A szarvasmarha motilin gén mutációjának funkcionális vizsgálata  részletek

súgó  nyomtatás 
vissza »

 

Projekt adatai

 
azonosító
111964
típus PD
Vezető kutató Hoffmann Orsolya Ivett
magyar cím A szarvasmarha motilin gén mutációjának funkcionális vizsgálata
Angol cím Functional analysis of a mutation in the cattle motilin gene
magyar kulcsszavak szarvasmarha, genomika, promóter, SNP
angol kulcsszavak bovine, genomics, promoter, SNP
megadott besorolás
Állattenyésztés (Komplex Környezettudományi Kollégium)70 %
Ortelius tudományág: Állattenyésztés
Genomika, összehasonlító genomika, funkcionális genomika (Orvosi és Biológiai Tudományok)20 %
Állat-biotechnológia (Komplex Környezettudományi Kollégium)10 %
zsűri Növénytermesztés, állattenyésztés
Kutatóhely Mezőgazdasági Biotechnológiai Kutatóintézet (Nemzeti Agrárkutatási és Innovációs Központ)
projekt kezdete 2015-01-01
projekt vége 2018-11-30
aktuális összeg (MFt) 25.315
FTE (kutatóév egyenérték) 2.46
állapot aktív projekt





 

Zárójelentés

 
kutatási eredmények (magyarul)
Az oltógyomor bal oldali helyzetváltozása a tejtermelő tehenészetek állományának 1-7%-át érintő, nagy öröklődhetőségi értékű betegség, amely főleg magas hozamú állatok esetében gyakori. Gyógyítása általában műtéti beavatkozást igényel, így a tehenészetek nyereségességét veszélyezteti. A motilin gén promóterében található mutáció (SNP) egy transzkripciós faktor kötőhelyet érint és GWAS vizsgálatok alapján köthető a betegséghez. Ennek az mutációnak a funkcionális vizsgálatát célozta a pályázat. A projektben új generációs szekvenálás segítségével vizsgáltuk az oltógyomor transzkriptomában bekövetkező változásokat. Meghatároztuk a különbözően expresszáló géneket, és megállapítottuk, hogy az általunk vizsgált állatokban a motilin jelenléte alacsonyabb volt. A szarvasmarha motilin promóter hosszának vizsgálatához klónoztunk négy egymást átfedő feltételezhető promóter szakaszt és megállapítottuk, hogy ezek közül kettő eredményesen vált ki expressziót. Az egyik így kiválasztott promóter szakaszt tartalmazó CRISPR/Cas9 konstrukcióval megkíséreltünk knock in állatot létrehozni, azonban a knockout sikeressége ellenére homológ rekombinációs esemény nem következett be. Kutatásainkat folytatjuk bevonva a motilin receptort is a vizsgálatainkba, szarvasmarha tápcsatorna szakaszokon vizsgáljuk a motilin és motilin receptor expresszióját, valamint tovább folytatjuk a transzgénikus kísérleteket.
kutatási eredmények (angolul)
The left displacement of abomasum is a disease with high inheritance value affecting 1 to 7% of the dairy herd population, which is common mainly in high yielding animals. Healing usually requires surgical intervention, thus jeopardizing the profitability of dairy farms. The mutation (SNP) in the promoter of motilin gene affects a transcription factor binding site and is linked to the disease by GWAS studies. The application aimed at functional testing of this mutation. In the project, we investigated changes in the transcriptome of the abomasum using next-generation sequencing. We determined the differentially expressed genes and found that motilin was lower in the animals LDA affected aminals. To examine the length of the bovine motilin promoter, four overlapping putative promoter regions were cloned and two were found to elicit the expression. An attempt was made to create a knock in animal using a CRISPR / Cas9 construct containing one of the promoter regions selected, but, despite the success of the knockout, no homologous recombination event occurred. We continue our studies involving the motilin receptor in our studies, investigate the expression of motilin and motilin receptors in bovine gastrointestinal sections, and continue our transgenic experiments.
a zárójelentés teljes szövege https://www.otka-palyazat.hu/download.php?type=zarobeszamolo&projektid=111964
döntés eredménye
igen





 

Közleményjegyzék

 
Tapasztó Attila, Gál Zoltán, Borsy Adrienn, Welker Ervin, Hiripi László, Horváth András, Hoffmann Orsolya Ivett: Genetic analisys of the Left-sided displacement of the abomasum, WG/MC/Scientific Meeting of COST Action BM1308 Sharing Advances on Large Animal Models – SALAAM Poznan, December 13-16, 2015, 2015
Gál Zoltán, Borsy Adrienn, Hiripi László, Horváth András, Hoffmann Orsolya Ivett: Genetic analysis of the left-sided displacement of the abomasum, V. GÖDÖLLŐI ÁLLATTENYÉSZTÉSI TUDOMÁNYOS NAPOK NEMZETKÖZI KONFERENCIA, 2015
Bálint BIRÓ, Zoltán GÁL, Olivér SZABÓ, László HIRIPI, András HORVÁTH, Orsolya Ivett HOFFMANN: INVESTIGATION OF THE GENETIC BACKGROUND OF A COMMON CATTLE DISEASE WITH HRM ASSAY, In: Tamas, L; Zelenyanszki, H (szerk.) Fiatal Biotechnológusok Országos Konferenciája, (2018) pp. 66-66., 2018
Skoda G, Hoffmann OI, Gocza E, Bodrogi L, Kerekes A, Bosze Z, Hiripi L: Placenta-specific gene manipulation in rabbits., JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY 259: pp. 86-90., 2017
Z Gál, A Tapasztó, B Biró A Borsy, E Welker, L Hiripi, A Horváth, O I Hoffmann, Z Gál: In vivo examination of an SNP in the bovine motilin gene, , 2017
Z Gál, B Biró, O Szabó, L Hiripi, A Horváth, O I Hoffmann, Z Gál: Identifying the genetic background of a common dairy cattle disease, , 2017
Gál Zoltán, Borsy Adrienn, Hiripi László, Horváth András, Hoffmann Orsolya Ivett, Z Gál: A SZARVASMARHA OLTÓGYOMOR BAL OLDALI HELYZETVÁLTOZÁSÁNAK GENETIKAI VIZSGÁLATA, , 2015
Gál Zoltán, Hiripi László, Horváth András, Hoffmann Orsolya Ivett, Bényi Erzsébet, Pajor Ferenc, Póti Péter, Tőzsér János: A SZARVASMARHA OLTÓGYOMOR BAL OLDALI HELYZETVÁLTOZÁSÁNAK GENETIKAI VIZSGÁLATA, , 2015
Pálinkás Hajnalka, Rácz Gergely, Gál Zoltán, Hoffmann Orsolya, Tihanyi Gergely, Róna Gergely, Gócza Elen, Hiripi László, Vértessy Beáta: CRISPR/Cas9-Mediated Knock-Out of dUTPase in Mice Leads to Early Embryonic Lethality, BIOMOLECULES 9: (4) 136, 2019
Liptak N, Hoffmann OI, Skoda G, Gocza E, Kerekes A, Bosze Z, Hiripi L: Glomerulosclerosis in transgenic rabbits with ubiquitous Venus protein expression., ACTA VETERINARIA HUNGARICA 66: (2) pp. 281-293., 2018
Kerekes A, Hoffmann OI, Iski G, Liptak N, Gocza E, Kues WA, Bosze Z, Hiripi L: Secretion of a recombinant protein without a signal peptide by the exocrine glands of transgenic rabbits., PLOS ONE 12: (10) p. e0187214., 2017
Liptak N, Hoffmann OI, Kerekes A, Iski G, Ernszt D, Kvell K, Hiripi L, Bosze Z: Monitoring of Venus transgenic cell migration during pregnancy in non-transgenic rabbits., TRANSGENIC RES &:, 2017
Schiavo Giuseppina, Hoffmann Orsolya Ivett, Ribani Anisa, Utzeri Valerio Joe, Ghionda Marco Ciro, Bertolini Francesca, Geraci Claudia, Bovo Samuele, Fontanesi Luca: A genomic landscape of mitochondrial DNA insertions in the pig nuclear genome provides evolutionary signatures of interspecies admixture, DNA RESEARCH 24: (5) pp. 487-498., 2017
Tálas András, Péter Istvan Kulcsár, Nóra Weinhardt, Adrienn Borsy, Eszter Tóth, Kornélia Szebényi, Sarah Laura Krausz, Krisztina Huszár, István Vida, Ádám Sturm, Bianka Gordos, Orsolya Ivett Hoffmann, Petra Bencsura, Antal Nyeste, Zoltán Ligeti, Elfrieda Fodor, Ervin Welker: A convenient method to pre-screen candidate guide RNAs for CRISPR/Cas9 gene editing by NHEJ-mediated integration of a 'self-cleaving' GFP-expression plasmid., DNA RESEARCH 24: (6) pp. 609-621., 2017
Hoffmann OI, Kerekes A, Liptak N, Hiripi L, Bodo S, Szaloki G, Klein S, Ivics Z, Kues WA, Bosze Z: Transposon-Based Reporter Marking Provides Functional Evidence for Intercellular Bridges in the Male Germline of Rabbits., PLOS ONE 11: (5) e0154489, 2016




vissza »