Investigation of arteriviruses with special regard to the genomic characteristics of local isolates  Page description

Help  Print 
Back »

 

Details of project

 
Identifier
62853
Type K
Principal investigator Rusvai, Miklós
Title in Hungarian Arterivírusok vizsgálata, különös tekintettel a hazai izolátumok genetikai tulajdonságaira
Title in English Investigation of arteriviruses with special regard to the genomic characteristics of local isolates
Keywords in Hungarian Arteriviridae, a ló fertőző arteritise, a sertés reprodukciós zavarokkal és légzőszervi tünetekkel járó szindrómája, EAV, EVA, PRRS, PRRSV, nukleinsav-vizsgálat
Keywords in English Arteriviridae, equine arteritis virus, porcine reproductive and respiratory syndrome virus, EAV, EVA, PRRS, PRRSV, genomic investigations
Discipline
Veterinary sciences (Council of Complex Environmental Sciences)100 %
Panel Plant and animal breeding
Department or equivalent Kórbonctani és Igazságügyi Állatorvostani Tanszék (Hungarian University of Agriculture and Life Sciences)
Participants Bakonyi, Tamás
Balka, Gyula
Hornyák, Ákos
Kecskeméti, Sándor
Kiss, István
Mándoki, Míra
Tapaszti, Zsuzsanna
Starting date 2006-02-01
Closing date 2010-01-31
Funding (in million HUF) 14.000
FTE (full time equivalent) 1.73
state closed project
Summary in Hungarian
A pályázat keretében a ló fertőző arteritise és a sertés reprodukciós zavarokkal és légzőszervi tünetekkel járó szindrómája előidézéséért felelős vírustörzsek (EAV illetve PRRSV) genetikai tulajdonságait kívánjuk vizsgálni. Mindkét kórokozó az Arteriviridae víruscsaládba tartozik.
Az EAV lázas tüneteket, az arteriagyulladás miatt érfalkárosodást, oedemaképződést és vemhes kancákban vetélést idézhet elő. A kórokozót kutatócsoportunk izolálta hazánkban először, széles körben elterjedt, és az első izolálás óta eltelt évek során számos, az ország különböző pontjairól és különböző mintákból (orrváladék, ondó, vetélt magzat) származó törzset gyűjtöttünk.
A PRRSV magzatkárosodással, koraelléssel és légzőszervi tünetekkel járó, gyorsan terjedő betegséget okoz. Világszerte előfordul, Magyarországon szintén jelen van. Ezt a vírust is kutatócsoportunknak sikerült először izolálnia hazánkban, és jelenleg több PRRSV izolátumot is őrzünk törzsgyűjteményünkben.
A vírusok genetikai tulajdonságainak alaposabb megismerését és különösen a hazai izolátumok genomjának tanulmányozását részben a már rendelkezésünkre álló, részben a továbbra is folytatni kívánt diagnosztikai munka során gyűjtött törzsek vizsgálatával tervezzük. A már eddig elvégzett vizsgálatok is számos jellegzetességet tártak fel a hazai törzseken mindkét vírus vonatkozásában, ezért a tervezett munka célja az EVA és a PRRS hazai helyzetének és a Magyarországon előforduló vírustörzsek tulajdonságainak tisztázása.
Summary
The research is aimed to investigate the genetic characteristics of the virus strains causing the equine viral arteritis and the porcine respiratory and reproduction syndrome (EAV and PRRSV respectively). Both viruses belong to the Arteriviridae family.
The EAV is causing fever, degeneration and enhanced permeability of the vascular wall consequently the characteristic symptoms are oedema and abortion in pregnant mares. In Hungary the pathogen was isolated first by our research group, and since that time several strains have been isolated from different samples (nasal discharge, semen, aborted foetus) from different parts of the country.
The PRRSV is causing a rapidly spreading disease characterised by foetopathy, abortion and respiratory symptoms. It is occurring all over the world and is present also in Hungary. This virus was also isolated first by our group, and presently we have a collection of several PRRSV strains.
The work is aimed to collect data on the genetic characteristics of the viruses, especially to investigate the genome of the Hungarian isolates using the strains collected up to now and during the diagnostic work planned to be continued. The investigations carried out so far revealed characteristic markers on the local isolates in the case of both viruses, therefore the aim of the work is the clarification of the epizootiological status of EVA and PRRS and the characteristics of the virus strains present in Hungary.





 

Final report

 
Results in Hungarian
Az elmúlt négy évben vizsgáltuk a két állategészségügyi szempontból fontos arterivírus, a sertések szaporodásbiológiai zavarokkal és légzőszervi tünetekkel járó tünetegyüttesét előidéző vírus (PRRSV) és a lovak fertőző arteritisét előidéző vírus (EAV) hazai elterjedtségét és megállapítottuk, hogy mindkét vírus hazai előfordulása elmarad a nyugat-európai országokban megfigyelttől. Mindkét vírusfertőzés diagnosztikájában kidolgoztuk és széleskörűen alkalmaztuk az RT-PCR alapú diagnosztikai módszert. Az amplifikációs termékek nukleotid-sorrendjének meghatározása után vizsgáltuk a két vírus filogenetikai viszonyait magyarországi és a környező országokból származó pozitív minták felhasználásával, továbbá összehasonlítottuk ezeket a nemzetközi génbankban elhelyezett szekvenciákkal is. A PriProET és Taqman technikára valamint valós idejű RT-PCR eljárásra alapozott módszerekkel a vírusfertőzések in vitro és in vivo zajló kinetikájáról tudtunk adatokat gyűjteni. Eredményeinket nyolc referált szakfolyóiratben megjelent vagy közlésre elfogadott közleményben és két PhD értekezésben közöltük illetve foglaltuk össze.
Results in English
In the four years of the study period the occurrence of the two arteriviruses of veterinary significance, the porcine reproduction and respiratory syndrome virus (PRRSV) and the equine arteritis virus has been investigated, and it was demonstrated, that the presence of both viruses is lower then in the Western European countries. An RT-PCR based diagnostic method has been developed and routinely applied in the diagnosis of both viral infections. After sequencing the amplicons the phylogenetic relationship of the viruses was investigated using positive samples collected in Hungary and in the neighbouring countries, and these were compared to sequences deposited in the GenBank. Data were collected on the in vitro and in vivo kinetics of the virus multiplication using methods based on PriProET and Taqman technique and real time RT-PCR methods. The results were published and summarised in eight articles published in peer reviewed periodicals and in two PhD theses.
Full text https://www.otka-palyazat.hu/download.php?type=zarobeszamolo&projektid=62853
Decision
Yes





 

List of publications

 
Balka, Gy., Rusvai, M., Kecskeméti, S., Kiss, I: PRRS – újabb kihívás előtt a sertéságazat 1. A vírus sajátosságai, Magyar Állatorvosok Lapja, 128. 524-532., 2006
Balka, Gy., Rusvai, M., Kecskeméti, S., Kiss, I: PRRS - újabb kihívás előtt a sertéságazat. 2. A betegség járványtani, kórtani és immunológiai sajátosságai., Magyar Állatorvosok Lapja, 130, 31-38., 2008
Balka, Gy.,: A PRRS diagnosztikájának javítása, a magyarországi járványtani helyzet felmérése és az itthon előforduló törzsek genetikai tulajdonságainak vizsgálata, Magyar Állatorvosok Lapja, 131. 655-656, 2009
Balka, Gy., Hornyák, Á., Bálint, Á., Kiss, I., Kecskeméti, S., Bakonyi, T., Rusvai M.: Genetic diversity of porcine reproductive and respiratory syndrome virus strains circulating in Hungarian swine herds., Veterinary Microbiology, 127, 128-135, 2008
Gy. Balka, Á. Hornyák, Á. Bálint, Zs. Benyeda, M. Rusvai:: Development of a one-step real-time quantitative PCR assay based on primer-probe energy transfer for the detection of porcine reproductive and respiratory syndrome virus., Journal of Virological Methods, közlésre elfogadva, 2010
Gy. Balka, Á. Hornyák, Á. Dán, A. Ladinig, I. Biksi, M. Rusvai: PriProET based melting point analyses on PRRSV positive field samples., Molecular and Cellular Probes, közlésre elfogadva, 2010
Stollár Katalin, Pálfi Vilmos, Hornyák Ákos, Bakonyi Tamás, Rusvai Miklós: A ló fertőző arteritise elleni védekezés hatása a szeropozitivitás és a vírusürítő fedezőméek előfordulására, Magyar Állatorvosok Lapja, közlésre elfogadva, 2010
Á. Hornyák, T. Bakonyi, Gy. Balka, N. Nowotny, Z. Demeter, C. Prohaska, M. Rusvai: Development of Genomic and Subgenomic (sg) TaqMan Real Time RT-PCR Assay for Detection and Quantification of Equine Arteritis Virus (EAV)., Journal of General Virology, közlésre elküldve, 2010
Hornyák Ákos: A vírusos lóarteritis hazai elterjedtségének és a vírus genetikai állományának vizsgálata, Szent István Egyetm Állatorvos-tudományi Kar, Központi Könyvtár, 2006
Balka Gyula: A PRRS diagnosztikájának javítása, a magyarországi járványtani helyzet felmérése és az itthon előforduló törzsek genetikai tulajdonságainak vizsgálata, Szent István Egyetm Állatorvos-tudományi Kar, Központi Könyvtár, 2009




Back »