Bacteria on optical biochips: fundamentals and model systems  Page description

Help  Print 
Back »

 

Details of project

 
Identifier
126900
Type KH
Principal investigator Horváth, Róbert
Title in Hungarian Baktériumok optikai biochipeken: alapjelenségek és modell rendszerek
Title in English Bacteria on optical biochips: fundamentals and model systems
Keywords in Hungarian baktérium, optikai szenzor, bioszenzor
Keywords in English bacteria, optical sensor, biosensor
Discipline
Medical engineering and technology (Council of Medical and Biological Sciences)50 %
Material Science and Technology (physics) (Council of Physical Sciences)30 %
Ortelius classification: Biomedical engineering
Biophysics (Council of Physical Sciences)20 %
Panel Clinical Medicine
Department or equivalent Institute of Technical Physics and Materials Science (Centre for Energy Research)
Participants Bősze, Szilvia
Kovács, Boglárka
Kurunczi, Sándor
Péter, Beatrix Éva
Saftics, András
Szabó, Bálint
Székács, Inna
Starting date 2017-12-01
Closing date 2020-05-31
Funding (in million HUF) 19.972
FTE (full time equivalent) 4.74
state closed project
Summary in Hungarian
A kutatás összefoglalója, célkitűzései szakemberek számára
Itt írja le a kutatás fő célkitűzéseit a témában jártas szakember számára.

Az MTA EK MFA-ban található Nanobioszenzoika Lendület Kutatócsoport az utóbbi években egy unikális műszerparkot alakított ki emlős sejtek adhézióinak tanulmányozására (rákos és immun sejtek). A jelen "pilot" kutatási projekt célja ezen eszközpark és felhalmozott tudás mozgósítása bakteriális sejtek adhéziós folyamatainak alapkutatására. Ennek érdekében modell felületeket fogunk kialakítani, melyek a megfertőzés előtt álló emlős sejt vagy pedig a patogén baktérium felületét imitálják. A biofizikai-biológiai folyamatokat modern optikai bioszenzorokkal és egyedi sejtes erő mérésére alkalmas biofizikai módszerekkel tervezzük nyomon követni. Ezen technikák a számítógép vezérelt mikropipetta és a FluidFM mérőrendszer.

Mi a kutatás alapkérdése?
Ebben a részben írja le röviden, hogy mi a kutatás segítségével megválaszolni kívánt probléma, mi a kutatás kiinduló hipotézise, milyen kérdéseket válaszolnak meg a kísérletek.

Pontosan milyen kémiai és biofizikai ingerek és folyamatok befolyásolják a bakteriális sejtek adhézióját és internalizációját.

Mi a kutatás jelentősége?
Röviden írja le, milyen új perspektívát nyitnak az alapkutatásban az elért eredmények, milyen társadalmi hasznosíthatóságnak teremtik meg a tudományos alapját. Mutassa be, hogy a megpályázott kutatási területen lévő hazai és a nemzetközi versenytársaihoz képest melyek az egyediségei és erősségei a pályázatának!

A kutatás várható eredményei közé tartoznak baktérium taszító, illetve megkötő szintetikus felületek kifejlesztései és a bakteriális adhézió, mint alapjelenség, mélyebb és pontosabb megértése. Ezáltal potenciálisan sikerrel szállhatunk szembe az egyre nagyobb gondot jelentő multirezisztens baktériumok elleni küzdelemben is a bakteriális adhézió illetve emlős sejtbe történő baktérium internalizáció specifikus gátlásával.

A kutatás összefoglalója, célkitűzései laikusok számára
Ebben a fejezetben írja le a kutatás fő célkitűzéseit alapműveltséggel rendelkező laikusok számára. Ez az összefoglaló a döntéshozók, a média, illetve az érdeklődők tájékoztatása szempontjából különösen fontos az NKFI Hivatal számára.

A kutatás várható eredményei közé tartoznak baktérium taszító, illetve megkötő szintetikus felületek kifejlesztései és a bakteriális adhézió, mint alapjelenség, mélyebb és pontosabb megértése. Ezáltal potenciálisan sikerrel szállhatunk szembe az egyre nagyobb gondot jelentő multirezisztens baktériumok elleni küzdelemben is a bakteriális adhézió illetve emlős sejtbe történő baktérium internalizáció specifikus gátlásával.
Summary
Summary of the research and its aims for experts
Describe the major aims of the research for experts.

The Nanobiosensorics Group have developed a unique instrumentation basis and knowledge to study the adhesion of mammalian cells (immune and cancer cells). The aim of the present pilot project is to exploit these unique facilities and knowledge in the field of bacterial adhesion and internalization. Modern optical configuration and force measuring biophysical techniques will be developed and used, such as computer controlled micropipette and FluidFM.

What is the major research question?
Describe here briefly the problem to be solved by the research, the starting hypothesis, and the questions addressed by the experiments.

The more precise understanding of bacterial adhesion processes fro a biophysics perspective.

What is the significance of the research?
Describe the new perspectives opened by the results achieved, including the scientific basics of potential societal applications. Please describe the unique strengths of your proposal in comparison to your domestic and international competitors in the given field.

The present research will potentially develop novel surfaces with bacterial repellent or adhesive properties. The more precise understanding of the related biophysical processes will be aimed, too. Therefore, fight against multiresistent bacteria will be strengthened by offering new surfaces and methodologies to block internalization.

Summary and aims of the research for the public
Describe here the major aims of the research for an audience with average background information. This summary is especially important for NRDI Office in order to inform decision-makers, media, and others.

The present research will potentially develop novel surfaces with bacterial repellent or adhesive properties. The more precise understanding of the related biophysical processes will be aimed, too. Therefore, fight against multiresistent bacteria will be strengthened by offering new surfaces and methodologies to block internalization.





 

Final report

 
Results in Hungarian
A kutatási projekt célja élő sejtek adhéziós folyamatainak alapkutatása volt, melyet bioszenzorokkal, és egyedi sejtek mérésére alkalmas biofizikai módszerekkel valósítottunk meg. Előkísérleteket is végeztünk ezen módszerekkel (számítógép vezérelt mikropipetta, FluidFM, Epic Cardio bioszenzor), hogy még pontosabb eredményeket kaphassunk a további célzott méréseknél. A kutatás során modell felületeket is ki tudtunk alakítani, melyek baktériumokat és emlős sejteket taszító, illetve azokat specifikusan megkötő tulajdonságokkal bírnak. Méréseink során bakteriális flagellineket, illetve élő baktériumokat imitáló mikrogyöngyöket és nanorészecskéket is alkalmaztunk a folyamatok egyszerű modellezéséhez és megértéséhez. A projekt eredményeképp önszerveződő flagellin monorétegeket alakítottunk ki hidrofób felületeken. Molekuláris szintű interakciókat figyeltün meg, és az adhéziós erő mérését végeztük el mikrogyöngyök, mint modell rendszer, segítségével. Bakteriális sejtek emlős sejtekbe hatolását nanorészecskékkel imitáltuk, és valós időben monitoroztuk, így kinetikai információkat kaptunk a végbemenő folyamatokról.
Results in English
The aim of the project was to perform basic research of living cell adhesion processes, which was carried out with biosensors and biophysical methods suitable for measuring individual cells. Preliminary experiments were also performed with these methods (computer-controlled micropipette, FluidFM, Epic Cardio biosensor), in order to obtain even more accurate results for further targeted measurements. In the course of the research, we were also able to design model surfaces that have repellent and binding properties on bacteria and mammalian cells. In our measurements, we applied bacterial flagellins, microbeads and functionalized nanoparticles to mimic living bacterial cells for simple modeling and understanding of the relevant biophysical processes. As a result of the project, we formed self-assembled flagellin monolayers on hydrophobic surfaces. Molecular-level interactions were observed and surface adhesion forcees were measured using microbeads as a model system. The penetration of bacterial cells into mammalian cells was mimicked with nanoparticles and monitored in real-time to obtain kinetic information about the processes.
Full text https://www.otka-palyazat.hu/download.php?type=zarobeszamolo&projektid=126900
Decision
Yes





 

List of publications

 
Boglarka Kovacs, Andras Saftics, Attila Biro, Sandor Kurunczi, Balazs Szalontai, Balazs Kakasi, Ferenc Vonderviszt, Andras Der and Robert Horvath: Kinetics and Structure of Self-Assembled Flagellin Monolayers on Hydrophobic Surfaces in the Presence of Hofmeister Salts: Experimental Measurement of the Protein Interfa, J. Phys. Chem. C, 2018
Beatrix Peter, Istvan Lagzi, Satoshi Teraji, Hideyuki Nakanishi, Laszlo Cervenak, Daniel Zámbó, András Deák, Kinga Molnár, Monika Truszka, Inna Szekacs and Robert Horvath: Interaction of Positively Charged Gold Nanoparticles with Cancer Cells Monitored by an in Situ Label-Free Optical Biosensor and Transmission Electron Microscopy, ACS Appl. Mater. Interfaces, 2018
Beatrix Peter, Rita Ungai-Salanki, Bálint Szabó, Agoston G. Nagy, Inna Szekacs, Szilvia Bősze, and Robert Horvath: High-Resolution Adhesion Kinetics of EGCG-Exposed Tumor Cells on Biomimetic Interfaces: Comparative Monitoring of Cell Viability Using Label-Free Biosensor and Classic En, ACS Omega, 2018
Andras Saftics, György Aurél Prósz, Barbara Türk, Beatrix Peter, Sándor Kurunczi and Robert Horvath: In situ viscoelastic properties and chain conformations of heavily hydrated carboxymethyl dextran layers: a comparative study using OWLS and QCM-I chips coated with waveg, Scientific Reports, 2018
Tamás Gerecsei, István Erdődi, Beatrix Peter, Csaba Hős, Sándor Kurunczi, Imre Derényi, Bálint Szabó, Robert Horvath: Adhesion force measurements on functionalized microbeads: An in-depth comparison of computer controlled micropipette and fluidic force microscopy, Journal of Colloid and Interface Science, 2019
Ágoston G. Nagy, Judit Kámán, Róbert Horváth, Attila Bonyár: Spring constant and sensitivity calibration of FluidFM micropipette cantilevers for force spectroscopy measurements, Scientific Reports, 2019
Rita Ungai-Salánki, Beatrix Peter, Tamás Gerecsei, Norbert Orgovan, Robert Horvath, Bálint Szabó: A practical review on the measurement tools for cellular adhesion force, Advances in Colloid and Interface Science, 2019
Balint Kovacs, Robert Horvath: Modeling of label-free optical waveguide biosensors with surfaces covered partially by vertically homogeneous and inhomogeneous films, Journal of Sensors, 2019
Andras Saftics, Barbara Türk, Attila Sulyok, Norbert Nagy, Tamás Gerecsei, Inna Szekacs, Sándor Kurunczi, Robert Horvath: Biomimetic dextran-based hydrogel layers for cell micropatterning over large areas using the FluidFM BOT technology, Langmuir, 2019
Inna Székács, Paweł Tokarz, Robert Horvath, Krisztina Kovács, Adam Kubas, Mari Shimura, Justyna Brasun, Vadim Murzing, Wolfgang Caliebe, Zbigniew Szewczuk, Aneta Paluch, László Wojnárovits, Tünde Tóth, József S.Pap, Łukasz Szyrwiel: In vitro SOD-like activity of mono- and di-copper complexes with a phosphonate substituted SALAN-type ligand, Chemico-Biological Interactions, 2019
Tamás Visnovitz, Xabier Osteikoetxea, Barbara W. Sódar, Judith Mihály, Péter Lőrincz, Krisztina V. Vukman, Eszter Ágnes Tóth, Anna Koncz, Inna Székács, Robert Horváth, Zoltán Varga, Edit I. Buzás: An improved 96 well plate format lipid quantification assay for standardisation of experiments with extracellular vesicles, Journal of Extracellular Vesicles, 2019
M. Fábián, Zs. Kovács, J. L. Lábár, A. Sulyok, Z. E. Horváth, I. Székács, V. Kovács Kis: Network structure and thermal properties of bioactive (SiO2–CaO–Na2O–P2O5) glasses, Journal of Materials Science Ceramics, 2019
Beatrix Peter, Andras Saftics, Boglarka Kovacs, Sandor Kurunczi, Robert Horvath: Oxidization increases the binding of EGCG to serum albumin revealed by kinetic data from label-free optical biosensor with reference channel, Analyst, 2019





 

Events of the project

 
2019-04-26 10:27:56
Résztvevők változása




Back »