A respiratórikus lánc funkcionális károsodásával járó ismeretlen eredetű mitokondriális betegségeinek vizsgálata új generációs módszerekkel  részletek

súgó  nyomtatás 
vissza »

 

Projekt adatai

 
azonosító
112831
típus PD
Vezető kutató Halmainé dr. Komlósi Katalin
magyar cím A respiratórikus lánc funkcionális károsodásával járó ismeretlen eredetű mitokondriális betegségeinek vizsgálata új generációs módszerekkel
Angol cím Investigation of genetically undiagnosed mitochondrial diseases associated with the functional impairment of the respiratory chain with use of next generation molecular genetic methods (WES)
magyar kulcsszavak mitokondriális, respiratórikus lánc, új generációs módszerek, teljes exom szekvenálás
angol kulcsszavak mitochondrial, respiratory chain, next generation methods, whole exome sequencing
megadott besorolás
Közegészségtan, egészségügyi szolgáltatások, környezetegészségügy, foglalkozásegészségügy, epidemiológia, orvosi etika (Orvosi és Biológiai Tudományok Kollégiuma)100 %
Ortelius tudományág: Ritka betegségek
zsűri Molekuláris és Szerkezeti Biológia, Biokémia
Kutatóhely Orvosi Genetikai Intézet (Pécsi Tudományegyetem)
projekt kezdete 2014-09-01
projekt vége 2016-08-31
aktuális összeg (MFt) 4.338
FTE (kutatóév egyenérték) 0.41
állapot aktív projekt





 

Zárójelentés

 
kutatási eredmények (magyarul)
A kutatási támogatás első hét hónapjában a kutatási terv alábbi pontjaiban értünk el eredményeket: 1. Biobankunk bővítése, a mitokondriális betegek fenotípusos és biokémiai karakterizálása 2. Teljes exom szekvenálás: a 3 évre kitűzött 20 ismeretlen mitokondriális betegségben szenvedő esetből a 7 hónap alatt a NeurOmics FP7 program keretében a müncheni Helmholtz Zentrumban eddig 5 genetikailag nem azonosított magyar mitokondriális beteg teljes exom szekvenálását végeztük el. Az 5 esetből eddig 3 esetben jutottunk egyértelmű diagnózishoz. mindegyik esetben egy nagyon ritka kórképet azonosítottunk. A familiáris ismeretlen eredetű myopathiás fenotípust mutató magyar családjainknál a kanadai Care4Rare projekt révén 7 neuromuskularis esetünkből egy esetben WES analízissel egy nagyon ritka myopathiára derült fény, az eset publikációja folyamatban van. 3. A kapott WES adatok kiértékelését, a kapott eltérések konfirmálását és szegregáció-analízisét, az ismert génmutációknál a fenotípus-genotípus korreláció elemzését, hasonló fenotípusú betegek gyűjtését és célzott vizsgálatát, valamint az új mutációknál predikciós szoftveranalízisek alkalmazását intézetünkben végeztük el. Sajnos a funkcionális (proteomikai és iPSC) vizsgálatokra nem került sor.
kutatási eredmények (angolul)
In our project we aimed to investigate the complex molecular background of a selected group of Hungarian patients with genetically yet unidentified mitochondrial disease with the approach of next generation methods, whole exome sequencing and proteomic studies. In the first 7 months of the research support we could reach the following goals of our project: 1. Extending our neuromuscular biobank, phenotypic and biochemical characterization of our mitochondrial cohort 2. WES or targeted NGS sequencing: out of the 20 patients with undiagnosed mitochondrial disease aimed to be characterized in 3 years we were able to perform WES in 5 cases with the help of the NeurOmics FP7 project in the Helmholtz Institute in Munich. Out of the 5 cases we were able to come to a probable molecular genetic diagnosis identifying a rare disease in 3 cases. In our cohort of Hungarian patients with yet unidentified myopathies a cooperation with the Care4Rare Canadian project yielded the diagnosis of a rare mitochondrial myopathy in one case so far. 3. The analyis of the WES data as well as the cosegregation studies were all performed at our institute. We also analyzed phenotype-genotpye correlations and started to collect patients with similar phenotypes. For new mutations prediction softwares were used successfully. Unfortunately, due to the termination of the project no functional analyses (e.g. proteomics or iPSC generation) have been performed.
a zárójelentés teljes szövege https://www.otka-palyazat.hu/download.php?type=zarobeszamolo&projektid=112831
döntés eredménye
nem





 

Közleményjegyzék

 
Komlósi K, Hadzsiev K, Garbes L, Martínez Carrera LA, Pál E, Sigurðsson JH, Magnusson O, Melegh B, Wirth B.: Exome sequencing identifies Laing distal myopathy MYH7 mutation in a Roma family previously diagnosed with distal neuronopathy., Neuromuscul Disord. 2014; 24 (2): 156-161., 2014
Hadzsiev K, Balikó L, Komlósi K, Lőcsei-Fekete A, Csábi G, Bene J, Kisfali P, Melegh B.: Herediter spastikus paraplegia genetikai vizsgálata., Orv Hetil. 2015 Jan 18;156(3):113-7., 2015
Remenyi V, Inczedy-Farkas G, Komlosi K, Horvath R, Maasz A, Janicsek I, Pentelenyi K, Gal A, Karcagi V, Melegh B, Molnar MJ: Retrospective assessment of the most common mitochondrial DNA mutations in a large Hungarian cohort of suspect mitochondrial cases, MITOCHONDRIAL DNA 26:(4) pp. 572-578. (2015), 2015
Hadzsiev K, Komlósi K, Csábi G, Gál A, Melegh B.: Alpers - Huttenlocher szindróma egy betegünk kapcsán., Gyermekgyógyász továbbképző szemle. 2015., Gyermekgyógyászati Továbbképző Szemle XX. évf. 3. szám, 2015
Lechno S, de la Maison I, Komlosi K, Pollak-Hainz A, Läßig A, Schweiger S, Keilmann A, Bartsch O, Zechner U.: Targeted Next-Generation Sequencing of 151 genes in molecular diagnostics of hereditary hearing loss., 18. Jahrestagung der Deutschen Gesellschaft für Audiologie, 2015. március 4-6., Bochum, Németország, 2015
Komlósi K, Hadzsiev K, Haack T, Pöstyéni E, Bene J, Szabó A, Czakó M, Fónai F, Meitinger T, Melegh B.: Exome sequencing identifies TMEM70 deficiency in a Hungarian Roma family with severe congenital lactic acidosis., Meeting of the European Society of Human Genetics, Glasgow, June 2015, Eur J Hum Genet. Vol. 23 Suppl. 1, 144., 2015




vissza »