signal transduction, protein domain, lipid mediator, binding mechanism, regulation
Discipline
General biochemistry and metabolism (Council of Medical and Biological Sciences)
60 %
Ortelius classification: Biochemistry
Signal transduction (Council of Medical and Biological Sciences)
20 %
Structural biology (crystallography and EM) (Council of Medical and Biological Sciences)
20 %
Panel
Molecular and Structural Biology and Biochemistry
Department or equivalent
Institute of Enzymology, BRC, Hungarian Academy of Sciences
Participants
Baksa, Attila Besztercei, Balázs Kovács, Erika Pál-Gábor, Henriett
Starting date
2010-04-01
Closing date
2014-03-31
Funding (in million HUF)
14.704
FTE (full time equivalent)
11.94
state
closed project
Summary in Hungarian
A jelátviteli folyamatok során a sejtfelszíni receptorok aktivációja szelektív génátírássá vagy közvetlen sejtfiziológiai reakcióvá fordítódik le. Ennek az eseménysornak a legjobban feltárt részletei azok a fehérje-fehérje kölcsönhatások, amelyek összetett - receptorokat, állványfehérjéket, szabályozó fehérjéket és kinázokat tartalmazó - jelátviteli komplexek képződéséhez vezetnek. Ezek a komplex struktúrák tipikusan a sejtmembránhoz kapcsolódva jönnek létre és a lipidek aktív szerepet játszanak összetételük kialakításában. Ennek ellenére a jelátviteli fehérjék membránhoz kapcsolódása, illetve a lipidekkel való kölcsönhatásuknak aktivitásukra kifejtett hatása csak kevéssé ismert. Jelen pályázat keretében szisztematikusan kívánom tanulmányozni a jelátviteli fehérjék és a jelátvitelben szintén meghatározó szerepet betöltő lizofoszfolipid mediátorok kölcsönhatását. A molekuláris szintű tanulmányozáshoz kiaknázom az előnyeit annak, hogy a jelátviteli fehérjék moduláris felépítésűek. Munkámban a releváns fehérjemodulok expresszióját követően vizsgálom lizofoszfolipid mediátorokhoz kötődésüket, valamint annak funkcionális következményeit megalapozott biokémiai és biofizikai módszerekkel.
Summary
Signal transduction means that the activation of cell-surface receptors leads to selective gene transcriptions or immediate cell-physiological reactions. This process involves the formation of multicomponent signaling complexes build of receptors, scaffold and regulator proteins and kinases. Protein interactions with lipids are essential in the formation of these complexes at membrane interfaces. Despite this fact, the understanding of the mechanism of binding of the signaling proteins to membranes as well as its consequences to their activities are rather scarce. In this proposal I plan to study systematically the interaction of signaling proteins with lysophospholipid mediators which also play substantial roles in signaling. I will take advantage of the fact that signaling proteins consist of several modules or domains and many specific domain-domain interactions are known. Following the expression and purification of the relevant protein domains I will study the molecular mechanism of their binding to lysophospholipid mediators as well as the functional consequences of it with established biochemical and biophysical methods.
