeding appproaches, pp. 250-251 In: Bocchi S., Ferrero A., Porro A., editors;Proceedings of the Fourth Temperate Rice Conference, 25-28 June 2007, Novara, Italy. 384 p., 2007
János GYÖRGYEY, Gábor V. HORVÁTH, Dénes DUDITS,: Genes for stress adaptation in cereals: from transcript, 57. Tagung der Vereinigung der Pflanzenzüchter und Saatgutkaufleute Österreichs 2006, 2006
Cserháti Mátyás és Györgyey János: Génkutatás in silico, A búza nemesbítésének tudománya. A funkcionális genomikától a vetőmagig, (Szerk. Dudits Dénes), MTA Szegedi Biológiai Központ – Winter Fair Kft, Szeged, 2006, pp. 88-98, 2006
Maria Secenji, Ágnes Lendvai, Zsuzsa Hajósné, Dénes Dudits, János Györgyey: Experimental system for studying long-term drought adaptation of wheat cultivars, Volume 49(1-2):51-52, 2005, 2005
J. Györgyey, M. Secenji, Á. Lendvai, M. Cserháti, Á Zvara, L. Puskás, N. Stein, P. Schweizer, D. Dudits: Transcriptional changes during drought adaptation in wheat cultivars, 3. Plant GEMs conference, Lyon (France) 22-25 September 2004; előadás, 2004




Back »