Prosztata daganat biomarkerek tömegspektrometrián alapuló azonosítása szöveti mikroarray-ek vizsgálatán keresztül  részletek

súgó  nyomtatás 
vissza »

 

Projekt adatai

 
azonosító
121187
típus PD
Vezető kutató Turiák Lilla
magyar cím Prosztata daganat biomarkerek tömegspektrometrián alapuló azonosítása szöveti mikroarray-ek vizsgálatán keresztül
Angol cím Mass spectrometry based identification of prostate cancer biomarkers from tissue microarrays
magyar kulcsszavak tömegspektrometria, glükózaminoglikán, glikopeptid, prosztata daganat, nanoLC-MS(MS), szöveti mikroarray
angol kulcsszavak mass spectrometry, glycosaminoglycan, glycopeptide, prostate cancer, nanoLC-MS(MS), tissue microarray
megadott besorolás
Tumorbiológia (Orvosi és Biológiai Tudományok Kollégiuma)40 %
Ortelius tudományág: Onkológia
Analitikai kémia (Élettelen Természettudományok Kollégiuma)40 %
Ortelius tudományág: Műszeres analitika
Általános biokémia és anyagcsere (Orvosi és Biológiai Tudományok Kollégiuma)20 %
Ortelius tudományág: Szövetkémia
zsűri Élettan, Kórélettan, Gyógyszertan és Endokrinológia
Kutatóhely Szerves Kémiai Intézet (Természettudományi Kutatóközpont)
résztvevők Vékey Károly
projekt kezdete 2016-12-01
projekt vége 2021-05-31
aktuális összeg (MFt) 15.087
FTE (kutatóév egyenérték) 2.80
állapot aktív projekt





 

Zárójelentés

 
kutatási eredmények (magyarul)
Kutatásom célja korszerű nanoUHPLC-MS(MS) technikák kidolgozása és alkalmazása volt formalin-fixált, paraffinba ágyazott prosztata szövetek felületéről kivont peptidek, N-glikopeptidek és glükózaminoglikánok vizsgálatára. A daganat kialakulásához vezető rendellenességek molekuláris szinten történő felfedezése nélkülözhetetlen a kezelés és diagnózis új stratégiáinak kidolgozása szempontjából. A kutatás során több olyan analitikai módszert is fejlesztettünk és integráltunk munkafolyamatainkba, amelyek a terület vezető szaklapjaiban kerültek publikálásra. A fejlesztett módszerek lehetővé tették néhány mm2-es szöveti régiók átfogó glikomikai és proteomikai jellemzését. Vizsgálataink során számos új eredménnyel gazdagítottuk a prosztatarák során bekövetkező molekuláris változásokkal kapcsolatos ismereteket. Például, a különböző kockázati csoportba tartozó prosztatarákos és jóindulatú prosztatamegnagyobbodással rendelkező betegek elkülöníthetők a szövetminták kondroitin-szulfát tartalma és szulfatációs mintázata alapján. Egészséges és különböző grádusba tartozó rákos prosztata szöveti mikrometszetek vizsgálata során azonosításra kerültek a különböző mintacsoportok közti molekuláris különbségek mind a fehérjeexpresszió, mind a hely-specifikus N-glikoziláció tekintetében. A kutatásaink során azonosított biomarker jelöltek nem-invazív úton (pl. vérplazma, vizelet) történő detektálása jövőbeli kutatásokhoz fontos alapot képez.
kutatási eredmények (angolul)
The aim of the research was to develop and apply state-of-the-art nanoUHPLC-MS(MS) methods for analyzing peptides, N-glycopeptides and glycosaminoglycans extracted from the surface of formalin fixed, paraffin-embedded prostate tissues. Identifying anomalies at the molecular level leading to cancer is essential to develop new strategies for treatment and diagnosis. Several analytical methods were developed and integrated into our workflows during the course of the research; all of them have been published in leading scientific journals of the field. Using the developed methods, detailed proteomic and glycomic characterization of tissue areas corresponding to few mm2 became feasible. Our new discoveries improved the understanding of molecular alterations occurring during prostate cancer. For example, benign prostate hyperplasia patients and prostate cancer patients belonging to different risk groups could be distinguished based on the chondroitin sulfate content and sulfation pattern of the tissue samples. Molecular alterations were identified with respect to protein expression levels and site-specific N-glycosylation in the case of healthy and cancerous prostate biopsies belonging to different grades. The biomarker candidates identified in our studies can pave the way for future research aiming for their non-invasive detection (e.g. blood plasma, urine).
a zárójelentés teljes szövege https://www.otka-palyazat.hu/download.php?type=zarobeszamolo&projektid=121187
döntés eredménye
igen





 

Közleményjegyzék

 
Sugár Simon, Tóth Gábor, Bugyi Fanni, Vékey Károly, Karászi Katalin, Drahos László, Turiák Lilla: Alterations in protein expression and site-specific N-glycosylation of prostate cancer tissues, SCIENTIFIC REPORTS 11: (1) 15886, 2021
Tóth Gábor, Pál Domonkos, Vékey Károly, Drahos László, Turiák Lilla: Stability and recovery issues concerning chondroitin sulfate disaccharide analysis, ANALYTICAL AND BIOANALYTICAL CHEMISTRY, 2021
Tóth Gábor, Vékey Károly, Drahos László, Horváth Viola, Turiák Lilla: Salt and solvent effects in the microscale chromatographic separation of heparan sulfate disaccharides., JOURNAL OF CHROMATOGRAPHY A 1610: 460548, 2020
Tóth Gábor, Vékey Károly, Sugár Simon, Kovalszky Ilona, Drahos László, Turiák Lilla: Salt gradient chromatographic separation of chondroitin sulfate disaccharides, JOURNAL OF CHROMATOGRAPHY A 1619: 460979, 2020
Turiák Lilla, Sugár Simon, Ács András, Tóth Gábor, Gömöry Ágnes, Telekes András, Vékey Károly, Drahos László: Site-specific N-glycosylation of HeLa cell glycoproteins, SCIENTIFIC REPORTS 9: (1) 14822, 2019
Turiák L, Ozohanics O, Tóth G, Ács A, Révész Á, Vékey K, Telekes A, Drahos L.: High sensitivity proteomics of prostate cancer tissue microarrays to discriminate between healthy and cancerous tissue., J Proteomics. 2018 Nov 12. pii: S1874-3919(18)30399-3., 2018
Turiák L, Ozohanics O, Tóth G, Ács A, Révész Á, Vékey K, Telekes A, Drahos L.: High sensitivity proteomics of prostate cancer tissue microarrays to discriminate between healthy and cancerous tissue., J Proteomics. 2018 Nov 12. pii: S1874-3919(18)30399-3., 2018
Ács A, Ozohanics O, Vékey K, Drahos L, Turiák L.: Distinguishing Core and Antenna Fucosylated Glycopeptides Based on Low-Energy Tandem Mass Spectra., Anal Chem. 2018 Nov 6;90(21):12776-12782, 2018
Turiák L, Tóth G, Ozohanics O, Révész Á, Ács A, Vékey K, Zaia J, Drahos L.: Sensitive method for glycosaminoglycan analysis of tissue sections., J Chromatogr A. 2018 Apr 6;1544:41-48., 2018
Ács A, Ozohanics O, Vékey K, Drahos L, Turiák L.: Distinguishing Core and Antenna Fucosylated Glycopeptides Based on Low-Energy Tandem Mass Spectra., Anal Chem. 2018 Nov 6;90(21):12776-12782, 2018
Turiák L, Ozohanics O, Tóth G, Ács A, Révész Á, Vékey K, Telekes A, Drahos L.: High sensitivity proteomics of prostate cancer tissue microarrays to discriminate between healthy and cancerous tissue., J Proteomics. 2018 Nov 12. pii: S1874-3919(18)30399-3., 2018
Turiák L, Tóth G, Ozohanics O, Révész Á, Ács A, Vékey K, Zaia J, Drahos L.: Sensitive method for glycosaminoglycan analysis of tissue sections., J Chromatogr A. 2018 Apr 6;1544:41-48., 2018
Turiák Lilla, Ozohanics Oliver, Tóth Gábor, Ács András, Révész Ágnes, Vékey Károly, Telekes András, Drahos László: High sensitivity proteomics of prostate cancer tissue microarrays to discriminate between healthy and cancerous tissue, Journal of Proteomics, 2018
Ács András, Ozohanics Oliver, Vékey Károly, Drahos László, Turiák Lilla: Distinguishing Core and Antenna Fucosylated Glycopeptides Based on Low-Energy Tandem Mass Spectra, Analytical Chemistry, 2018
Turiák Lilla, Sugár Simon, Ács András, Gömöry Ágnes, Vékey Károly, Drahos László: Dúsítási módszer komplex fehérjekeverék glikozilációs mintázatának meghatározására, http://www.vandorgyules.mett.hu/tudomanyos-program, 2018
Turiák Lilla, Tóth Gábor, Ács András, Révész Ágnes, Vékey Károly, Drahos László: Integrated Proteomics and Glycomics of Prostate Cancer Tissue Microarrays, http://www.balaton.mett.hu/program_flip/FinalProgram2017_smart.pdf, 2017
Turiák Lilla, Révész Ágnes, Ács András, Vékey Károly, Drahos László: PROTEOMIC AND GLYCOMIC CHARACTERIZATION OF PROSTATE CANCER TISSUE MICROARRAYS, https://imms2017aussois.sciencesconf.org/data/pages/Program_IMMS_2017VF2.pdf, 2017
Turiák Lilla, Tóth Gábor, Révész Ágnes, Ács András, Vékey Károly, Drahos Láaszló: Nanoscale analysis of prostate cancer tissue microarrays, http://7thbbbb.com/wp-content/uploads/2017/09/final_scientific_program_20170929.pdf, 2017
Turiák Lilla, Tóth Gábor, Ozohanics Oliver, Révész Ágnes, Ács András, Vékey Károly, Zaia Joseph, Drahos László: Sensitive method for glycosaminoglycan analysis of tissue sections, Journal of Chromatography A, 2018
Tóth Gábor, Sugár Simon Nándor, Pál Domonkos, Fügedi Kata Dorina, Szarvas Tibor, Drahos László, Kovalszky Ilona, Turiák Lilla: Glükózaminoglikánok változásai jóindulatú prosztata megnagyobbodásban és prosztatarákban, https://mett25.hu/tudomanyos-program/, 2021




vissza »