Egy kardiovaszkuláris rizikófaktor, az ABCC6 gén transzkripciós szabályozása  részletek

súgó  nyomtatás 
vissza »

 

Projekt adatai

 
azonosító
100638
típus K
Vezető kutató Arányi Tamás
magyar cím Egy kardiovaszkuláris rizikófaktor, az ABCC6 gén transzkripciós szabályozása
Angol cím Transcriptional regulation of the human ABCC6 gene, a cardiovascular risk factor
magyar kulcsszavak ABCC6, pszeudoxanthoma elasticum, koronaria artéria betegség, transzkripciós szabályozás, hepatocyte nuclear factor 4, ccaat/enhancer binding protein, ERK1/2, epigenetika
angol kulcsszavak ABCC6, pseudoxanthoma elasticum, coronary artery disease, transcriptional regulation, hepatocyte nuclear factor 4, ccaat/enhancer binding protein, ERK1/2, epigenetics
megadott besorolás
Epigenetika és génszabályozás (Orvosi és Biológiai Tudományok Kollégiuma)100 %
zsűri Genetika, Genomika, Bioinformatika és Rendszerbiológia
Kutatóhely Molekuláris Élettudományi Intézet (HUN-REN Természettudományi Kutatóközpont)
résztvevők Arányi Tamás
Arányi Tamás
Bacquet Caroline
Buday László
Buday László
Buday László
Pomozi Viola
Szeltner Zoltán
Szeri Flóra
Tőkési Natália
Váradi András
Váradi András
Váradi András
projekt kezdete 2012-01-01
projekt vége 2015-12-31
aktuális összeg (MFt) 39.797
FTE (kutatóév egyenérték) 6.17
állapot lezárult projekt
magyar összefoglaló
Mind az Európai Únió (EU) mind az NIH kutatásai prioritásai között megtaláljuk a ritka betegségek kutatását hiszen az EU és az USA területén több, mint 50 millió olyan ember él, aki ilyen betegségben szenved. Ennek megfelelően a tavalyi év során közös programok indításáról határoztak. Az ABCC6 a pseudoxanthoma elasticum (PXE) nevű ritka betegség génje. A közelmúltban igazolódott azonban, hogy már egyetlen mutáció hordozása is jelentősen megnöveli a szívkoszorúér-betegség kialakulásának kockázatát. Ez nem is annyira meglepő, hiszen nem egy esetben tapasztaljuk, hogy egy ritka betegség egy olyan kórkép modelljének tekinthető, mely a társadalom jóval szélesebb rétegeit érinti, mint a maga a ritka betegség. Valószínűleg egy ma még azonosítatlan metabolitot transzportál az ABCC6 a májsejtekből a véráramba. Ennek a folyamatnak különleges jelentősége van a PXE-re jellemző arteriális kalcifikáció kialakulása szempontjából. Az ABCC6 gén kifejeződésének szabályozásában szerepet játszó faktorok azonosítása hozzájárulhat a két betegség patogenezisének jobb megértéshez, sőt az ABCC6 fehérjeszint növelése akár terápiás céllá is válhat. Ennek megfelelően kísérleteink során az ABCC6 gén szabályozását kívánjuk jobban megérteni. A korábbi és jelenleg is folyó kutatásaink eredményeire támaszkodva tervezzük: i/ azonosítani a gén szövetspecifikus kifejeződéséért felelős fehérjéket, ii/ karakterizálni a gén kifejeződésében szerepet játszó epigenetikai faktorokat, iii/ vizsgálni az ABCC6 kifejeződésének ERK1/2-től való - HNF4alpha transzkripciós faktoron keresztül megvalósuló - függésének mechanizmusát, iv/ a teljes genomot megvizsgálni, hogy azonosítsuk az i és iii pontokban leírt mechanizmusok mely további gének esetén figyelhetők meg.
angol összefoglaló
Research on rare diseases is a priority of the NIH and the EU, therefore common initiatives were recently undertaken. Indeed more than 50 million people in Europe and in the US are affected by rare diseases. ABCC6 is the disease gene of a rare genetic disorder called pseudoxanthoma elasticum (PXE). However, it was recently also shown that the lack of already one functional allele of ABCC6 is a strong risk factor for coronary artery disease. It is rather common that a rare disease is considered as a model of conditions affecting much larger portion of the population than the genetic disease itself. The ABCC6 transporter most probably secretes an unknown metabolite from the liver to the bloodstream. This has a major role in controlling calcification of the media of arteries and other tissues calcified in PXE. Identification of the factors playing crucial role in the regulation of the gene may give the key to understand the pathomechanism of the two disease-types and may provide the basis of a potential therapeutic intervention targeted to increase the protein level in the liver. Here we propose therefore to study the ABCC6 gene expression regulatory network. Our aims emanate from our previous and ongoing projects : i/ identification of the proteins determining the tissue-specific expression of ABCC6, ii/ characterization of the epigenetic network participating to the regulation of ABCC6 expression, iii/ investigation of the ERK1/2 mediated fine-tuning of the HNF4alpha transcription factor dependent expression of ABCC6, iv/ whole-genome screening for the mechanisms identified in i and iii.





 

Zárójelentés

 
kutatási eredmények (magyarul)
A kutatás során 5 cikket publikáltunk és további 3 kéziratunk van jelenleg elbírálás alatt. 1/ Módszertani újítások Két fő eredményünk volt ezen a területen. Bevezettük a teljes genomi analíziseket és állatkísérletes modelleket is elkezdtünk használni. Beállítottuk a kromatin immunoprecipitació (ChIP)-seq és a "reduced representation bisulfite sequencing" (RRBS) módszert. 2/ Az ABCC6 gén transzkripciós szabályozása Kimutattuk, hogy a C/EBPbeta egy főemlős specifikus intronikus kötőhelyen keresztül aktiválja a gén átíródását. Megmutattuk továbbá, hogy a C/EBPalpha és a HNF4α a promóterhez kötődik, ez utóbbi egy evolúciósan erősen konzervált helyen. A HNF4α felelős a gén szabályozásáért elsősorban. A fenti transzkripciós faktorok különlegesen fontos syerepet töltenek be a metabolizmus regulációjában. Ezért beállítottuk a "fast-refed" metabolikus egér modellt. Kísérleteinkben kimutattuk az ABCC6 promóter H3k4m3 és a géntest H3K36m3 módosítását frissen preparált májból és a módosítások változását a modellünkben a kontrollhoz képest. 3/ Kimutattuk, hogy az ERK1/2 foszforilálja a HNF4α-t. Ennek hatására a fehérje DNS kötése lecsökken és a foszforiláció hatása az AMPK által is foszforilált helyen mutatható ki. 4/ Kimutattuk, hogy az ERK1/2 növeli az ABCG2 fehérje kifejeződését a gén A és B promóterén keresztül. 5/ Négy sikeres nemzetközi tudományos konferenciát szerveztünk.
kutatási eredmények (angolul)
During this period we have published 5 papers and 3 further manuscripts are under revision. 1/ Methodological improvement Two major changes were realized during the last years. First, local analyses were substituted by genome-wide analyses; second, we introduced mouse model in several experiments. We set up chromatin immunoprecipitation (ChIP)-seq and reduced representation bisulfite sequencing (RRBS) techniques 2/ Transcriptional Regulation of ABCC6 We have demonstrated that C/EBPbeta acts as a primate-specific transcription factor in the 1st intron of the gene, C/EBPalpha bind the promoter and HNF4 alpha (HNF4α) recognizes an evolutionarily highly conserved binding site in the promoter. These TFs are particularly important in the regulation of metabolism. We have therefore set up the “fast-refed” mouse model. Our preliminary data indicate H3K4 trimethylation of ABCC6 promoter and H3K36 trimethylation of the gene body in the hepatocytes of control animals. The data also suggest epigenetic changes upon fasting and refeeding. 3/ ERK1/2 phosphorylation of HNF4α We have shown that ERK1/2 activation inhibits HNF4α binding to DNA, we showed that this is due to both a rapid and a slow effect. The rapid effect is due to direct phosphorylation of the protein at a previously identified target site for AMPK. 4/ We have also demonstrated that ERK1/2 increases the expression of ABCG2 via promoters A and B 5/ We have organized four successful international scientific meetings
a zárójelentés teljes szövege https://www.otka-palyazat.hu/download.php?type=zarobeszamolo&projektid=100638
döntés eredménye
igen





 

Közleményjegyzék

 
Ratajewski M, de Boussac H, Sachrajda I, Bacquet C, Kovács T, Váradi A, Pulaski L, Arányi T: ABCC6 Expression Is Regulated by CCAAT/Enhancer-Binding Protein Activating a Primate-Specific Sequence Located in the First Intron of the Gene, J Inv Dermatol, 2012
de Boussac H, Orbán TI, Várady G, Tihanyi B, Bacquet C, Brózik A, Váradi A, Sarkadi B, Arányi T.: Stimulus-induced expression of the ABCG2 multidrug transporter in HepG2 hepatocarcinoma model cells involves the ERK1/2 cascade and alternative promoters., Biochem Biophys Res Commun, 2012
Tamás Arányi, Caroline Bacquet, Hugues de Boussac, Marcin Ratajewski, Viola Pomozi, Krisztina Fülöp, Christopher N. Brampton, Lukasz Pulaski, Olivier Le Saux and András Váradi: Transcriptional regulation of the ABCC6 gene and the background of impaired function of missense disease-causing mutations, Frontiers in genetics, 2013
Földes G, Matsa E, Kriston-Vizi J, Leja T, Amisten S, Kolker L, Kodagoda T, Dolatshad NF, Mioulane M, Vauchez K, Arányi T, Ketteler R, Schneider MD, Denning C, Harding SE: Aberrant α-adrenergic hypertrophic response in cardiomyocytes from human induced pluripotent cells, Stem Cell Reports. 2014 Nov 11; 3(5): 905–914, 2014
Földes G, Matsa E, Kriston-Vizi J, Leja T, Amisten S, Kolker L, Kodagoda T, Dolatshad NF, Mioulane M, Vauchez K, Arányi T, Ketteler R, Schneider MD, Denning C, Harding SE: Aberrant α-adrenergic hypertrophic response in cardiomyocytes from human induced pluripotent cells, Stem Cell Reports. 2014 Nov 11; 3(5): 905–914, 2014
Qiaoli Li, Tamás Arányi, András Váradi, Sharon Terry, Jouni Uitto: Research Progress in Pseudoxanthoma Elasticum and Related Ectopic Mineralization Disorders, Journal of Investigative Dermatology, 2016





 

Projekt eseményei

 
2016-07-05 14:12:02
Résztvevők változása
2015-03-24 23:11:09
Résztvevők változása
2014-11-26 10:30:35
Vezető kutató váltás
Arányi Tamás 2014. október 1-től visszaveszi a projekt vezetését.
2014-02-03 09:16:30
Vezető kutató váltás
Saját pályázat beadása miatt.
2013-03-29 10:37:04
Vezető kutató váltás
Külföldi tartózkodás




vissza »