A makrofágok angiogenikus hatésénak transzkripciós alapjai  részletek

súgó  nyomtatás 
vissza »

 

Projekt adatai

 
azonosító
126885
típus KH
Vezető kutató Nagy László
magyar cím A makrofágok angiogenikus hatésénak transzkripciós alapjai
Angol cím Dissecting the transcriptional network allowing macrophages to control angiogenesis
magyar kulcsszavak génexpresszió, magreceptorok, makrofág, angiogenezis
angol kulcsszavak gene expression, nuclear receptors, macrophage, angiogenesis
megadott besorolás
Epigenetika és génszabályozás (Orvosi és Biológiai Tudományok Kollégiuma)50 %
Molekuláris Biológia (Orvosi és Biológiai Tudományok Kollégiuma)30 %
Ortelius tudományág: Molekuláris biológia
Genomika, összehasonlító genomika, funkcionális genomika (Orvosi és Biológiai Tudományok Kollégiuma)20 %
zsűri Genetika, Bioinformatika és Rendszerbiológia
Kutatóhely ÁOK Biokémiai és Molekuláris Biológiai Intézet (Debreceni Egyetem)
résztvevők Czimmerer Zsolt
Tzerpos Petros
projekt kezdete 2017-12-01
projekt vége 2019-11-30
aktuális összeg (MFt) 20.000
FTE (kutatóév egyenérték) 1.73
állapot aktív projekt





 

Zárójelentés

 
kutatási eredmények (magyarul)
Makrofágok gyorsan változtatják a sejtes fenotípusukat és polarizálódnak. Munkánk során epigenomikai (RNA-seq, CHIP-seq es ATAC-seq) és bioinformatikai módszereket használva az ún. alternatív polarizációt tanulmányoztuk és meghatároztuk a magreceptor, PPARg szerepét a polarizáció folyamatában illetve azonosítottuk az Egr2 transzkripciós faktort, mint, ami összeköti a polarizációt szabályozó IL4/STAT6 szignálútvonalat a polarizáció másodlagos transzkripciós eseményeivel. Ezek az eredmények arra utalnak, hogy az IL4 mint polarizációs szignál egy tranziens transzkripciós jelet hoz létre a STAT6 foszforilációja és genomi kötése által. Ez a néhány óra alatt lezajló folyamat ez Egr2 transzkripciós faktor indukálásával elindít egy transzkripciós kaszkádot, aminek egyik tagja a PPARg magreceptor egyéb más transzkripciós faktorokkal együtt. A PPARg nagyrészt ligand hatása nélkül az epigenom szerkezeti fehérjéjeként játszik szerepet génexpresszió kifejezés szabályozásában.
kutatási eredmények (angolul)
Macrophages rapidly change their phenotype and polarize into functionally distinct subtypes while responding to microenvironmental cues. The proximal transcription factors (TFs) of the polarization signals are identified, but their activity is typically transient and thus fail to explain the sustained and fixed genomic programs achieved. Here, by mapping the early and late epigenomic changes of interleukin-4 (IL-4)-mediated alternative macrophage polarization we identified the TF Early Growth Response 2 (EGR2), bridging the proximal (early) and secondary (late) gene expression program of polarization. EGR2 is a directly IL-4/STAT6-regulated TF, responsible for 77% of the induced, polarization gene signature, including a large TF network. Mechanistically, EGR2 binding induced chromatin accessibility, recruited chromatin remodelers, cofactors and RNA-polymerase II for the execution of the late polarization program. Thus, our study identified EGR2, as a STAT6-dependent TF, representing a key link into the secondary transcriptional events of alternative macrophage polarization.
a zárójelentés teljes szövege https://www.otka-palyazat.hu/download.php?type=zarobeszamolo&projektid=126885
döntés eredménye
igen





 

Közleményjegyzék

 
Horvath Attila, Daniel Bence, Szeles Lajos, Cuaranta-Monroy Ixchelt, Czimmerer Zsolt, Ozgyin Lilla, Steiner Laszlo, Kiss Mate, Simandi Zoltan, Poliska Szilard, Giannakis Nikolas, Raineri Emanuele, Gut Ivo G, Nagy Benedek, Nagy Laszlo: Labelled regulatory elements are pervasive features of the macrophage genome and are dynamically utilized by classical and alternative polarization signals, NUCLEIC ACIDS RESEARCH 47: (6) pp. 2778-2792., 2019
Patsalos Andreas, Tzerpos Petros, Halasz Laszlo, Nagy Gergely, Pap Attila, Giannakis Nikolas, Lyroni Konstantina, Koliaraki Vasiliki, Pintye Eva, Dezso Balazs, Kollias George, Spilianakis Charalampos G., Nagy Laszlo: The BACH1–HMOX1 Regulatory Axis Is Indispensable for Proper Macrophage Subtype Specification and Skeletal Muscle Regeneration, JOURNAL OF IMMUNOLOGY 203: pp. 1532-1547., 2019
Simándi Zoltán, Pajer Krisztián, Károlyi Katalin, Sieler Tatiana, Jiang Lu-Lin, Kolostyák Zsuzsanna, Sári Zsanett, Fekecs Zoltán, Pap Attila, Patsalos Andreas, Contreras Gerardo Alvarado, Rehó Bálint, Papp Zoltán, Guo Xiufang, Horváth Attila, Kiss Gréta, Keresztessy Zsolt, Vámosi György, Hickman James, Xu Huaxi, Dormann Dorothee, Hortobágyi Tibor, Antal Miklós, Nógrádi Antal, Nagy László: Arginine Methyltransferase PRMT8 Provides Cellular Stress Tolerance in Aging Motoneurons, JOURNAL OF NEUROSCIENCE 38: (35) pp. 7683-7700., 2018
Czimmerer Z, Daniel B, Horvath A, Ruckerl D, Nagy G, Kiss M, Peloquin M, Budai MM, Cuaranta-Monroy I, Simandi Z, Steiner L, Nagy B Jr, Poliska S, Banko C, Bacso Z, Schulman IG, Sauer S, Deleuze JF, Allen JE, Benko S, Nagy L: The Transcription Factor STAT6 Mediates Direct Repression of Inflammatory Enhancers and Limits Activation of Alternatively Polarized Macrophages., IMMUNITY 48: (1) pp. 75-90., 2018
Daniel B, Nagy G, Horvath A, Czimmerer Z, Cuaranta-Monroy I, Poliska S, Hays TT, Sauer S, Francois-Deleuze J, Nagy L: The IL-4/STAT6/PPARgamma signaling axis is driving the expansion of the RXR heterodimer cistrome, providing complex ligand responsiveness in macrophages., NUCLEIC ACIDS RES 46: (9) pp. 4425-4439., 2018
Zsolt Czimmerer, Attila Horvath, Bence Daniel, Gergely Nagy, Ixchelt Cuaranta-Monroy, Mate Kiss, Zsuzsanna Kolostyak, Szilard Poliska, Laszlo Steiner, Nikolas Giannakis, Tamas Varga, Laszlo Nagy: Dynamic transcriptional control of macrophage miRNA signature via inflammation responsive enhancers revealed using a combination of next generation sequencing-based appro, Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Gene Regulatory Mechanisms 1861 pp. 14-28., 2018, 2018
Zsolt Czimmerer, Zsuzsanna S.Nagy, Gergely Nagy, Attila Horvath, Timea Silye-Cseh, Agnes Kriston, David Jonas, Sascha Sauer, Laszlo Steiner, Bence Daniel, Jean-Francois Deleuze, Laszlo Nagy: Extensive and functional overlap of the STAT6 and RXR cistromes in the active enhancer repertoire of human CD14+ monocyte derived differentiating macrophages, Mol Cell Endocrinol. (471): 63-74., 2018, 2018
Bence Daniel,Gergely Nagy, Zsolt Czimmerer, Attila Horvath, David W.Hammers, Ixchelt Cuaranta-Monroy, Szilard Poliska, Petros Tzerpos, Zsuzsanna Kolostyak, Tristan T.Hays, Andreas Patsalos, René Houtman, Sascha Sauer, Jean Francois-Deleuze, Fraydoon Rastinejad, Balint L.Balint, Lee Sweeney, Laszlo Nagy: The Nuclear Receptor PPARγ Controls Progressive Macrophage Polarization as a Ligand-Insensitive Epigenomic Ratchet of Transcriptional Memory, Immunity 49: (4) pp. 615-626., 2018, 2018
Andreas Patsalos, Zoltan Simandi, Tristan T. Hays, Matthew Peloquin, Matine Hajian, Isabella Restrepo, Paul M. Coen, Alan J. Russell, Laszlo Nagy: n vivo GDF3 administration abrogates aging related muscle regeneration delay following acute sterile injury, AGING CELL 17 : 5 Paper: e12815 (2018), 2018
Daniel B, Nagy G, Horvath A, Czimmerer Z, Cuaranta-Monroy I, Poliska S, Hays TT, Sauer S, Francois-Deleuze J, Nagy L: The IL-4/STAT6/PPARgamma signaling axis is driving the expansion of the RXR heterodimer cistrome, providing complex ligand responsiveness in macrophages., NUCLEIC ACIDS RES 46: (9) pp. 4425-4439., 2018





 

Projekt eseményei

 
2018-12-19 12:57:20
Résztvevők változása
2018-10-15 15:38:44
Résztvevők változása




vissza »