A molekuláris onkogenezis vizsgálata humán chordomában: fókuszban a korai diagnosztika és a hatékony kezelés  részletek

súgó  nyomtatás 
vissza »

 

Projekt adatai

 
azonosító
104604
típus PD
Vezető kutató Lazáry Áron
magyar cím A molekuláris onkogenezis vizsgálata humán chordomában: fókuszban a korai diagnosztika és a hatékony kezelés
Angol cím Molecular oncogenesis in human chordoma: targeting early diagnosis and effective therapy
magyar kulcsszavak chordoma, génexpresszió, mikroRNS, microarray, onkogenezis
angol kulcsszavak chordoma, gene expression, microRNA, microarray, oncogenesis
megadott besorolás
Ortopédia, sportorvostan, reumatológia, rehabilitáció (Orvosi és Biológiai Tudományok)50 %
Ortelius tudományág: Mozgásszervi gyógyászat
Általános biokémia és anyagcsere (Orvosi és Biológiai Tudományok)50 %
Ortelius tudományág: Molekuláris biológia
zsűri Molekuláris és Szerkezeti Biológia, Biokémia
Kutatóhely Budai Egészségközpont Kft.
projekt kezdete 2012-09-01
projekt vége 2015-08-31
aktuális összeg (MFt) 14.886
FTE (kutatóév egyenérték) 2.40
állapot aktív projekt





 

Zárójelentés

 
kutatási eredmények (magyarul)
A kutatás fő eredményeképpen kifejlesztésre került egy olyan, validált RNS izolálási protokoll, amely alkalmazásával a chordoma szövetmintákból megfelelően magas minőségű RNS nyerhető. Két különböző chordoma sejtvonalat sikerült megalapoznunk. Elvégeztük a brachyury génben elhelyezkedő rs2305089 kandidáns SNP genotipizálását és a brachyury immunhisztokémiai vizsgálatát szövettani blokkokból nyert mintákon és eredményeinket nemzetközi kutatócsoporthoz csatlakozva publikáltuk. Sikeresen elvégeztük a chordoma minták komparatív, új generációs mRNS szekvenálását és a nyers adatok bioinformatikai elemzését. A korábban publikált chordomára jellemző génexpressziós változások zömét vizsgálatunkban megerősítettük és számos új, az onkogenezisben feltéelezhető szereppel bíró gént/génclustert azonosítottunk. A transzkriptomikai módszerváltásnak köszönhetően a világon először végeztünk chordoma RNS szekvenálást, ami jóval mélyebb, többrétűbb bioinformatikai elemzésre ad lehetőséget. Az új generációs szekvenálási adatok nemcsak a klasszikus génexpressziós mintázat feltérképezésére és a kandidáns gének kiszűrése alkalmas, hanem lehetőséget nyújt mutáció analízisre és fúziós gének/géntermékek kimutatására is. A projekt eredményeként könyvelhető el az is, hogy eredményes, nemzetközi kapcsolatokkal is rendelkező hazai kutatókonzorcium jött létre. A projekt során felgyűlt klinikai tapasztalatokat is folyamatosan publikáltuk.
kutatási eredmények (angolul)
As the main results of the project, a new, validated protocol was developed for the isolation of high quality RNA from chordoma samples. We established two new chordoma cell-lines. We genotyped the brachyury rs2305089 candidate SNP and performed an immunohistochemistry analysis on brachyury tissue expression. These results have been published within the framework of an international research consortium. The next generation mRNA sequencing method was succesfully applied onto the chordoma and nucleus pulposus samples and the first steps of the bioinformatic analysis of the raw data have been also performed. We confirmed the previously published gene expression data on our chordoma cohort and new genes and gene-clusters of interest have been discovered. Due to the change in the molecular method, we have performed the first next generation RNA sequencing (NGS) project on chordoma samples providing the possibility for a deeper and multilevel bioinformatic analyis. The NGS data are suitable not only for the classic gene expression profiling and the filtering of the candidate genes, but also for mutation analysis and detection of fusion genes/gene products. As a result of the project, an efficient, national research consortium with living international relationships has been formed. Scientific clinical data collected during the project have been also continuously published.
a zárójelentés teljes szövege https://www.otka-palyazat.hu/download.php?type=zarobeszamolo&projektid=104604
döntés eredménye
igen





 

Közleményjegyzék

 
Varga PP, Szoverfi Z, Lazary A: Surgical resection and reconstruction after resection of tumors involving the sacropelvic region., NEUROL RES 36: (6) 588-596, 2014
Varga PP, Szoverfi Z, Lazary A: Surgical treatment of primary malignant tumors of the sacrum, NEUROL RES 36: (6) 577-87, 2014
A. Bozsodi Lazáry Áron, Papp Gergő, Sápi Zoltán, Varga Péter Pál: A Brachyury szerepe a chordoma onkogenezisében, Magyar Ortopédtársaság Kongresszusa, Sárvár, 2015
A.Bozsodi, P.P.Varga, Á.Lazáry: Molecular targets in chordoma, AO Spine Interdisciplinary Course of Spinal Tumors 2015, Valencia, Spain, 2015
Szövérfi Zsolt, Lazáry Áron, Varga Péter Pál: MŰTÉTI SZÖVŐDMÉNYEK KERESZTCSONTI CHORDOMA KEZELÉSE KAPCSÁN, A Magyar Ortopédtársaság és a Magyar Traumatológus Társaság 2013. évi közös kongresszusa, 2013
Bozsódi Árpád, Lazáry Áron, Szövérfi Zsolt, Varga Péter Pál: A CHORDOMA MOLEKULÁRIS ONKOGENÉZISE, A Magyar Gerincgyógyászati Társaság 2012. évi tudományos ülése, 2012
Zsolt Szoverfi, Aron Lazary, Arpad Bozsodi, Peter Paul Varga: THE PRIMARY TUMOR MORTALITY SCORE: NEW TOOL FOR THE ESTIMATION OF SURVIVAL IN PRIMARY SPINE TUMOR PATIENTS, Eurospine 2013, 2013
Peter Paul Varga, Zsolt Szoverfi, Aron Lazary: Surgical resection and reconstruction after resection of tumors involving the sacropelvic region, Neurological Research, 2014
Varga PP, Szövérfi Z, Lazary A: Surgical treatment of primary malignant tumors of the sacrum, Neurological Research, 2014
Szövérfi Z, Lazáry A, Bozsódi A, Klemencsics I, Eltes P, Varga PP: Primary Spinal Tumor Mortality Score (PSTMS): a novel scoring system for predicting poor survival, The Spine Journal, 2014
P. P. Varga, C. G. Fisher, L. D. Rhines, Z. L. Gokaslan, S. Boriani, Á. Lazary, W. Wang, A. Bozsodi, S. Yip, C. Bettegowda: Prognostic Significance of T Gene SNP rs2305089 in Individuals With Spinal Column Chordoma, EMSOS 2014 - 27th Annual Meeting of the European Musculo-Skeletal Oncology Society, 2014
A.Bozsodi, P.P.Varga, Á.Lazáry: Molecular targets in chordoma, AO Spine Masters symposium Budapest, 2014
P. P. Varga, C. G. Fisher, L. D. Rhines, Z. L. Gokaslan, S.Boriani, Á. Lazary, W. Wang, A.Bozsodi, S. Yip, C.Bettegowda: Prognostic significance of T gene SNP s2305089 in individuals with spinal column chordoma, Eurospine, Lyon, 2014




vissza »