A Coprinopsis cinerea modell gomba szövetspecifikus transzkriptomikai vizsgálata  részletek

súgó  nyomtatás 
vissza »

 

Projekt adatai

 
azonosító
141400
típus MEC_R
Vezető kutató Varga Torda
magyar cím A Coprinopsis cinerea modell gomba szövetspecifikus transzkriptomikai vizsgálata
Angol cím Low-input tissue-specific RNA-seq of the model mushroom Coprinopsis cinerea
magyar kulcsszavak transzkriptomika, fejlődéstan, bioinformatika, genetika, evolúció
angol kulcsszavak transcriptomics, development, bioinformatics, genetics, evolution
megadott besorolás
Transzkriptomika (Orvosi és Biológiai Tudományok Kollégiuma)80 %
Genomika, összehasonlító genomika, funkcionális genomika (Orvosi és Biológiai Tudományok Kollégiuma)20 %
zsűri Mecenatúra 1. alprogram
Kutatóhely Biokémiai Intézet (HUN-REN Szegedi Biológiai Kutatóközpont)
projekt kezdete 2022-03-01
projekt vége 2022-03-31
aktuális összeg (MFt) 0.903
FTE (kutatóév egyenérték) 0.00
állapot lezárult projekt
magyar összefoglaló
A projekt keretében látogatni tervezett nemzetközi tudományos/innovációs rendezvény bemutatása és a tervezett részvétel ismertetése
Mutassa be a nemzetközi rendezvény jellegét, célját, szervezőit és jelentőségét a nemzetközi tudományos életben. Ismertesse a részvétel célját (pl. előadás, poszter, egyéb aktivitás), a rendezvényen való részvétel várható hatását és jelentőségét a saját kutatói karrier építésében.

A „Fungal Genetics Conference” már 31. alkalommal kerül megszervezésre a „Genetic Society of America” által, ahol a gomba genetikával foglalkozó kutatók gyűlnek össze a világ minden részéről neves meghívott előadók társaságában. A konferencia célja, hogy a gombagenetika élvonalbeli kutatásait felvonultatva teret adjon a legfrissebb információk cseréjére, illetve régi és új kapcsolatok ápolására és kialakítására. A konferencia szervezői külön figyelmet fordítanak a karrierjük elején járó kutatókra, így számos programot szerveznek a konferencia ideje alatt, úgy mint, külön foglalkozás új résztvevők számára, több nyelvű „networking” vagy panel beszélgetések az akadémiai pályaútról. A konferencia jelentőségét mutatja, hogy a meghívott előadók között számos világhírű intézet kutatója található, úgy mint, Gillian Turgeon (Cornell University) vagy Regine Kahmann (Max Plank Institute). A konferencián az elmúlt évek eredményeit összegző előadást tervezek tartani a fejlődésbiológiai és transzkriptomikai munkánkból. Azon kívül, hogy megtiszteltetés lenne előadnom egy ilyen neves konferencián és egy széles körhöz juttathatom el eredményeinket, a hallgatóságból érkező javaslatok, észrevételek nagyban hozzájárulhatnak kutatásunk végleges interpretációjához. A konferencia plenáris ülései között megtalálható az „evolúció és fejlődés” szekció, ami a kutatási területemhez szorosan kapcsolódik, így a legfrissebb kutatásokba nyerhetek betekintést és még publikálatlan kutatásokról kaphatok információt. Ebből kifolyólag lehetőségem nyílik a kutatási területem vezető kutatóival találkozni, beszélgetni és a szakmai jövőmre nézve hasznos kapcsolatokat kialakítani. Összességében, mint fiatal kutató nagy lehetőséget látok a konferencián történő részvételben, ugyanis nagyban hozzájárulhat ahhoz, hogy bekapcsolódjak a nemzetközi akadémiai életbe, bemutathassam a több éve készülő munkánkat, illetve megismerjem a területemen dolgozó neves kutatókat, ami nagy hatással lehet a karrieremre nézve.

A projekt összefoglalója, célkitűzései laikusok számára
Adjon egy rövid, közérthető ismertetést a látogatni tervezett nemzetközi rendezvényről, illetve a részvétel céljáról, várható eredményeiről.

A gombagenetika mindig egy központi helyett foglalt el a természettudományok között. Elég arra gondolni, hogy a pékélesztő (Saccharomyces cerevisiae) volt az első eukarióta élőlény (növényeket, állatokat és gombákat magába foglaló csoport), melynek a DNS-ben kódolt összes információ tartalmát megismertük. Ezért nem meglepő, hogy a gombagenetika egy tudományosan „forró pontnak” számít a kutatók között. A nemzetközi gombagenetika konferencia („Fungal Genetics Conference”) 31. alkalommal kerül megszervezésre Kalifornia Pacific Grove városában az Amerikai Genetikai Egyesület által. A konferencián a neves meghívott előadók mellett a fiatal kutatók is alkalmat kapnak kutatásaik bemutatására és azok megvitatására. Emellett a fiatal kutatók karrierjének támogatására és segítésére több programot is szerveznek, ahol megismerhetik az akadémiai élettel kapcsolatos kihívásokat és azokra történő válaszokat. A fentiek alapján nem volt kérdés, hogy számomra is nagy jelentőséggel bír, ha részt tudok venni a konferencián és bemutathatom legújabb eredményeinket. Kutatócsoportunkban a komplex soksejtűséget kutatva arra keressük a választ, hogy az élőlények milyen genetikai és evolúciós változásokon mentek keresztül ahhoz, hogy egy több szövettípust is magába foglaló, bonyolult háromdimenziós testfelépítést hozzanak létre. Ehhez a modern biológia eszköztárát hívtuk segítségül és a Coprinopsis cinerea modell gomba korai fejlődése során vizsgáltunk szövetspecifikus gén expressziós mintázatokat. Kutatásainknak jelentős biotechnológiai (gyógyszergyártásban és iparban számos soksejtű gombát alkalmaznak) és mezőgazdasági (termesztett gombáink soksejtű élőlények) hatása van, így fontosnak tartom, hogy eredményeinket széles közönség számára bemutassam. Ahogy a fentiekből is kiderült, a konferencia jelentős hatással lehet a karrieremre a fiatal kutatóknak szervezett programjaik által, valamint több világírű kutatóval is alkalmam nyílhat szakmai kapcsolatot kialakítani.

angol összefoglaló
Presentation of the international scientific/innovation event to be visited in the project and description of the proposed participation
Present the type, purpose, organizers, and significance of the international event in the scientific community. Present the purpose of the participation (e.g., paper, poster, other activity), the expected impact of the participation in the event and its significance in building your own research career.

The “Fungal Genetics Conference” is being organized for the 31st time by the “Genetic Society of America,” where researchers in fungal genetics gather all over the world in the company of distinguished invited speakers. The conference aims to provide an opportunity to exchange the latest information by presenting cutting-edge research in fungal genetics and facilitating the establishment of new relationships. The conference organizers pay special attention to early-stage researchers by organizing many programs during the conference, such as “Conference Success Tips and Welcome”, “Multilingual Networking” or “Careers in Academia”. The significance of the conference is shown by the fact that the invited speakers include researchers from several prestigious institutes, such as Cornell University (Gillian Turgeon) or Max Plank Institute (Regine Kahmann). I want to give an oral presentation summarizing the results of our developmental biology and transcriptomics research. In addition to the honor of presenting at such a renowned conference and disseminating our results to a wide audience, suggestions and comments from the audience can greatly contribute to the final interpretation of our research. The “evolution and development” plenary session is closely related to my field; therefore I can gain insights into the latest and unpublished pieces of research. The conference will provide me great opportunity to meet, talk and build relationships with leading researchers in my field of research that are useful for my professional future. Overall, as a young researcher, I see an excellent opportunity to attend the conference, as it can significantly contribute to my involvement in international academic life, propagate our work, and meet renowned researchers worldwide, which can have a great impact on my career.

Summary and aims of the project for a general audience
Provide a short, general introduction to the international event to be visited, the purpose of the participation, and its expected results.

Fungal genetics has always occupied a central place in natural sciences. For example, the baker’s yeast (Saccharomyces cerevisiae) was the first eukaryotic organism (a group that includes plants, animals, and fungi), of which all DNA coded information was decoded. Therefore, it is not surprising that fungal genetics is a scientifically “hot spot” among researchers. The Fungal Genetics Conference will be held for the 31st time in Pacific Grove, California, by the Genetics Society of America. Besides the well-known invited speakers at the conference, young researchers will also have the opportunity to present and discuss their research. In addition, several programs are organized to support and help young researchers’ careers by learning about the challenges of academic life and meeting with senior scientists. Based on the above, there was no question that it would be of great importance to me to attend the conference and present our latest results. Our group is studying the evolution and genetics of complex multicellularity to find answers to what changes organisms have undergone to create a complex three-dimensional body that includes various tissue types. To do this, we examined tissue-specific gene expression patterns during the early development of the Coprinopsis cinerea model fungus by using state-of-the-art methods. Our research could significantly impact biotechnology (many multicellular fungi are used in pharmaceuticals and industry) and agriculture (cultivated fungi are multicellular organisms). Therefore, presenting our results to a broad audience is important and can impact the community. As shown above, the conference could significantly impact my career by its programs dedicated to early-stage researchers and the opportunity to form professional relationships with several world-renowned researchers.






 

Zárójelentés

 
kutatási eredmények (magyarul)
A projekt célja a „Fungal Genetics Conference” című konferencián való részvétel és a megnevezett projekt bemutatása poszter prezentáció formájában. A konferencia 2022. március 15-20 között került megszervezésre a Genetics Society of America által Pacific Grove (USA, Kalifornia) városában. A konferencia célja, hogy a gombagenetika élvonalbeli kutatásait felvonultatva teret adjon a legfrissebb információk cseréjére, illetve új kapcsolatok kialakítására. Ennek megfelelően alkalmam nyílt a konferencia ideje alatt minden délelőtt neves kutatók plenáris előadásait meghallgatni. Ezek közül kiemelném például Norio Takeshita (University of Tsukuba, Japan) előadását, aki egy mikrokapilláris rendszert használva kimutatta, hogy a gyorsan növekvő gombafajok sejtjei kevéssé plasztikusak, mint a lassan növő fajoké. A tudományos poszterek bemutatására esténként került sor 19:30 és 21:30 között. Ez az esemény is kiváló alkalomnak bizonyult, hogy több kutatót és munkájukat is megismerhessem. A saját munkámat a március 16.-ai poszter szekción mutattam be. Munkám nagy érdeklődésre tett szert ugyanis az ott eltöltött idő alatt folyamatosan érkeztek érdeklődök, aminek köszönhetően értékes visszajelzéseket kaptam a munkámra nézve. A konferencia ideje alatt számos neves kutatóval volt szerencsém beszélgetésbe elegyedni (David Hibbett, Nicolas Corradi, Joseph Heitman), ami nem csak inspirálóan hatott munkámra nézve, de hasznos tanácsokat és javaslatokat is kaptam a szenior kutatóktól.
kutatási eredmények (angolul)
The purpose of this project was to participate in the "Fungal Genetics Conference" and present my research as a poster presentation. The Genetics Society of America organized the conference in Pacific Grove (USA, California) from March 15-20, 2022. The goal of the conference is to exhibit cutting-edge research in fungal genetics and to provide space for the exchange of the latest information and the development of new relationships. Accordingly, I had the opportunity to listen to the plenary lectures of renowned researchers every morning. Among these, I would highlight, for example, the presentation of Norio Takeshita (University of Tsukuba, Japan), who showed that the cells of fast-growing fungal species are less plastic than those of slow-growing species by using a microcapillary system. The scientific posters were presented in the evenings between 19:30 and 21:30. This event also proved to be an excellent opportunity for me to get to know several researchers and their work. I presented my research in the poster section on March 16. My work gained much interest because researchers continuously visited my poster and asked questions during my session. Thanks to this, I received valuable feedback about my work. Finally, I also had the chance to talk with many renowned researchers (David Hibbett, Nicolas Corradi, Joseph Heitman), which not only inspired my work, but I also received useful advice and suggestions from the senior researchers.
a zárójelentés teljes szövege https://www.otka-palyazat.hu/download.php?type=zarobeszamolo&projektid=141400
döntés eredménye
igen





 

Közleményjegyzék

 
Varga T., Bálint B., Bense V., Nagy LG.: Widespread tissue-specific gene expression during fruiting body development of Coprinopsis cinerea revealed by laser-capture microscopy coupled single-cell RNA sequencing., Absztrakt könyv: 31st Fungal Genetics Conference. Pacific Groove, USA, 15-20. March. 2022. p.111., 2022




vissza »